🧬 biology

GeneRhythm uncovers gene expression rhythms that shape the dynamic transcriptional landscape in single-cell omics

L'article présente GeneRhythm, un nouveau cadre qui reformule l'analyse de l'expression génique en cellule unique dans le domaine temps-fréquence afin de découvrir des programmes de régulation rythmiques et des dynamiques pertinentes pour les maladies qui sont invisibles pour les approches conventionnelles dans le domaine temporel.

Jun Ding, Xiuhui Yang, Yiming Jia, Braeden Giles, Yumin Zheng, Jingtao Wang, Kailu Song, Bowen Zhao, Yasmin Jolasun, Vis (…)2026-07-02
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Gut microbiota of insectivorous bats in Japan harbor Chlamydophila psittaci and Shiga toxin-producing Escherichia coli: host species and location shape community structure

Cette étude caractérise le microbiote intestinal de trois espèces de chauves-souris insectivores au Japon, révélant que l'espèce hôte et le lieu de prélèvement façonnent de manière significative la composition de la communauté tout en identifiant la première détection de *Chlamydophila psittaci* aux côtés d'autres agents pathogènes tels que *Bacillus cereus* et *Escherichia coli* producteur de toxine Shiga, soulignant ainsi l'importance de la surveillance du microbiome de la faune sauvage pour l'approche « One Health ».

Rosalia Mwongeli Makau, Bett Evalyne Chepkirui, Ishara Uhanie Perera, Takashi Shimizu, Masanori Hashino, Hiroshi Shimoda (…)2026-07-02
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Cell-Size-dependent of bacterial communities antibiotic resistome profiles and risk assessment in a river: A metagenomic analysis

Cette étude métagénomique révèle que, bien que les bactéries fluviales de petite taille (0,1–0,45 µm) et de grande taille (>0,45 µm) présentent des compositions de gènes de résistance aux antibiotiques et des communautés hôtes distinctes, elles posent en fin de compte des risques de résistance aux antimicrobiens comparables, soulignant le rôle significatif et auparavant négligé des bactéries de petite taille dans les résistomes environnementaux.

Pengfei Yang, Jiaxian yao, Yuehua Zhang, Yongzhen Zhao, Zening Wang, Shuhan Li, Fangzhou Gao, Guannan Mao, Shuai Zhang (…)2026-07-02
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Performance of a fine-scale positioning acoustic telemetry array in a deep freshwater ecosystem

Cette étude évalue un réseau de télémétrie acoustique de positionnement à échelle fine dans un écosystème d'eau douce profond, concluant que, bien que l'efficacité de détection varie selon la puissance de la balise, l'espacement des récepteurs et la température, le système demeure efficace pour un positionnement précis des animaux avec des récepteurs espacés de 400 à 800 mètres.

Benjamin L. Hlina, Aaron T. Fisk, Dale M. Webber, Neil Rooney, Timothy B. Johnson2026-07-02
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Early-life stress shapes tissue-specific gut-brain metabolomic and microbial profiles in laying hens

Cette étude démontre que le stress au début de la vie chez les poules pondeuses induit une réorganisation métabolique et microbienne persistante et spécifique aux tissus le long de l'axe intestin-cerveau à l'âge adulte, caractérisée par des altérations localisées des lipides et du redox dans l'iléon et le cerveau, tandis que les profils plasmatiques systémiques demeurent largement inchangés.

Annemarie J.W. Mens, Ingrid C. de Jong, Soumya K. Kar, René P. Kwakkel, Edoardo Zaccaria2026-07-02
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Comparative Ion Channel Transcriptomes of NK1R and Somatostatin Neurons in the preBötzinger Complex of the Ventrolateral Medulla

Cette étude utilise le séquençage de l'ARN sur noyau unique pour caractériser les transcriptomes de canaux ioniques distincts des neurones Tacr1+ et Sst+ dans le complexe préBötzinger, révélant que les neurones Tacr1+ possèdent une signature moléculaire unique impliquant une régulation positive coordonnée de TRPC5, NALCN et de récepteurs neuromodulateurs spécifiques qui sous-tendent probablement leur rôle critique dans la génération des rythmes respiratoires.

Hemalatha Bhagavan, Aguan D. Wei, Luiz M. Oliveira, Jan-Marino Ramirez2026-07-02
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Host induced microRNA hsa-miR-643 promotes Mycobacterium tuberculosis survival inside macrophages by downregulating Gins2

Cette étude démontre que le microARN de l'hôte hsa-miR-643 favorise la survie de *Mycobacterium tuberculosis* au sein des macrophages en ciblant et en régulant à la baisse directement Gins2, inhibant ainsi l'apoptose et suggérant hsa-miR-643 comme une cible thérapeutique potentielle pour la tuberculose.

Garima Kumari, Ruchi Verma, Mohd Mustkim Ansari, Rajendra Kumar Dhuriya, Gunjan Tripathi, Bhupendra N Singh2026-07-02
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Genomics and transcriptomics of nervous system from Rhodnius prolixus, and its modulation after a blood meal in an immature stage

Cette étude utilise des données génomiques améliorées et l'analyse transcriptomique pour caractériser le système nerveux du vecteur de la maladie de Chagas, *Rhodnius prolixus*, révélant que l'ingestion de sang chez les nymphes du cinquième stade déclenche une régulation à la baisse généralisée des gènes impliqués dans les processus physiologiques, suggérant un passage d'un état affamé et réactif à un état postprandial moins réactif.

Natalia Capriotti, Lucila Traverso, Jose Manuel Latorre Estivalis, Ivana Sierra, Juan P. Ianowski, Sheila Ons2026-07-02
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Molecular dynamics simulation of the effect of initial temperature and initial pressure on thermal behavior and cavitation dynamics in tumor tissue

Cette étude emploie des simulations de dynamique moléculaire pour démontrer que, bien que les variations initiales de température et de pression (280–310 K et 0–2 bar, respectivement) n'altèrent pas les températures de saturation ou d'équilibre d'un modèle de tissu tumoral, elles influencent de manière significative l'expansion structurelle et la conductivité thermique par des tendances non monotones, avec des propriétés thermiques et structurelles optimales observées à 1 bar en raison d'un équilibre entre l'espacement interatomique et la mobilité atomique.

Mohsen shafiee, Ghanbarali Sheikhzadeh2026-07-02
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Natural Phenolic Acids Modulate Memory and Anxiolytic Behavior in Adult Zebrafish (Danio Rerio): Serotonergic Involvement, Oxidation-Dependent Activity, Quantum Calculations, and Molecular Docking Highlight Sinapic acid

Cette étude démontre que les acides phénoliques naturels, particulièrement l'acide sinapique, exercent des effets anxiolytiques et de préservation de la mémoire dose-dépendants chez le poisson zèbre adulte via des mécanismes sérotoninergiques et une activité dépendante de l'oxydation, comme le confirment des essais comportementaux, des amarrages moléculaires et des calculs quantiques.

Thaís Rocha Cavalcante, Jéssica Bezerra Maciel, Amanda Maria Barros Alves, Joilna Alves Silva, Jacilene Silva, Tainá Sou (…)2026-07-02