q-bio 篇论文 | Gist.Science

该论文介绍了 CAPRA，这是一种新型的响应锚定模型，通过结合对照状态、基因嵌入和学习到的修正项来预测单细胞对遗传扰动的转录响应，从而在单基因和双基因任务中均比现有方法实现了更高的准确性和可解释性。

本研究展示了首个完整的红毛丹（*Nephelium lappaceum*）线粒体基因组组装及全面的比较分析，揭示了其结构特征、RNA 编辑模式以及在无患果科内的进化关系，旨在为未来的功能与系统发育研究提供基础资源。

这项研究揭示了畸翅病毒感染蜜蜂会使葡萄糖碳流向氧化戊糖磷酸途径以产生 NADPH，进而为保幼激素的生物合成提供动力并驱动早熟的行为成熟，从而建立了一个将应激诱导的代谢重编程与行为结果联系起来的保守代谢—氧化还原—内分泌轴。

通过对超过 22,000 种细菌隐花色素/光修复酶蛋白进行大规模计算机模拟筛选，研究人员鉴定出一种嗜热候选蛋白 A0A6M1RS91，该蛋白拥有扩展的黄素-色氨酸电子传递网络，使其成为研究自由基对光化学和磁场敏感性的一个极具前景的新靶点。

这项研究表明，Fas–FADD–caspase-8 轴是决定癌细胞对细胞毒性淋巴细胞介导的杀伤敏感性的关键的、癌细胞内源性的因素，其机制超出了经典的执行者 caspase 依赖性凋亡途径。

这项研究揭示了染色质重塑因子 BPTF 在转录水平上激活 FAM155B，进而通过上调 SREBP1 介导的脂肪酸代谢重编程，驱动乳腺癌的进展和对紫杉醇的耐药性。

本研究通过重建数千种 H5N1 病毒中血凝素 (HA) 表型性状的演化过程，旨在证明是现有的表型宽度而非简单的阶梯式突变，使病毒能够快速多样化并适应如奶牛等新宿主，从而为优先筛选跨宿主变异体提供一个可扩展的框架。

这项研究揭示了冷诱导RNA结合蛋白的长异构体（CIRBP-L）通过直接结合并增强DCLK1-L mRNA的翻译，进而通过抑制GSK3β–HDAC6轴来稳定微管，从而抑制乳腺癌转移。

本研究表明，由广泛的渗入和地理屏障所驱动的鼠李艾蜥基因组内物种树的极端不稳定性，挑战了推断单一进化历史的可行性，并支持将鼠李艾蜥复合体（*Sceloporus graciosus* complex）内的多个不同物种予以识别。

本研究表明，DNA聚合酶β中dRP裂解酶活性的缺失通过破坏活性氧（ROS）-抗氧化轴，导致代谢失调和氧化应激增加，从而损害线粒体DNA的完整性和电子传递链功能。