HIDDENdb: Co-dependency database reveals a plethora of genetic and protein interactions
本文介绍了 HIDDENdb 数据库，该资源通过整合大规模扰动筛选、多组学数据及 curated 交互库，系统性地构建了遗传与蛋白质共依赖关系图谱，揭示了基因模块间的共享依赖模式及其与蛋白质结构相互作用的潜在联系，并提供交互式网络探索功能。
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110 篇论文
Preservation Constraints on aDNA Information Generation and the HSF Posterior Sourcing Framework: A First-Principles Critique of Conventional Methods
该论文通过第一性原理分析揭示了古 DNA 保存的复杂性并批判了传统二分类方法的偏差，进而提出了 HSF 后验溯源框架，通过以片段为基本单位、最大化来源多样性及结合保存特征评估，显著提升了混合信号样本中古 DNA 的真实性鉴定与来源判别能力。
Enhancing Morpho-Kinematic analysis for Plant Water Stress Classification through Leaf Movements
该研究通过优化基于叶片运动的形态 - 运动学分析框架，结合非线性描述符与灌溉上下文变量，并利用自适应线性意见池集成方法，显著提升了植物水分胁迫分类的准确性与鲁棒性，为低成本、可推广的表型分析奠定了坚实基础。
Convex Efficient Coding
该论文通过优化表征相似性而非直接优化神经活动，构建了一类兼具可处理性与灵活性的凸优化理论框架，不仅证明了多种神经编码问题（包括半非负矩阵分解和非负稀疏编码）的凸性，还据此推导出了神经编码的可识别性、唯一性及 ON/OFF 通道编码策略等关键结论。
If Grid Cells are the Answer, What is the Question? A Review of Normative Grid Cell Theory
本文综述了网格细胞理论，论证了网格细胞作为一种生物可行、高保真且可非线性解码的位置编码，其核心功能是支持路径整合，并探讨了该成熟领域对神经计算规范理论及任务优化神经网络整合的启示。
Learning Contact Policies for SEIR Epidemics on Networks: A Mean-Field Game Approach
本文提出了一种基于平均场博弈的 SEIR 网络流行病模型，通过刻画不同度类个体在潜伏期与感染风险下的接触策略纳什均衡，揭示了潜伏期导致的预防行为延迟及其对疫情规模的放大效应，并证明了均衡的存在性与唯一性。
Efficient Coding Predicts Synaptic Conductance
该研究基于突触生物物理特性构建无自由参数模型，利用香农信息论证明突触在自然电导下通过优化信噪比实现了每焦耳比特数的最大化，从而解释了电导偏离自然值时信息效率急剧下降的现象。
INTENSE: Detecting and disentangling neuronal selectivity in calcium imaging data
本文介绍了 INTENSE 这一开源框架，它利用互信息和循环置换检验，有效克服了钙成像数据中的时间自相关与动力学延迟问题，从而能够从高噪声数据中准确检测并解耦神经元对多种行为变量的真实选择性。
Neural geometry in the human hippocampus enables generalization across spatial position and gaze
该研究发现人类海马体神经元通过构建几何相关且可线性对齐的流形结构，在确保自我、他者及视线位置编码相互区分的同时，实现了跨空间地图、代理身份和视角的灵活泛化与抽象。
SeekRBP: Leveraging Sequence-Structure Integration with Reinforcement Learning for Receptor-Binding Protein Identification
SeekRBP 是一种结合序列与结构信息、利用强化学习中的多臂老虎机策略动态优化负样本采样的框架，旨在解决受体结合蛋白（RBP）识别中因序列高度变异和类别不平衡导致的传统方法失效问题。