q-bio 篇论文 | Gist.Science

作者们介绍了 Foldseek-Interface，这是一种在相互作用组规模上对蛋白质相互作用界面进行聚类的极高效方法，它揭示了大量此前未被表征的结合模式多样性，并为探索界面演化和病原体模拟提供了一个免费开放的资源。

本研究表明，马雷马纳牛在产后热暴露对产犊间隔的影响方面表现出显著的基因型与环境相互作用，揭示了生殖鲁棒性的遗传变异，并确定了与基础生育力和热敏感性相关的特定基因组区域。

本研究利用流式细胞术表征了八种鼠尾草属（*Stemodia*）物种的基因组大小变异，揭示了核 DNA 含量、倍性水平、形态特征以及环境梯度之间的显著相关性，同时为恢复将 *S. ericifolia* 重新归类为 *Chodaphyton ericifolium* 提供了细胞遗传学证据。

本研究通过对来自印度果阿邦一处矿区的两种耐砷细菌分离株——克罗斯葡萄球菌（*Staphylococcus kloosii*，My2）和白色芽孢杆菌（*Bacillus albus*，My6）进行表征，展示了它们的生理适应性、在砷胁迫下的特定生长动力学以及在生物修复应用中的潜力。

本研究介绍了一种功能性免疫肽组学平台，该平台通过从单个临床样本中分离受体结合肽，以区分肿瘤特异性抗原与被动 HLA 配体，揭示了 HLA-I 与 HLA-II 呈递之间不同的调节机制，并确定了肾细胞癌免疫治疗的高优先级靶点。

本文介绍了 ASR-XGBoost，这是一个将自适应空间正则化与异常修正集成到 XGBoost 中的新颖框架，旨在克服标签偏差和空间独立性假设，从而在利用仅有出现（presence-only）的监测数据预测基孔威肯热风险时，实现卓越的校准性能和空间连续性。

本研究表明，将低覆盖度靶向捕获测序与基于500个样本的参考面板进行基因型填充以及优化的深度过滤相结合，为牛育种提供了一种比传统SNP芯片基因分型更具成本效益、灵活性且高度准确的替代方案。

这项针对小鼠三阴性乳腺癌（TNBC）模型的阶段解析转录组学研究表明，广泛的分子改变在肿瘤细胞接种后数日内便已发生，这些改变由中间生长阶段之间的一个关键转变所驱动，并在很大程度上反映了在培养癌细胞中并不存在的肿瘤微环境程序。

本研究表明，由于存在显著的环境和物种差异，基于猪骨的干骨评分法不足以适用于南非人类埋葬埋藏学，因此有必要开发修正后的标准，以准确解释人类骸骨遗骸。

通过整合 147 份野生柄折茅（*Saccharum spontaneum*）种质资源的表型评估、群体遗传学、全基因组关联研究（GWAS）以及转录组图谱分析，本研究阐明了调控开花变异的遗传基础和协同生物学过程，为进化研究和甘蔗育种提供了宝贵的基因组资源。