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En exploitant le séquençage à longues lectures et la modélisation structurelle, cette étude identifie et caractérise 35 adhesines RTX chez sept espèces bactériennes pathogènes, révélant leur architecture complexe et offrant ainsi de nouvelles pistes pour bloquer l'infection face à la résistance aux antibiotiques.
Les auteurs ont optimisé l'expression et la purification de la protéine STEAP1 humaine pour obtenir sa forme homotrimérique fonctionnelle, démontrant que l'expression stable favorise l'incorporation de cofacteurs essentiels et une meilleure qualité protéique, offrant ainsi des stratégies clés pour le développement thérapeutique contre le cancer de la prostate.
En combinant l'administration d'oxyde de deutérium et la lipidomique, cette étude révèle que le renouvellement de la myéline repose sur un remplacement continu et hétérogène de ses constituants lipidiques selon leur classe et leur hydrophobicité, un processus dépendant d'ApoE qui ralentit considérablement avec l'âge.
Cette étude révèle que le riboswitch bactérien *alx* intègre de manière allostérique la détection du manganèse et du pH pour activer l'expression des gènes d'exportation lors d'un stress alcalin, en modulant la sensibilité à l'ion métallique via un remodelage conformationnel dépendant du pH.
Cette étude démontre que l'assimilation microbienne des composés organosulfurés comme le DMS et le DMSO peut être soutenue par des mécanismes non enzymatiques médiés par des espèces réactives de l'oxygène, pilotés par des facteurs géochimiques tels que la lumière et la chaleur, remettant ainsi en question la nécessité exclusive des enzymes dans ces voies métaboliques fondamentales.
Cette étude révèle que les conjugués glycine d'indole-3-carboxylates, métabolites dérivés du tryptophane et produits par l'interaction entre l'hôte et le microbiome, agissent comme des ligands activateurs du récepteur Ah chez l'humain, établissant ainsi un lien fonctionnel inattendu entre la chimie des auxines végétales et la physiologie humaine.
En utilisant l'imagerie par spectrométrie de masse sur des tissus de cal fracture chez des souris jeunes et âgées, cette étude révèle que le vieillissement retarde la guérison osseuse en empêchant la transition du cal cartilagineux vers le cal osseux, comme en témoigne la persistance de protéines de cartilage et l'absence de protéines osseuses spécifiques chez les animaux âgés.
Cette étude révèle que la liaison à haute affinité des ligands aux fibrilles amyloïdes s'effectue via deux modes topologiquement distincts, ce qui permet d'établir de nouveaux principes de conception pour améliorer ces interactions et développer des biomarqueurs thérapeutiques plus efficaces.
Cette étude démontre que les interactions entre les acides gras alimentaires et le microbiote intestinal modulent de manière unique le métabolisme lipidique de l'hôte et influencent les médiateurs lipidiques hépatiques, offrant ainsi de nouvelles perspectives sur les mécanismes sous-jacents aux maladies cardi métaboliques.
En élucidant le mécanisme d'action de l'antagoniste TGFβ parasite TGM6, cette étude révèle le rôle crucial de LRP1 et de la betaglycane dans sa spécificité et permet la conception rationnelle d'agents modulateurs de la voie TGFβ programmables et ciblés sur des types cellulaires spécifiques.
Cette étude démontre que les modifications structurales au sein de la classe des antibiotiques oxazolidinones, comme le passage du linézolide au tédisolide, modulent de manière significative leurs préférences de séquence pour le blocage des peptides naissants et altèrent la trajectoire de ces derniers au sein du ribosome.
Les analyses biochimiques et computationnelles révèlent que la cryptochrome 4a de la bergeronnette (ErCRY4a) ne se lie ni au 8-HDF ni au MTHF, suggérant qu'elle fonctionne exclusivement avec le cofacteur FAD, ce qui indique une spécialisation fonctionnelle distincte de celle des photolyases classiques.
Le papier présente AlphaFast, un cadre intégré qui accélère considérablement la construction d'alignements de séquences pour AlphaFold 3 grâce au MMseqs2 sur GPU, permettant des prédictions de structures rapides et peu coûteuses sans compromettre la précision.
En introduisant des résidus de proline pour briser les feuillets β dans le domaine prion-like de la protéine FUS, les chercheurs ont démontré qu'il est possible de prévenir l'agrégation toxique et la neurodégénérescence tout en préservant la séparation de phase et les fonctions physiologiques essentielles de la protéine.
Cette étude reconstitue sur des membranes supportées la communication et les boucles de rétroaction entre la Ras GTPase et la PI3Kγ, démontrant que l'introduction d'une rétroaction positive médiée par un GEF permet de surmonter l'inhibition globale pour générer des ondes d'activation locales et propagées de Ras et de PIP3.
Cette étude présente la première structure cryo-électronique du canal TRPM1 humain à l'état conducteur, révélant une architecture de pore inédite avec un module S5-P-S6 inversé qui explique son activité constitutive et éclaire les mécanismes de la cécité nocturne congénitale.
Cette étude caractérise structurellement et biochimiquement un cytochrome P450 dégradant la lignine, puis l'ingénierie pour lui conférer une activité duale sur les dérivés de guaiacol et de syringol issus du fractionnement catalytique du bois dur, facilitant ainsi leur valorisation biocatalytique en produits chimiques.
En développant la méthode GATO-seq et en utilisant la cryo-microscopie électronique, cette étude révèle qu'une séquence nucléique spécifique induit un « super arrêt » de l'ARN polymérase II en stabilisant un état réversible de recul (« sidetracked ») dans une poche spécifique, démontrant ainsi que la séquence d'ADN elle-même encode la propension à l'arrêt et piège la polymérase dans un état hors ligne.
Cette étude élucide et démontre la possibilité de reprogrammer le code structural d'assemblage spécifique des ligases E3 de type GID/CTLH, révélant les règles moléculaires qui gouvernent leurs interactions sous-unitaires et permettant ainsi la conception de variants artificiels.
Cette étude présente le développement de sondes chimioluminescentes phénoxy-dioxétanes capables de détecter rapidement et avec une sensibilité accrue les bactéries productrices de colibactine dans des suspensions fécales complexes en ciblant spécifiquement l'enzyme ClbP.