Uncovering Functional Distant Mutations by Ultra-High-Throughput Screening of Dehalogenases

En utilisant un tri par cytométrie en flux à ultra-haute capacité avec un substrat fluorogène encombrant, les auteurs ont identifié des mutations distantes dans la déhalogénase LinB qui améliorent l'accès au substrat et modulent la dynamique conformationnelle, démontrant ainsi l'efficacité de cette approche pour révéler des mécanismes d'adaptation enzymatique difficiles à prédire par conception rationnelle.

Faldynova, H., Kovar, D., Jain, A. + 28 more2026-03-26⚗️ biochemistry

Chiral methionine oxidation reagents reveal stereospecific proteome modifications

Cette étude présente une plateforme utilisant des réactifs oxaziridine énantiomériques pour cartographier les sites d'oxydation stéréospécifique de la méthionine dans le protéome, démontrant ainsi comment une modification chirale unique peut réguler allostériquement la fonction protéique et amplifier les modifications post-traductionnelles en réponse au stress oxydatif.

Gonzalez-Valero, A., Page, A. C. S., Bertoch, J. M. + 17 more2026-03-26⚗️ biochemistry

Integrative Structural Modeling of Intrinsically Disordered Regions in a Human HDAC2 Chromatin Remodeling Complex

Cette étude présente une approche intégrative combinant des données de réticulation croisée expérimentales et des techniques de modélisation computationnelle pour élucider la structure du complexe HDAC2:MIER1:MHAP1, en surmontant les limites des méthodes comme AlphaFold pour caractériser les régions intrinsèquement désordonnées.

Nde, J., Kempf, C., Zimmermann, R. + 5 more2026-03-25⚗️ biochemistry

Structural, biophysical, and virological mechanistic characterization of HIV-1 capsid-targeting antivirals

Cette étude démontre que des modifications chimiques aux positions R1 et R3 du composé PF74 permettent de concevoir de nouveaux antiviraux ciblant la capside du VIH-1 avec une puissance accrue, une meilleure stabilité virale et une affinité de liaison améliorée par rapport au PF74 original, offrant ainsi des perspectives prometteuses pour le développement de traitements cliniques.

Kirby, K. A., McFadden, W. M., Wang, L. + 18 more2026-03-25⚗️ biochemistry

A comparative investigation of the mannose binding interface in DC-SIGN and MRC1 carbohydrate recognition domains with all-atom molecular dynamics simulations

Cette étude utilise des simulations de dynamique moléculaire tout-atomique pour comparer les interfaces de liaison du mannose entre les domaines de reconnaissance des glucides de DC-SIGN et MRC1, révélant comment un état de liaison spécifique, inaccessible à DC-SIGN, explique la plus forte affinité du mannose pour MRC1 et guide ainsi la conception de ligands thérapeutiques sélectifs pour le traitement du rétinoblastome.

Geissler, S., Sacquin-Mora, S.2026-03-25⚗️ biochemistry

Multi-Objective Engineering of Fibrin-Selective Thrombolytic Proteases with Enhanced Biocatalytic Efficiency and Inhibition Resistance

Cette étude présente une stratégie d'ingénierie multi-objectifs ayant permis de concevoir la Brnoteplase, une nouvelle enzyme thrombolytique offrant une sélectivité pour le fibrine, une résistance à l'inhibition et une pénétration du caillot améliorées, ce qui se traduit par une efficacité thérapeutique accrue et un risque hémorragique réduit chez l'animal.

Toul, M., Slonkova, V., Mican, J. + 18 more2026-03-25⚗️ biochemistry

Structural and cellular insights into the inhibition of the drug efflux activity of the HEDGEHOG receptor PATCHED1

Cette étude révèle, par cryo-microscopie électronique et analyses cellulaires, que l'inhibiteur PAH bloque l'activité d'efflux de médicaments du récepteur PATCHED1 en occupant son site de liaison au cholestérol, offrant ainsi une base structurale pour le développement de nouvelles thérapies contre la chimiorésistance.

Houha, O., Wachich, M., Debarnot, C. + 4 more2026-03-25⚗️ biochemistry

Enhanced RNA Formation Under Amine-Rich Local Atmospheres from 2',3'- Cyclic Nucleotides

Cette étude démontre que la présence de contre-ions ammonium et alkylammonium dans des atmosphères locales riches en amines améliore considérablement la polymérisation des nucléotides 2',3'-cycliques en brins d'ARN, suggérant que des poches de gaz riches en ammoniac issues de la pyrolyse de goudrons organiques ont pu favoriser l'évolution prébiotique de l'ARN.

Schmid, A., Kovarik, A., Hintz, J. + 12 more2026-03-25⚗️ biochemistry

Plasmin-mediated cleavage of GPIbα contributes to breakdown of platelet-von Willebrand factor complexes

Cette étude démontre que la clivage de GPIbα par la plasmine, et non celui du VWF, est le mécanisme principal responsable de la rupture des complexes plaquette-VWF in vitro, bien que son rôle dans la dégradation de ces complexes in vivo chez les patients atteints de purpura thrombotique thrombocytopénique (PTT) semble plus limité.

Frunt, R., Moesker, E. I., Sakai, K. + 4 more2026-03-25⚗️ biochemistry

Structure of human aldehyde oxidase under tris(2-carboxyethyl)phosphine-reducing conditions

L'utilisation du réducteur sans soufre TCEP, contrairement au DTT qui inactive l'enzyme, a permis d'obtenir de nouveaux cristaux bien ordonnés de l'aldéhyde oxydase humaine (hAOX1) sans perte d'activité, offrant ainsi une stratégie pour des études cristallographiques futures incluant la cristallographie résolue dans le temps.

Videira, C., Esmaeeli, M., Leimkuhler, S. + 2 more2026-03-25⚗️ biochemistry

Quaternary structure and activity of glutamate dehydrogenase are regulated by reversible S-palmitoylation and mitochondrial acyl-protein thioesterases.

Cette étude démontre que la S-palmitoylation réversible de la glutamate déshydrogénase mitochondriale, catalysée par le palmitoyl-CoA et inversée par les thioestérases APT1 et ABHD10, régule l'activité enzymatique en perturbant l'assemblage de l'hexamère en dimères, établissant ainsi un lien entre le métabolisme lipidique mitochondrial et le contrôle de cette enzyme centrale.

Salsaa, M., Huynh, H. T. A., Dixon, C. L. + 4 more2026-03-25⚗️ biochemistry

A human cell-free translation screen identifies the NT-2 mycotoxin as a ribosomal inhibitor that binds the peptidyl transferase center

Cette étude établit un criblage à haut débit en système cell-free humain qui identifie la mycotoxine NT-2 comme un nouvel inhibiteur de la traduction se liant au centre de transfert peptidique du ribosome, révélant ainsi un mécanisme d'inhibition environnemental et démontrant la puissance de cette approche pour découvrir de nouveaux inhibiteurs ribosomaux.

Schwaller, N., Andenmatten, D., Luginbuehl, J. + 6 more2026-03-24⚗️ biochemistry