Integrating dietary assessment and shotgun metagenomics to characterise diet–gut microbiome associations (GUTDIET-PT): Protocol for a multicentre cross-sectional study
Lo studio GUTDIET-PT è un protocollo trasversale multicentrico che mira a caratterizzare le associazioni tra dieta e microbioma intestinale in 2.500 adulti portoghesi sani, integrando valutazioni dietetiche dettagliate con il sequenziamento metagenomico shotgun per stabilire un quadro fondamentale per la promozione della salute intestinale attraverso strategie nutrizionali personalizzate.
Articolo originale sotto licenza CC BY 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/). Questa è una spiegazione generata dall'IA di un preprint non sottoposto a revisione paritaria. Non è un consiglio medico. Non prendere decisioni sulla salute basandoti su questo contenuto. Leggi il disclaimer completo
All'interno dell'intestino umano vive una vasta, invisibile città di microrganismi, una complessa comunità di batteri, virus e funghi che lavora instancabilmente per far funzionare il corpo. Questi minuscoli residenti aiutano a digerire il cibo, addestrano il sistema immunitario e producono vitamine essenziali. Per decenni, gli scienziati hanno saputo che ciò che mangiamo agisce come il principale architetto di questo ecosistema interno, plasmando quali microbi prosperano e quali svaniscono. Mentre alcune abitudini alimentari, come quelle ricche di piante e cereali integrali, sembrano incoraggiare una comunità diversificata e resiliente, altre, spesso ricche di cibi trasformati e zuccheri, sembrano indebolirla. Eppure, definire esattamente cosa sia un microbioma "sano" in una persona non affetta da malattie rimane un enigma. La maggior parte della ricerca si è concentrata su come questi microbi cambino quando qualcuno è già malato, lasciando una lacuna nella nostra comprensia di come la dieta plasmi l'intestino in uno stato di pura salute.
Un nuovo protocollo di studio, noto come GUTDIET-PT, mira a colmare questa lacuna mappando la relazione tra le abitudini alimentari quotidiane e il microbioma intestinale in un ampio gruppo di adulti portoghesi sani. Invece di guardare a nutrienti isolati come le fibre o i grassi, i ricercatori stanno esaminando interi modelli dietetici: come le persone combinano naturalmente i cibi nel tempo. Stanno reclutando 2.500 individui tra i 40 e i 74 anni che si sottopongono a screening routinari con colonscopia ma che non presentano segni di cancro colorettale o altre gravi malattie digestive. Concentrandosi su persone che sono attualmente sane, la squadra spera di stabilire una linea di base chiara di cosa sia un intestino rigoglioso prima che insorga qualsiasi malattia. Questo approccio permette loro di vedere come diversi modi di mangiare, dalla tradizionale dieta mediterranea a modelli più moderni di tipo occidentale, influenzino la vita microscopica all'interno dell'intestino senza la confusione dei cambiamenti legati alla malattia.
Per raccogliere questi dati, lo studio combina interviste dietetiche dettagliate con il sequenziamento genetico avanzato. I partecipanti forniscono due separati resoconti di 24 ore su tutto ciò che hanno mangiato e bevuto, registrati da nutrizionisti esperti che chiedono informazioni su porzioni, metodi di cottura e marche specifiche. Questo livello di dettaglio aiuta a catturare la realtà di ciò che le persone consumano effettivamente, piuttosto che affidarsi alla memoria di ciò che mangiano di solito. I ricercatori analizzano poi questi registri per identificare modelli dietetici comuni, come l'adesione a una dieta a base vegetale o a una dieta di tipo occidentale, e calcolano quanto la dieta di ciascuna persona possa essere infiammatoria. Accanto a questi registri dietetici, i partecipanti raccolgono i propri campioni di feci a casa. Questi campoli vengono conservati immediatamente per proteggere il materiale genetico al loro interno, per poi essere inviati in un laboratorio dove gli scienziati utilizzano una tecnica chiamata metagenomica shotgun. A differenza dei metodi più vecchi che identificano solo ampi gruppi di batteri, questa tecnica legge l'intero codice genetico di ogni microbo nel campione, rivelando non solo chi è presente, ma anche cosa è capace di fare.
Lo studio è attualmente in corso, avendo già arruolato quasi 500 partecipanti dalla fine del 2023, con l'obiettivo di completare il reclutamento entro il 2029. I ricercatori prevedono di pubblicare i loro risultati entro la fine del 2030. Sebbene i risultati completi debbano ancora arrivare, il design dello studio promette di offrire una mappa ad alta risoluzione del collegamento tra cibo e salute intestinale. Analizzando il potenziale genetico del microbioma insieme ai dati dietetici precisi, il team mira a identificare quali abitudini alimentari specifiche sostengano una comunità intestinale diversificata e funzionale. Questo lavoro potrebbe aiutare i medici e i nutrizionisti a passare oltre i consigli generali per offrire raccomandazioni personalizzate, suggerendo cambiamenti dietetici specifici che potrebbero aiutare un individuo a mantenere un ecosistema intestinale sano. L'obiettivo finale è usare questa conoscenza per prevenire le malattie prima che inizino, trasformando la scienza del microbioma intestinale in strumenti pratici per la salute pubblica.
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