338 articles
La biochimie explore les processus chimiques qui donnent vie aux organismes, en décryptant comment les molécules interagissent pour faire fonctionner chaque cellule. Sur Gist.Science, nous transformons les découvertes complexes de bioRxiv en ressources accessibles pour tous. Notre équipe traite systématiquement chaque nouvelle prépublication dans ce domaine, offrant à la fois un résumé technique détaillé pour les experts et une explication claire pour le grand public.
Cette approche garantit que les avancées récentes en biologie moléculaire et en enzymologie ne restent pas enfermées dans un jargon inaccessible. En suivant rigoureusement les mises à jour de bioRxiv, nous assurons que vous avez accès aux recherches les plus fraîches, interprétées avec précision et pédagogie.
Vous trouverez ci-dessous la sélection des derniers articles publiés dans la biochimie, prêts à être consultés et compris.
Cet article présente une méthode d'IA générative rapide qui conçoit avec succès des nanopores en -tonneau asymétriques programmables dotés de dimensions et de fonctionnalités ajustables, telles que la détection d'ions et la translocation d'ADN, surmontant ainsi les limitations des structures de lumen uniformes précédentes et des approches de conception dépendantes d'experts.
Les simulations de dynamique moléculaire révèlent que la suppression de la région centrale de la protéine prion cellulaire perturbe les interactions intramoléculaires stabilisatrices, provoquant l'adoption de conformations étendues par le domaine N-terminal et augmentant sa proximité avec la membrane plasmique, fournissant ainsi une explication mécaniste de la neurotoxicité associée à cette mutation.
En utilisant la biotinylation dépendante de la proximité (BioID) chez Leishmania tarentolae, cette étude identifie trois nouveaux partenaires de liaison du VTC qui colocalisent et interagissent avec le complexe VTC dans les acidocalcisomes, élargissant ainsi l'interactome de cet organite et suggérant de nouveaux mécanismes d'homéostasie du phosphate et de régulation structurale chez les parasites kinetoplastides.
L'article présente DiReCT, une méthode basée sur les StageTip qui résout l'incompatibilité de solvant entre les éluats en phase inverse et le nanoHILIC/MS/MS en permettant l'injection directe de peptides solubilisés, augmentant ainsi considérablement la sensibilité d'identification des protéines et des peptides pour les échantillons à faible quantité.
Cet article présente Arg-C Zero, une endopeptidase arginylique recombinante haute fidélité dérivée de *Porphyromonas gingivalis*, qui réalise des clivages manqués quasi nuls et des performances robustes dans des conditions diverses, offrant une alternative supérieure à la trypsine pour des applications spécifiques telles que la cartographie des modifications post-traductionnelles des histones et la préservation des sites d'ADP-ribosylation labiles.
Cette étude présente le premier atlas protéomique résolu par type cellulaire du corps humain, généré par protéomique visuelle profonde à partir d'un donneur féminin sain, qui quantifie des milliers de protéines dans 27 types cellulaires pour révéler un noyau universel et des programmes spécialisés, découvrir de nouveaux antigènes cancer-testicules et fournir une ressource fondamentale pour comparer l'abondance de l'ARN et des protéines à l'échelle de la cellule unique.
Cette étude révèle que l'acide lipoïque existe dans des réservoirs distincts libres et liés aux protéines au sein des cellules de mammifères, démontrant que son utilisation mitochondriale dépend de la voie mtFAS pour la lipoylation des protéines plutôt que de son abondance cellulaire, remettant ainsi en cause l'efficacité de la supplémentation en acide lipoïque pour restaurer la fonction mitochondriale dans les troubles primaires.
Cette étude révèle que les cellules synthétisent activement le malonate via l'ACC1 pour alimenter la synthèse des acides gras mitochondriaux et soutenir la phosphorylation oxydative, démontrant ainsi que le malonate agit comme un intermédiaire métabolique endogène régulé plutôt que comme un simple inhibiteur du complexe II.
Cette étude établit un test rapide et évolutif de dégradation de plaques utilisant *Vibrio natriegens* pour cribler des enzymes hydrolysant le PET, validant avec succès son utilité en identifiant un mutant de cutinase de *Fusarium solani pisi* à haute activité et en obtenant un taux de réussite de 25 % lors d'un criblage de bibliothèque.
Ce papier présente deux ensembles de données complets de protéomique quantitative dérivés d'échantillons de peau de souris exposés à différentes doses, débits de dose et points temporels de rayonnement X, fournissant des données de haute qualité pour faciliter la découverte de biomarqueurs et le développement de modèles d'apprentissage automatique pour estimer l'exposition aux radiations.