🧬 biology

A Two-step Feature Selection Framework for Computationally Efficient Machine Learning on Genome-wide SNP Data

本文提出了一种结合基于方差的硬过滤与 XGBoost 的两步特征选择框架,旨在将 6100 万个 SNP 减少到一个计算上可处理的子集,从而在无需高昂资源需求的情况下,实现大规模基因组数据集上高效的基于机器学习的地理起源预测。

Jinhyun Kim, Seungjun Lee, Daewon Lee, Seo Woo Song, Cheolheon Park, Huiran Yeom2026-08-30
🧬 biology

Preclinical evaluation of a novel multiplex ddPCR assay for detecting tetracycline resistance and differentiating Ureaplasma species

本研究开发并验证了一种高灵敏度、高特异性且具有重复性的多重ddPCR检测方法,该方法能够同时定量四环素耐药基因(tetM和int-Tn)并区分解脲脲游胞菌(Ureaplasma urealyticum)与小脲游胞菌(Ureaplasma parvum),旨在为优化临床治疗策略提供指导。

Lihong Zhao, Yuanyuan Jiang, Yulong Zong, Ruiying Li, Hui Zhang, Jin Wang, Zhe Li2026-08-29
🧬 biology

Locus-resolved reconstruction of the pig UGT family reveals an isoform-collapse artifact in frozen ESM-2 retrieval

本研究通过重建猪 UGT 基因家族发现,虽然冻结的 ESM-2 嵌入能够提高特定蛋白质异构体的排序性能,但一旦将评估标准统一至位点层面,它们在回收额外基因方面的表现并不优于传统的序列搜索方法,从而揭示了以往基准测试中存在的异构体分辨率伪影。

Xiaotong Zhao¹, Hua Chang², Zhuoyu Zhao¹, Xun Xiang¹2026-08-29
🧬 biology

Balancing Protein Expression and Minicell Yield in E. coliNissle 1917 via RBS Engineering

本研究表明,通过工程化改造大肠杆菌 Nissle 1917 微小细胞(minicells)中的核糖体结合位点(RBS)强度,可以实现重组蛋白表达水平与微小细胞产量之间的精确平衡,并揭示了虽然高表达会因代谢负担而降低产量,但微小细胞能为维持蛋白质溶解度提供更优越的环境。

Yao Ruan, Honglei Xie, Yan Niu, Tian Liu, Xi Shen, Mingxia Zhang, Shengping Lei, Jun Yu2026-08-29
🧬 biology

In-depth characterization of the DNA methylation aging landscape links epigenetic noise and genotype-specific epigenetic aging to inflammaging

本研究利用深度学习将超过 800,000 个 CpG 位点分类为十种不同的 DNA 甲基化衰老模式,揭示了基因型特异性甲基化介导炎症性疾病,而由免疫细胞变异和细胞类型无关因素共同驱动的年龄依赖性表观遗传噪声则与炎性衰老及死亡率相关。

Zhaozhen Du, Qi Luo, Xiaolong Guo, Qianqian Peng, Zhipeng Li, Deshuang Huang, Ritambhara Singh, Sijia Wang, Riccardo Mar (…)2026-08-29
🧬 biology

Luteolin antagonises human 5-HT3A receptor function through a non-competitive and voltage-independent mechanism

本研究表明,天然存在的黄酮类化合物木犀草素通过涉及特定残基I66和W178的非竞争性、电压无关机制,强效且可逆地抑制人类5-HT3A受体功能,这表明其具有作为开发新型受体拮抗剂支架的潜力。

Jeongyeon Yun, Jaehui Yang, Myungmi Moon, Yejin Kim, Hye Duck Yeom, Virginia Njoki Kamau, Mee-Hyun Lee, Gihyun Lee, Junh (…)2026-08-29