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微生物学探索着肉眼看不见的生命世界，从维持人体健康的肠道菌群到影响全球气候的海洋细菌，这些微小生命体塑造着地球运转的基石。在这里，我们聚焦于这一充满活力的领域，致力于揭示微观生命如何驱动宏观变化，让复杂的科学发现变得触手可及。
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本研究将独立成分分析（ICA）应用于大规模的大肠杆菌（*Escherichia coli*）TraDIS-Xpress 适应度数据集，旨在将复杂的基因型-表型关系分解为不同的功能与表达模块（fxModules），从而实现对已知抗性机制的准确且不依赖于注释的识别，并在多种压力条件下发现新的基因关联。
本研究建立了一个基于 RNA-FISH 的筛选平台，用于系统地优化完整革兰氏阴性细菌内的 DNA-PAINT 图像器-对接对，从而实现对细菌结构和 RNA 集簇的高质量、多重 3D 超分辨率成像。
一项针对 HELIUS 多民族队列进行的为期六年的纵向研究表明，尽管肠道微生物群组成会发生一定的随时间变化的改变，但在共同的城市环境中，不同民族在微生物组成和功能能力方面仍存在显著差异，且这些差异的预计半衰期约为二十年。
这项研究揭示了在对数生长期的环境下，蛋白质 Crl 以一种环境特异性的双向方式，同时调节大肠杆菌中依赖于 RpoS 和非依赖于 RpoS 的基因转录，从而将对 Crl 调节机制的理解从稳定期扩展到了更广泛的领域。
本研究表明，金黄色葡萄球菌（*Staphylococcus aureus*）VII型分泌系统（T7SSb），特别是通过其效应因子EsxA和EsxC，通过抑制钙信号传导并调节氧化应激，从而延迟炎症性巨噬细胞死亡（坏死性凋亡和焦亡），进而增强细菌存活能力，并在细胞和鼠类模型中改变感染结局。
本研究表明，针对废水中丰富的核糖体RNA和植物感染性烟草病毒进行靶向去除，能显著降低背景噪音，从而实现对原本无法检测到的低丰度人类及动物病原体的检测。
本研究确定抗癌药物克洛法拉宾是一种强效的抗毒力剂，它通过破坏 ATP 依赖性翻译来抑制肠道病原体的生长和 III 型分泌系统，该机制可被细菌酶促切割所抵消，并伴随有对人类单核细胞中蛋白质翻译的一种未表征的抑制作用。
本研究表明，必需的脂蛋白成熟酶 Lgt 对于维持幽门螺杆菌（*Helicobacter pylori*）的膜和鞭毛完整性至关重要，同时也揭示了该细菌的异质群体能够通过多样化的遗传和表观遗传适应来恢复运动性和生存能力，从而在 Lgt 缺失的情况下存活下来。
通过将分离株基因组与深度长读段宏基因组学相结合，本研究揭示了低多样性的乳制品发酵剂微生物组蕴含着广泛的隐藏种群复杂性，以及在发酵特性和噬菌体防御机制方面的组合多样性，而这两种方法单独使用都无法完全捕获。
本研究建立了一种用于 *Jeongeupia sacculi* HS-3 遗传操作的同源重组方法，并证明了敲除 *rpoS* 基因仅在低营养条件下特异性地损害生物膜形成，而不会广泛影响一般应激生存。