A comparison of Sarstedt S-Monovette® cfDNA Exact and Streck® Cell-Free DNA blood collecting tubes in liquid biopsies
这项比较 Sarstedt S-Monovette® 与 Streck® 无细胞 DNA 管的研究发现,Sarstedt 管在第 0 天产生的无细胞 DNA 量显著较低,且在第 7 天表现出显著的白细胞裂解,表明其性能相对于 Streck 参考标准而言较差。
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想象一下,你的身体是一座繁忙的城市,而在你的血液循环中,微小的信息碎片正像纸飞机一样不断漂浮。这些不仅仅是普通的纸片,它们是 DNA 片段,是细胞的说明书。当细胞自然死亡或受伤时,它们会将这些碎片掉落在血液这条河流中。在癌症患者身上,其中一些纸飞机来自肿瘤本身,携带着关于疾病的秘密代码。科学家们称之为“液体活检”。医生不需要将针刺入肿瘤进行取样(这可能很痛苦且复杂),只需抽取一管血液,就能从这些漂浮的 DNA 片段中读取肿瘤的秘密。
但问题在于:血液样本是非常脆弱的。如果你让它闲置,试管中的白细胞可能会破裂,将它们自身的 DNA 洒得到处都是。这就像试图在一座图书馆里读到某篇特定的笔记,但突然间,有人把一卡车的旧报纸倾倒在了地板上。信号会被噪音淹没,肿瘤的秘密代码也将变得无法寻觅。为了阻止这种情况,科学家们使用装有“防腐药剂”的特殊采血管,这种药剂能让白细胞保持冷静并完整无损,同时让 DNA 安全地漂浮在上方。长期以来,其中一种品牌的试管一直是行业金标准。但最近,一个新的竞争者进入了赛场,承诺能完成同样的工作。大问题在于:这个新试管是否同样出色,还是说它会让混乱过早开始?
这项研究旨在对两种著名的采血管进行测试:享誉盛名的 Streck® Cell-Free DNA BCT 和较新的 Sarstedt S-Monovette® cfDNA Exact。研究人员收集了 30 名需要进行液体活检的癌症患者的样本。他们从每位患者身上抽血,并将其平分到两种类型的试管中。然后,他们通过两个时间点进行了“找不同”的游戏:采集后立即检测(第 0 天)以及放置一周后检测(第 7 天)。他们想观察三件事:试管中能提取出多少 DNA、DNA 的“纯度”如何(即有多少是来自肿瘤,有多少是杂乱的背景噪音),以及试管随时间变化的稳定性。
结果让新出的试管有些意外。在第 0 天,Sarstedt S-Monovette® 试管释放出的 DNA 显著少于 Streck® 试管。Sarstedt 试管中的 DNA 中位数是 19.5 ng,而 Streck 试管的产量为 24.2 ng。这就像是新试管扣留了一些宝藏。然而,DNA 的“纯度”——即肿瘤 DNA 与背景噪音的比率——在最初阶段两者几乎完全相同,都维持在 0.90 到 0.91 左右。因此,起初,新试管并不“脏”,它只是给出的量较少。
不过,真正的故事是在那一周内展开的。当研究人员在第 7 天再次检查试管时,Streck® 试管表现得非常稳健。DNA 的量没有发生太大变化,纯度也保持不变。里面的白细胞依然表现良好,将它们自身的 DNA 锁得死死的。但 Sarstedt S-Monovette® 试管却讲述了另一个故事。在第 0 天和第 7 天之间,DNA 水平发生了显著变化,纯度也略有下降。统计测试显示,对于 Sarstedt 试管,由于 p 值等于 0.0016,拒绝了原假设(即认为没有任何变化的假设);而对于 Streck 试管,则并未拒绝原假设(p = 0.81)。
用通俗的话来说,这意味着什么?这表明在 Sarstedt 试管中,一些白细胞在一周内开始破裂(溶解)。当它们破裂时,会释放出自身的基因组 DNA 进入混合物中。这就像我们提到的那些旧报纸突然淹没了图书馆。虽然这可能会让看起来有“更多”的 DNA 在漂浮,但它实际上稀释了珍贵的肿瘤信号,增加了背景噪音,使得样本在进行精确检测时不再可靠。研究人员怀疑,这可能是因为 Sarstedt 试管中的防腐剂对细胞的刺激稍大,或者可能是试管的塑料材质与血液的相互作用方式与 Streck 的玻璃材质不同。
作者谨慎地指出,虽然他们在实验室中发现了这些差异,但他们并没有测试这些变化是否真的影响了这些特定患者的最终癌症诊断。他们还指出,Sarsted 试管具有一些实际优势:它是塑料材质的(所以掉落时不会破碎),并且有一个特殊的活塞,在抽血时可能对静脉更温和。但如果论及在整整一周内保持 DNA 样本的稳定性和丰度,Streck® 试管在这场正面交锋中胜出了。研究结论认为,虽然 Sarsted 试管是一个可行的选择,但它产生的 DNA 较少,且在放置一周后显示出细胞破裂的迹象,这表明医生和实验室在处理它时,需要比对待既定标准更加小心。
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