A scalable genomic framework for programmable strain tagging in a diverse bacterial genus

该研究开发了一种适用于广泛植物相关细菌属*鞘氨醇单胞菌*的可扩展基因组框架,通过利用 CRISPR 关联转座子(CASTs)靶向鉴定并验证新的保守中性插入位点,结合新型快速转座子作图方法(tagIMseq)有效筛选无脱靶突变,从而实现了对遗传多样性菌株的精准标记与定量追踪,加速了用于研究细菌自然变异的高通量合成群落构建。

Mehmetoglu Boz, E., Barajas, H. R., Yu, T.-T. + 6 more2026-04-04🦠 microbiology

Systematic Validation of AlphaFold-Predicted Interactomes with LUCIA

该研究开发了名为 LUCIA 的高通量无细胞生化筛选平台,通过大规模验证 AlphaFold 预测的疱疹病毒蛋白互作,确立了 ipTM 分数≥0.80 作为高置信度相互作用的阈值,并成功利用结构引导突变证实了 UL42-UL8 互作对病毒复制的关键作用,从而实现了从计算预测到实验验证的快速转化。

Zhang, T., Kraft, J., Soh, T. K. + 3 more2026-04-04🦠 microbiology

Population-level genome sequencing reveals distinct Mycobacterium tuberculosis intrahost mutational trajectories in simian immunodeficiency virus co-infected and antiretroviral treated non-human primates

该研究通过对 20 只非人灵长类动物(包括 SIV 感染及接受抗逆转录病毒治疗者)体内约 480 个感染组织的结核分枝杆菌进行群体基因组测序,揭示了不同免疫状态下细菌的突变轨迹差异、传播动态及脂质代谢基因的共同突变模式,并发现部分突变在人类临床菌株中独立出现。

Chao, M. C., Chase, M. R., Wakabayashi, S. + 11 more2026-04-04🦠 microbiology

DETECTION OF BIOSYNTHETIC GENE CLUSTERS FROM METAGENOME OF NATURAL HONEY COLLECTED IN VIETNAM

该研究通过宏基因组学分析揭示了越南西北部采集的中华蜂蜜中微生物群落的丰富生物合成基因簇多样性,发现超过 83% 的基因簇具有高度新颖性,并鉴定出一种源自 Atlantibacter hermannii 的潜在强效抗菌唑类 RiPP 基因簇,证实了该蜂蜜微生物组是开发新型抗菌药物的未开发宝库。

Nguyen, H.-N., Kim, O. T. P., Tran, T. T.2026-04-04🦠 microbiology

SpoT-mediated reduction of (p)ppGpp levels promotes Ralstonia pseudosolanacearum adaptation to both plant xylem and legume nodules

该研究揭示,通过SpoT介导的(p)ppGpp水平降低,能够优化细菌对多种碳氮源的利用并提升生长速率,从而促进植物病原菌Ralstonia pseudosolanacearum在不损害其致病力的前提下,成功适应植物木质部及豆科植物根瘤这两种截然不同的宿主环境。

Burkhardt, N., Tang, M., Legrand, L. + 5 more2026-04-04🦠 microbiology

The Impact of Arachis Hypogaea Diet on Malaria Parasite Resistance and Haematology in Mice Infected with Plasmodium berghei

该研究表明,尽管烤花生饮食在降低疟原虫负荷和改善红细胞压积方面显示出一定的缓解作用,但花生(Arachis hypogaea)的各种饮食形式对感染伯氏疟原虫小鼠的寄生虫载量和血液学指标均未产生统计学上的显著改善,提示其在疟疾治疗中的价值有限。

Okeke, O., Aniekwe, G., Ndinyelum, O. + 7 more2026-04-04🦠 microbiology

Repurposing anti-phage defenses to differentially arrest the viral lifecycle reveals the regulatory logic of a parasitic satellite

该研究通过引入 BREX 和 DarTG 等独立抗噬菌体防御系统作为分子路障,揭示了霍乱弧菌噬菌体卫星 PLE 的激活依赖于噬菌体 ICP1 转录级联反应的渐进式进展而非基因组复制,从而阐明了一种确保 PLE 稳健激活并抵御噬菌体逃逸的多重许可调控机制。

Bagdatli, S. T., Seed, K.2026-04-04🦠 microbiology

Breaking the:"one nucleus, one whole genome" rule: Neurospora crassa separates its haploid chromosomes into different nuclei

该研究打破了“一个细胞核包含一套完整单倍体基因组”的传统认知,发现模式真菌粗糙脉孢菌(*Neurospora crassa*)也能将单倍体染色体不均等地分配至不同细胞核中,表明这一现象不仅限于病原真菌,可能广泛存在于真菌界并促进其进化适应。

Tan, J., Xu, Y., Yang, P. + 4 more2026-04-03🦠 microbiology

Proteomic stress response by a novel methanogen enriched from the Great Salt Lake

本研究从盐度创历史新高的美国大盐湖中富集并鉴定了一种新型产甲烷古菌(拟命名为 Candidatus Methanohalophilus hillemani),发现其在面对高盐或氧气胁迫时并未上调能量守恒或耐渗透压蛋白,而是优先响应硫酸盐还原菌以增强金属摄取和免疫功能,且该菌在岸滩土壤的高甲烷通量环境中活跃存在,证实了其对大盐湖甲烷排放的贡献。

Christian, W. C., Jay, Z., Tolic, N. + 5 more2026-04-03🦠 microbiology