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微生物学探索着肉眼看不见的生命世界，从维持人体健康的肠道菌群到影响全球气候的海洋细菌，这些微小生命体塑造着地球运转的基石。在这里，我们聚焦于这一充满活力的领域，致力于揭示微观生命如何驱动宏观变化，让复杂的科学发现变得触手可及。
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本研究报告了从肯尼亚沿海地区埃及果蝠（*Rousettus aegyptiacus*）中分离并部分表征出的两种新型且亲缘关系密切的α-疱疹病毒株，这些病毒株与灵长类α-疱疹病毒具有系统发育上的接近性，值得对其潜在的动物源性进行进一步研究。
本研究利用空间转录组学揭示了在莱姆氏关节炎小鼠模型中，关节微环境决定了独特的、具有区域特异性的免疫特征和成纤维细胞表型，且这些特征从感染高峰期的促炎状态演变为抗生素治疗后的消退状态。
本研究表明，由SOS介导的噬菌体诱导作用充当了一个进化瓶颈，通过消除具有强烈SOS反应的宿主，限制了对DNA损伤类抗生素耐药突变的频率，从而筛选出能够减弱SOS途径的更罕见、高效应的突变，并最终导致更高水平的耐药性。
这项研究表明，在婴儿肠道发育过程中获得的 Stickland 代谢细菌（例如艰难梭菌）通过竞争共享的氨基酸依赖型营养生态位，从而赋予了对肉毒梭菌感染的抵抗力。
通过对 Lifelines NEXT 队列中 1,110 份纵向样本应用全面的双重方法谱分析，本研究揭示了动态婴儿肠道病毒组受宿主因素和温和噬菌体生命周期转换的塑造，并发现诱导型温和噬菌体与出生后第一年湿疹的发展之间存在特定关联。
本文提出了两种新型的基于堆叠（stacking）的混合集成模型（EM1和EM2），这些模型通过整合多种机器学习算法，与传统的单算法和深度学习方法相比，显著提高了预测肠道微生物组相关疾病的准确性和鲁棒性。
本研究表征了牙买加果蝠对一种新型野生型 Tacaribe 病毒分离株 (DOM2014) 的发病机制和宿主反应，揭示了一种伴有轻度肝脏疾病和有限适应性免疫的非致死性持续感染，从而建立了一个比历史上使用的经小鼠传代的 TRVL-11573 毒株更具生物学相关性的宿主模型。
本文介绍了 FRAPPPE，这是一种基于机器学习的工作流，通过 通量比分析来揭示肠道拟杆菌门（Bacteroidota）与大肠杆菌（Escherichia coli）之间在中心碳代谢和核苷酸共代谢方面的显著代谢差异。
本研究阐明了埃希氏大肠杆菌如何通过涉及 PatA、GabT 和 IlvE 不同底物特异性的分支转氨作用网络，将膳食来源的高级糖基化终产物 Nε-羧甲基赖氨酸 (CML) 整合进氮代谢中，从而将 CML 及其脱羧代谢物转化为新型中间体。
这项研究通过在多样化的澳大利亚宿主和环境中发现十种全新的、高度分化的萨斯鲁病毒（Sarthroviridae）物种，扩大了已知萨斯鲁病毒科的多样性和宿主范围，揭示了更广泛的生态分布、多个截然不同的谱系以及潜在的替代复制策略。