🧬 生物学
Integrated Plasmodium falciparum Transcriptomics Reveals Coordinated Stress Adaptation and Metabolic Remodeling in Severe Malarial Anemia
这项研究揭示了导致重症疟疾贫血儿童体内的恶性疟原虫表现出独特的转录图谱，其特征在于协调的应激适应、代谢重塑和增强的蛋白质稳态，这些特征共同使其区别于引起非重症疟疾的疟原虫。
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q-bio
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🧬 生物学
Differential regulation of the Saccharomyces cerevisiae iron regulon by the nonsense- mediated mRNA decay pathway under iron scarcity
本研究表明，无义介导的 mRNA 降解（NMD）途径差异化地调节酿酒酵母（*Saccharomyces cerevisiae*）的铁调节子，包括转录因子 Aft1/Aft2 及其下游还原酶靶标，从而在缺铁条件下控制细胞内铁的积累和生长。
🧬 生物学
A Two-Population Delayed Evolutionary Game with Bayesian Learning for Cyber Defense
本文提出了一种结合贝叶斯学习的双群体延迟演化博弈模型，旨在分析检测延迟、修复延迟、传感器覆盖范围以及学习速度如何相互作用从而诱发霍普夫分岔（Hopf bifurcations）和循环往复的网络攻击周期，并通过对微软 GUIDE 数据集的实证校准表明，聚合遥测技术和适度的修复滞后可以显著延长可容忍的检测延迟阈值。
🧬 生物学
Lifespan prediction in protostomes from trinucleotide composition
本研究表明，一种利用保守基因组区域内三核苷酸组成的相对频率及观测值与预期值比率的机器学习模型，能够准确预测多种原口动物物种的寿命，其表现优于基于系统发育和基因组大小的预测模型，并展示了跨分类群适用的潜力。
🧬 生物学
Host genotype and macro-chromosomal inversions influence gene expression and microbiome assembly in a complex holobiont
这项研究表明，在海鞘 *Styela plicata* 中，大染色体倒位通过驱动全基因组范围内的基因表达转变并影响特定且具有功能相关性的微生物类群的组装，起到了全共生体适应的关键调节作用。
🧬 生物学
A Proteome-Wide, Accelerated Deep Learning Framework for Structural Interactome Docking, Polygenic Disease Network Translation and Automated Druggability Assessment
本文提出了一种由人工智能驱动的高性能计算框架，该框架利用全蛋白质组结构预测和深度学习对接技术，在 460 块 NVIDIA H100 GPU 上实现了快速绘制人类结构相互作用组、整合心血管多基因疾病网络并评估药物可靶性的功能，成功识别并回顾性验证了数十万个新型治疗性蛋白质-蛋白质相互作用。
🧬 生物学
EZPro-Fit: A Thermophile-Informed Cross-Modal Generative Framework Integrating DNA Language and Protein Structure for Enzyme Mutant Design
EZPro-Fit 是一种新颖的跨模态生成框架，它整合了蛋白质结构数据、DNA 序列以及嗜热分类学信息，用于设计宿主适应性且热稳定的酶变体，并在实验验证中成功展示了熔解温度和催化活性的提升。
🧬 生物学
Assessing non-invasive glymphatic MRI markers following short-term sleep loss
通过使用大型国际数据集，本研究表明常见的非侵入性 MRI 标志物反映的是不同的生理过程，而非一个统一的胶质淋巴系统，从而揭示了短期睡眠不足主要通过睡眠依赖性的血管周围间隙体积调节来改变大脑流体动力学。
🧬 生物学
A minimal pangenome graph for Salminus brasiliensis,a freshwater migratory Neotropical flagship species: it takes two to tango
本研究展示了两个高质量的染色体水平共识基因组以及一个针对新热带迁徙鱼类 *Salminus brasiliensis* 的极小参考泛基因组图谱，为支持保护、渔业管理和进化研究提供了全面的基因组框架。
🧬 生物学
Emergent locomotion from anatomy alone: a whole-connectome, conductance-based neuromechanical model of Caenorhabditis elegans
这项研究表明，仅凭电子显微镜连接组数据和基于电导的神经元参数构建的线虫（*C. elegans*）全动物神经力学模型，在无需任何训练的情况下，成功重现了线虫的自然运动及其对遗传扰动的鲁棒性，同时强调了肽类神经调节增益控制对于实现定量生物学真实性的必要性。