Latitudinal diversity gradients and selective microbialexchange at the Atlantic ocean-air interface
该研究通过跨越北大西洋 14,400 公里的采样，揭示了海洋与大气界面微生物群落存在显著的纬度多样性梯度及谱系选择性交换机制，表明尽管大部分微生物谱系局限于单一环境，但陆地气团影响了这两个界面的群落结构，且空气微生物在更大地理尺度上表现出更高的多样性。
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microbiology
816 篇论文
Alkaline phosphatase activity supports heterotrophic carbon acquisition in a coastal time series site and a representative marine bacterium
这项研究通过年度现场观测和细菌培养实验发现，即使在磷酸盐充足的情况下，海洋细菌仍能通过碱性磷酸酶活性利用溶解有机磷，表明该酶不仅用于获取磷，更是细菌应对碳限制并获取有机碳的一种通用应激机制。
Virulence studies of the human gut pathobiont Bilophila wadsworthia using Galleria mellonella as model host
该研究利用蜡螟幼虫模型证实，人类肠道致病菌*Bilophila wadsworthia*仅在进入循环系统（而非肠道定植）时才会引发明显疾病，其致病机制涉及在血细胞内的胞内复制及与宿主免疫动态的紧密耦合，从而确立了蜡螟作为研究该菌毒力及宿主互作的实用模型。
First Metagenome-Assembled Genomes from the Historic Morrow Plots Reveal Management-Associated Dominance of Archaeal Ammonia Oxidizers
这项研究利用美国莫罗长期试验田第 149 年的样本，通过宏基因组组装获得了 230 个微生物基因组（包括 44 个古菌和 186 个细菌），揭示了不同农业管理措施如何驱动氨氧化古菌等氮循环微生物的群落演替与功能多样性，为理解长期耕作对土壤健康及产量的影响提供了基因组层面的基准资源。
Bacteriophage utilize pseudolysogeny to target non-replicating bacteria and CRISPR-resistant phages eliminate recalcitrant implant infections
该研究证实裂解性噬菌体可通过伪溶原化状态感染并潜伏于非复制细菌中，待细菌复苏后恢复裂解，且 CRISPR 抗性噬菌体能有效清除小鼠体内由非复制细菌引起的植入物相关顽固感染，为治疗耐药性持久性感染提供了新策略。
Intrinsic features of the RNase E membrane targeting sequence specify RNA degradosome organisation and activity
该研究揭示了铜绿假单胞菌 RNase E 膜靶向序列（MTS）通过调控 RNA 降解体的空间组织、动态特性及底物选择，进而影响细菌在高盐胁迫下的生存能力及其致病性。
Complete Genomes of Cultivated Gut Bacteria Reveal Mobile Genetic Element-Driven Functional Diversity with Therapeutic Implications
该研究构建了包含 1,150 个完整环状人类肠道细菌基因组的 CCGR 资源库，揭示了移动遗传元件（如噬菌体和质粒）通过特定整合位点及携带功能基因（如 *scrK*）驱动菌株水平功能多样性，并阐明了其在缓解饮食诱导性结肠炎中的治疗潜力。
ExocubeBio: an in-situ fluidic platform for microbial exposure on the International Space Station
本文介绍了计划于 2027 年搭载欧洲航天局 Exobio 设施部署在国际空间站外部的 ExocubeBio 微型流体平台的开发与硬件验证，该平台旨在通过结合原位光学监测与样本返回能力，实现对微生物在低地球轨道环境下的暴露实验。
Functional and transcriptomic analyses in Neurospora crassa reveal the crucial role of N-glycoprotein deglycosylation process in fungal homeostasis.
该研究通过功能与转录组分析揭示，在缺乏具有催化活性的酸性 PNGase 的情况下，粗糙脉孢菌（*Neurospora crassa*）依赖细胞质 GH18 家族内切糖苷酶（ENGase）执行 N-糖蛋白去糖基化，从而维持细胞稳态并应对多种胁迫。
A Myb-dominated gene regulatory network universally controls sexual cell fate transitions in diatoms
该研究利用单细胞转录组学和转基因报告系，揭示了一个由 Myb 转录因子主导的基因调控网络普遍控制着硅藻的配子分化、核融合及 auxospore 显著扩大的性细胞命运转变机制。
Intracellular carbon storage enables starvation survival in marine bacteria
该研究揭示了聚羟基丁酸酯（PHB）颗粒作为胞内碳储存库，在海洋细菌（如 *Phaeobacter inhibens*）应对碳源波动和长期饥饿胁迫中发挥关键生存作用，并指出这是玫瑰杆菌类群中一种保守但非唯一的适应策略。
Lipid metabolic pathways determine phage infectivity in Mycobacterium abscessus
该研究揭示*Mycobacterium abscessus*的噬菌体易感性主要由宿主细胞壁脂质代谢途径决定，而非单一受体，并发现平滑型与粗糙型菌株在噬菌体抗性演化中表现出不同的遗传机制，这为开发更持久的噬菌体疗法提供了新靶点。
Characterization of emerging Oropouche virus tropism and pathogenicity.
这项研究证实奥罗波切病毒具有广泛的人类细胞嗜性，能够在不破坏血脑屏障完整性的情况下穿越屏障，并导致神经细胞（尤其是神经元）出现显著的细胞病变和数量减少，从而揭示了其神经侵袭机制。
Lysosomal activation in bladder epithelium enhances intracellular antibiotic clearance of uropathogenic Escherichia coli
该研究发现，临床药物 OM-89 通过激活膀胱上皮细胞的溶酶体功能（促进酸化及蛋白酶活性），增强其对抗生素的协同作用，从而有效清除胞内尿路致病性大肠杆菌并降低复发率。
SARS-CoV-2 Defective Viral Genomes from Distinct Genomic Regions Drive Divergent Interferon Responses
该研究揭示 SARS-CoV-2 缺陷病毒基因组（DVGs）源自不同基因组热点区域（A 和 B）会引发截然不同的干扰素反应，其中源自热点 B 的 DVGs 能显著诱导强干扰素应答并抑制野生型病毒复制，从而可能影响疾病的病理进程。
Syndromic cholera diagnosis masks diverse causes of diarrhoeal disease in Burundi revealed by portable metagenomics
该研究通过在布隆迪部署便携式离线宏基因组测序技术，揭示了基于综合征的霍乱诊断掩盖了腹泻疾病的多样化病因（如大肠杆菌），并证明了该方法能在资源有限的环境中快速实现病原体鉴定与耐药性监测，从而弥补传统诊断的不足。
Metabolic flexibility and an unusual route for peptidoglycan muramic acid recycling in mycobacteria
该研究发现结核分枝杆菌和耻垢分枝杆菌在缺乏假单胞菌型回收机制的情况下，仍能通过一种涉及 N-乙酰葡糖胺但不涉及葡萄糖胺中间体的新型非典型途径，将 2-修饰的 N-乙酰胞壁酸整合入肽聚糖，揭示了分枝杆菌细胞壁代谢的惊人灵活性。
Examining the impact of the Chlamydia muridarum-induced synthesis of IFN-β during genital tract infection
该研究证实，在沙眼衣原体（C. muridarum）生殖道感染中，IFN-β 作为上皮细胞内在的关键防御介质，通过 TLR3-IFN-β 信号轴抑制细菌复制并调控免疫反应，从而阐明了 I 型干扰素亚型在宿主防御与免疫病理中的非均质性作用。
Strain level variation in Proteus mirabilis chondroitin sulfate degradation kinetics and regulation by urea
该研究揭示了变形杆菌（Proteus mirabilis）不同菌株在降解膀胱保护性糖胺聚糖（硫酸软骨素）的动力学与调控机制上存在显著差异，特别是发现脲酶活性介导的尿素抑制作用会削弱特定菌株的降解能力，进而降低其在小鼠导管相关尿路感染模型中的毒力。
ZeaMiC: a Publicly Available Culture Collection of Maize Root-Associated Bacteria
该研究介绍了 ZeaMiC，这是一个基于玉米根际微生物丰度与系统发育特征筛选出的、包含 88 株代表性细菌的公开培养物集合，旨在通过全基因组测序揭示其促生与生态功能，为深入解析植物 - 微生物互作机制提供关键资源。