Integrating dietary assessment and shotgun metagenomics to characterise diet–gut microbiome associations (GUTDIET-PT): Protocol for a multicentre cross-sectional study
GUTDIET-PT 研究是一项多中心横断面研究方案，旨在通过将详细的饮食评估与宏基因组鸟枪法测序相结合，对 2,500 名健康的葡萄牙成年人进行饮食-肠道微生物组关联特征分析，从而为通过定制化营养策略促进肠道健康建立基础性框架。
原始论文采用 CC BY 4.0 许可（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。 这是一篇未经同行评审的预印本的AI生成解释。这不是医疗建议。请勿根据此内容做出健康决定。 阅读完整免责声明
在人类肠道内，居住着一个庞大而隐形的微生物城市，这是一个由细菌、病毒和真菌组成的复杂群落，它们不知疲倦地工作以维持身体的运转。这些微小的居民帮助消化食物、训练免疫系统并产生必需的维生素。几十年来，科学家们一直知道我们的饮食是这个内部生态系统的主要建筑师，塑造着哪些微生物繁衍以及哪些逐渐消亡。虽然某些饮食习惯（如富含植物和全谷物的饮食）似乎能促进一个多样且具有韧性的群落，但另一些习惯（通常含有大量加工食品和糖分）则似乎削弱了它。然而，对于一个没有疾病的人，如何定义一个“健康”的微生物组仍然是一个谜。大多数研究都集中在当某人生病时这些微生物是如何变化的，这使得我们在理解饮食如何在纯粹健康的生理状态下塑造肠道方面存在认知空白。
一项名为 GUTDIET-PT 的新研究方案旨在填补这一空白，通过绘制葡萄牙大量健康成年人的日常饮食习惯与肠道微生物组之间的关系图谱。研究人员并非观察纤维或脂肪等孤立的营养素，而是考察整个饮食模式——即人们随着时间的推移如何自然地组合食物。他们正在招募 2,500 名年龄在 40 至 74 岁之间、正在接受常规结肠镜检查但没有结直肠癌或其他重大消化系统疾病迹象的个体。通过专注于目前处于健康状态的人群，该团队希望在任何疾病发生之前，建立一个关于繁荣肠道的清晰基准。这种方法使他们能够观察不同的饮食方式（从传统的地中海饮食到更现代的西方饮食模式）如何影响肠道内的微观生命，而不会受到疾病相关变化的干扰。
为了收集这些数据，该研究将详细的饮食访谈与先进的基因测序相结合。参与者需提供两次独立的 24 小时饮食记录，由经过培训的营养师询问有关份量、烹饪方法和特定品牌的细节。这种细致程度有助于捕捉人们实际摄入的内容，而非仅仅依赖于对平时饮食的记忆。研究人员随后分析这些记录，以识别常见的饮食模式（例如遵循植物性饮食或西方式饮食），并计算每个人的饮食可能具有多高的炎症性。除了这些饮食记录外，参与者还需在家中采集自己的粪便样本。这些样本会被立即保存以保护其内部的遗传物质，然后送往实验室，科学家在那里使用一种称为鸟枪法宏基因组学（shotgun metagenomics）的技术。与仅识别广泛细菌类群的旧方法不同，这种技术可以读取样本中每个微生物的完整遗传密码，不仅揭示了那里有哪些生物，还揭示了它们具备什么样的功能。
该研究目前正在进行中，自 2023 年底以来已招募了近 500 名参与者，目标是在 2029 年前完成招募工作。研究人员预计将在 2030 年底发布研究结果。虽然完整的成果尚在前方，但该研究的设计有望为食物与肠道健康之间的联系提供一张高分辨率的地图。通过分析微生物组的遗传潜力以及精确的饮食数据，该团队旨在识别哪些特定的饮食习惯能够支持一个多样且功能健全的肠道群落。这项工作最终可能帮助医生和营养师超越一般的建议，提供个性化的指导，建议特定的饮食改变，从而帮助个人维持健康的肠道生态系统。最终目标是利用这些知识在疾病开始前进行预防，将肠道微生物组科学转化为实用的公共卫生工具。
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