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287 articles

La biochimie explore les processus chimiques qui donnent vie aux organismes, en décryptant comment les molécules interagissent pour faire fonctionner chaque cellule. Sur Gist.Science, nous transformons les découvertes complexes de bioRxiv en ressources accessibles pour tous. Notre équipe traite systématiquement chaque nouvelle prépublication dans ce domaine, offrant à la fois un résumé technique détaillé pour les experts et une explication claire pour le grand public.

Cette approche garantit que les avancées récentes en biologie moléculaire et en enzymologie ne restent pas enfermées dans un jargon inaccessible. En suivant rigoureusement les mises à jour de bioRxiv, nous assurons que vous avez accès aux recherches les plus fraîches, interprétées avec précision et pédagogie.

Vous trouverez ci-dessous la sélection des derniers articles publiés dans la biochimie, prêts à être consultés et compris.

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Loss of the Central Region Reshapes the Dynamic Landscape of the Cellular Prion Protein and Its Plasma Membrane Interaction

Les simulations de dynamique moléculaire révèlent que la suppression de la région centrale de la protéine prion cellulaire perturbe les interactions intramoléculaires stabilisatrices, provoquant l'adoption de conformations étendues par le domaine N-terminal et augmentant sa proximité avec la membrane plasmique, fournissant ainsi une explication mécaniste de la neurotoxicité associée à cette mutation.

Rigoli, M., Faccioli, P., Biasini, E.2026-06-03
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Novel Binding Partners of the Vacuolar Transporter Chaperone (VTC) complex in Acidocalcisomes of Leishmania tarentolae

En utilisant la biotinylation dépendante de la proximité (BioID) chez Leishmania tarentolae, cette étude identifie trois nouveaux partenaires de liaison du VTC qui colocalisent et interagissent avec le complexe VTC dans les acidocalcisomes, élargissant ainsi l'interactome de cet organite et suggérant de nouveaux mécanismes d'homéostasie du phosphate et de régulation structurale chez les parasites kinetoplastides.

Krolak, P., Ribeiro, O., Gehl-Vaisanen, B., Hiltunen, M., Goldman, A., Vidilaseris, K.2026-05-28
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Direct Injection NanoHILIC/MS/MS Proteomics from Reversed-Phase StageTip Eluate

L'article présente DiReCT, une méthode basée sur les StageTip qui résout l'incompatibilité de solvant entre les éluats en phase inverse et le nanoHILIC/MS/MS en permettant l'injection directe de peptides solubilisés, augmentant ainsi considérablement la sensibilité d'identification des protéines et des peptides pour les échantillons à faible quantité.

Akamatsu, K., Kanao, E., Ishihama, Y.2026-05-28
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Near-Zero Missed Cleavages with a High-Fidelity Recombinant Arg-C Zero for Mass Spectrometry-Based Proteomics

Cet article présente Arg-C Zero, une endopeptidase arginylique recombinante haute fidélité dérivée de *Porphyromonas gingivalis*, qui réalise des clivages manqués quasi nuls et des performances robustes dans des conditions diverses, offrant une alternative supérieure à la trypsine pour des applications spécifiques telles que la cartographie des modifications post-traductionnelles des histones et la préservation des sites d'ADP-ribosylation labiles.

Hernandez-Rollan, C., Elsborg, J. D., Le Boiteux, E., Lu, Y., Patel, K., Ahel, I., Jensen, O. N., Batth, T. S., Olsen, J (…)2026-05-28
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A cell type-resolved proteomic atlas of the human body

Cette étude présente le premier atlas protéomique résolu par type cellulaire du corps humain, généré par protéomique visuelle profonde à partir d'un donneur féminin sain, qui quantifie des milliers de protéines dans 27 types cellulaires pour révéler un noyau universel et des programmes spécialisés, découvrir de nouveaux antigènes cancer-testicules et fournir une ressource fondamentale pour comparer l'abondance de l'ARN et des protéines à l'échelle de la cellule unique.

Weiss, C. A., Sjoestedt, E., Debnath, A., Ben-Moshe, S., Diedrich, L., Zwahlen, M., Oeller, M., Wahle, M., Skarwan, E. (…)2026-05-27
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Functional partitioning of lipoic acid decouples cellular abundance from mitochondrial utilization

Cette étude révèle que l'acide lipoïque existe dans des réservoirs distincts libres et liés aux protéines au sein des cellules de mammifères, démontrant que son utilisation mitochondriale dépend de la voie mtFAS pour la lipoylation des protéines plutôt que de son abondance cellulaire, remettant ainsi en cause l'efficacité de la supplémentation en acide lipoïque pour restaurer la fonction mitochondriale dans les troubles primaires.

Norden, P. R., Wedan, R. J., Ellis, A. E., Hart, M. L., Gendjar, M. R., Sheldon, R. D., Nowinski, S. M.2026-05-23
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Cells Engage Endogenous Malonate Synthesis to Drive Mitochondrial Metabolism

Cette étude révèle que les cellules synthétisent activement le malonate via l'ACC1 pour alimenter la synthèse des acides gras mitochondriaux et soutenir la phosphorylation oxydative, démontrant ainsi que le malonate agit comme un intermédiaire métabolique endogène régulé plutôt que comme un simple inhibiteur du complexe II.

Wedan, R. J., Norden, P. R., Canfield, M. T., Ellis, A. E., Saxena, S., Longenecker, J. Z., Dykstra, M., Sheldon, R. D. (…)2026-05-23
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Development of a Vibrio natriegens-based plate-clearing assay for rapid screening of PET-hydrolyzing enzymes

Cette étude établit un test rapide et évolutif de dégradation de plaques utilisant *Vibrio natriegens* pour cribler des enzymes hydrolysant le PET, validant avec succès son utilité en identifiant un mutant de cutinase de *Fusarium solani pisi* à haute activité et en obtenant un taux de réussite de 25 % lors d'un criblage de bibliothèque.

Trooyen, S. H., Bolstad, I. M., Droivoldsmo, N., Luciano, D., Petersen, E., Courtade, G.2026-05-22
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A quantitative proteomics dataset for assessment and prediction of low dose X-ray radiation exposure in mice.

Ce papier présente deux ensembles de données complets de protéomique quantitative dérivés d'échantillons de peau de souris exposés à différentes doses, débits de dose et points temporels de rayonnement X, fournissant des données de haute qualité pour faciliter la découverte de biomarqueurs et le développement de modèles d'apprentissage automatique pour estimer l'exposition aux radiations.

Zelter, A., Riffle, M., Merrihew, G. E., Mutawe, B., Shulman, N., Sanders, J. A., Noble, W. S., Johnson Erickson, D. P. (…)2026-05-22
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Systematic characterization of the yeast secretome under diverse proteosynthetic stress conditions reveals secretion of functional ER chaperone BiP

Cette étude caractérise systématiquement le protéome sécrété par la levure dans diverses conditions de stress protéosynthétique, révélant des profils de sécrétion spécifiques à chaque stress et démontrant que la chaperonne intracellulaire BiP est sécrétée via des voies non conventionnelles pour fonctionner comme une holdase extracellulaire stabilisant les protéines clientes mal repliées dans des conditions de stress spécifiques telles que le stress réducteur.

Liu, S., Schulz, B. L.2026-05-22