A Coma Pattern-Based Autofocusing Method Resolves Bacterial Cold Shock Response at Single-Cell Level

Cette étude présente LUNA, une méthode d'autofocalisation innovante exploitant le motif de coma pour corriger la dérive de mise au point avec une précision nanométrique, permettant ainsi de révéler pour la première fois la dynamique continue de croissance et de division des bactéries lors de la réponse au choc thermique à l'échelle de la cellule unique.

Li, S., Ma, Z., Yu, Y. + 5 more2026-03-23🦠 microbiology

From genomic decay to functional advantage: Traits of a persistent, thermally beneficial coral probiotic

Cette étude démontre que l'approche guidée par l'évolution, qui sélectionne des probiotiques de corail basés sur des signatures de dépendance à l'hôte plutôt que sur des fonctionnalités de laboratoire, permet d'identifier la souche *Ruegeria* MC10-B4 dont la persistance et les mécanismes moléculaires spécifiques améliorent significativement la tolérance thermique de l'hôte.

Xie, M., Xu, C., Xiang, N. + 15 more2026-03-23🦠 microbiology

Universal rapid RNA-based quantification of toxigenic Alexandrium species (Dinophyceae) using quantitative recombinase polymerase amplification

Cette étude présente un test de détection rapide et portable basé sur l'amplification isotherme de l'ARN (qRT-RPA) ciblant le gène sxtA4, permettant une quantification fonctionnelle et précoce des espèces d'Alexandrium toxiques pour améliorer la surveillance des efflorescences algales nuisibles.

Markopoulos, I., Papadopoulou, I., Chantzaras, C. + 4 more2026-03-23🦠 microbiology

The induction of systemic resistance to barley powdery mildew by rhizosphere bacterial communities does not disrupt the structure or function of native microbial communities

Cette étude démontre que des communautés microbiennes synthétiques (SynComs) issues du rhizosphère peuvent induire une résistance systémique au mildiou de l'orge chez l'orge sans perturber la structure ou la fonction des communautés microbiennes natives, agissant principalement comme agents de priming.

Rigerte, L., Sommer, A., Vlot, A. C. + 4 more2026-03-23🦠 microbiology

Virulence and antimicrobial resistance features among clades of Escherichia coli ST131 strains causing community-acquired urinary tract infection in Rio de Janeiro, Brazil

Cette étude menée à Rio de Janeiro en 2019 révèle que les souches d'Escherichia coli ST131, particulièrement le sous-clade C2, sont fortement associées à la résistance aux antimicrobiens, à la production de biofilm et à un profil de virulence élevé, ce qui suggère leur rôle central dans la persistance et la dissémination des infections urinaires communautaires dans la région.

Barcellos, I. S., Sousa, T. C. C., de Castro, E. M. + 5 more2026-03-23🦠 microbiology

Interferon-β Coordinates Epithelial Immune Networks and Fibrotic Responses During Chlamydia muridarum Infection

Cette étude démontre que l'interféron-β joue un rôle central dans la coordination des réseaux immunitaires épithéliaux et la régulation des réponses fibrotiques lors de l'infection par *Chlamydia muridarum*, car son absence entraîne une dysrégulation transcriptionnelle favorisant une inflammation déséquilibrée et un remodelage tissulaire pathologique.

Kumar, R., Cordova-Mendez, I. C., Burgess, D. + 3 more2026-03-23🦠 microbiology

A novel peptide modulator of a two-component system revealed by the specific activation of a small RNA in Enterobacteriaceae

Cette étude révèle que le système à deux composants RstB-RstA, activé par l'acidité, régule spécifiquement l'ARN OmrB et induit l'opéron asr-ydgU, dont le petit peptide YdgU (renommé SamT) exerce un rétrocontrôle négatif direct sur RstB tandis que Asr favorise une boucle de rétroaction positive, illustrant ainsi un mécanisme complexe de modulation des systèmes à deux composants par de petites protéines chez les Entérobactéries.

Mathis de Fromont, J., Brosse, A., Quenette, F. + 1 more2026-03-21🦠 microbiology

Redox distribution of Asgard archaea and co-occurring taxa in microbial mats from an early Proterozoic ecosystem analog

Cette étude démontre que les archées Asgard, en l'absence de respiration aérobie, prospèrent dans des zones de réduction des sulfates au sein de tapis microbiens anaérobies, suggérant qu'elles ont principalement établi des interactions syntrophiques avec des bactéries réductrices de sulfate dans des conditions simulant l'Archaen tardif et le Protérozoïque précoce.

Gutierrez-Preciado, A., Struillou, A., Liang, L. + 8 more2026-03-21🦠 microbiology

Alignment-Free Guided Design of a Pan-Orthoflavivirus RT-qPCR Assay

Cette étude présente et valide un pipeline de conception d'essai RT-qPCR pan-orthoflavivirus sans alignement, basé sur l'analyse de k-mers et les graphes de De Bruijn, permettant de détecter avec une haute sensibilité et spécificité des virus à ARN hautement variables comme le dengue, Zika et l'encéphalite japonaise pour renforcer la surveillance épidémiologique mondiale.

Sayasit, K., Chaimayo, C., Nuwong, W. + 4 more2026-03-20🦠 microbiology

Determination of GLP-1 Secretion Potential of Dead and Live Akkermansia muciniphila Using Human L-cells

Cette étude démontre que la souche vivante d'Akkermansia muciniphila VHAKM stimule la sécrétion de GLP-1 dans les cellules L humaines de manière plus efficace que sa forme pasteurisée ou d'autres souches commerciales, soulignant l'importance de la viabilité et de la spécificité de la souche pour les interventions métaboliques.

Nayak, S., Rajagopalan, P., Sunhare, R. + 1 more2026-03-20🦠 microbiology

DksA-Dependent Stringent Stress Response Drives Virulence and Gastrointestinal Persistence of Klebsiella pneumoniae

Cette étude démontre que le régulateur DksA est essentiel à la colonisation gastro-intestinale, à la persistance environnementale et à la virulence de *Klebsiella pneumoniae* en coordonnant la réponse au stress rigoureux, la tolérance aux antibiotiques, la production de capsule et la formation de biofilm.

Islam, M. M., Beckman, R. L., Nutter, N. A. + 5 more2026-03-20🦠 microbiology

Performance of shotgun metagenomic sequencing for detection of fungi and parasites across clinical sample types: a multicenter retrospective study.

Cette étude rétrospective multicentrique démontre que le séquençage métagénomique shotgun (SMg) offre des performances diagnostiques élevées pour la détection des champignons et des parasites sur divers types d'échantillons cliniques, validant l'efficacité de seuils d'interprétation spécifiques à chaque type de prélèvement pour une mise en œuvre standardisée.

Ghelfenstein-Ferreira, T., Angebault, C., Demontant, V. + 4 more2026-03-20🦠 microbiology