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🧬 biology

Habitat adaptation determines dark septate endophyte mediated stabilization of the soil-root-plant continuum under sulfate salinity

Cette étude démontre que les endophytes à septums sombres adaptés à l'habitat, spécifiquement *Alternaria chlamydospora* SC11, stabilisent le continuum sol-racine-plante chez *Suaeda salsa* sous une salinité sulfatée sévère en maintenant l'homéostasie des nutriments, l'intégrité racinaire et des réponses métaboliques coordonnées, alors que les isolats non adaptés ne parviennent pas à fournir ces bénéfices.

Yinli Bi, Shishuang Zhang, Jianying Zhang, Yuguang Zhang, Hai Tan, Jiapeng Kang2026-08-12
🧬 biology

Divergent responses to SARS-CoV-2 infection reveal brain resilience-associated astrocyte programs in centenarians

Cette étude démontre que les astrocytes dérivés de centenaires présentent une résilience cérébrale accrue à l'infection par le SARS-CoV-2 grâce à une réponse inflammatoire contenue et une régulation métabolique distincte, contrastant avec le stress plus large et la dysrégulation immunitaire observés chez les astrocytes d'adultes ayant subi une maladie critique.

Danyllo Oliveira, Amanda Assoni, Luis Ariel Espinosa-Rodríguez, Mauricio Quiñones-Vega, Joyce Esposito, Raul Hernandez B (…)2026-08-12
🧬 biology

CHRFAM7A-assigned transcript detection is enriched in a LAMP3+CCR7+ dendritic-cell state in esophageal squamous cell carcinoma

Cette étude démontre que les transcrits attribués à CHRFAM7A sont techniquement soutenus et significativement enrichis dans un état spécifique de cellules dendritiques LAMP3+CCR7+ au sein du carcinome épidermoïde de l'œsophage, tout en précisant que ces résultats ne confirment pas l'expression de CHRNA7 ni l'activité de la signalisation vagale.

Zhao-wei Gao, Xue-li Gao, Shu-min Lun, Li-juan Duan, Xiao-xiao Wang, Fang Zhao, Sha-sha Cao, Yao-wen Zhang2026-08-12
🧬 biology

Molecular Characterization of Colistin Resistance Determinants in Clinical and Patient-Environmental Multidrug-Resistant Acinetobacter baumannii

Cette étude caractérise la résistance à la colistine chez *Acinetobacter baumannii* multirésistant en révélant que les mutations chromosomiques sont le mécanisme de résistance prédominant par rapport aux gènes *mcr* médiés par des plasmides, tout en soulignant la complexité de la résistance par la détection d'isolats aux déterminants génétiques inconnus.

Monisha B, Rashmi P Mahale, Morubagal Raghavendra Rao, Suchitra Shenoy M2026-08-12
🧬 biology

GraphTransformer-CoGNN: A two-stage dynamic graph learning framework for label-scarce cell-type annotation in spatial transcriptomics

L'article propose GraphTransformer-CoGNN, un cadre d'apprentissage de graphes dynamiques en deux étapes qui combine un Graph Transformer avec un encodage de distance de résistance et un GNN coopératif pour atteindre l'état de l'art en annotation de types cellulaires en transcriptomique spatiale dans des conditions de rareté de labels en affinant de manière adaptative les structures de graphes et en supprimant les connexions parasites.

Yuanyuan Dang, Xinyi Han, Bing Liu2026-08-12
🧬 biology

XG-PUL: A Network-Based Framework for Disease Gene Prioritization Using Graph Representation Learning and Positive-Unlabeled Learning

L'article propose XG-PUL, un cadre d'apprentissage automatique robuste qui combine l'apprentissage de représentations de graphes basé sur Node2Vec avec un classificateur positif-non étiqueté basé sur le bagging pour prioriser efficacement les gènes associés aux maladies en abordant le défi de l'incertitude des étiquettes dans les réseaux biologiques.

Mahdiyeh Ayouman, Zahra Narimani2026-08-12
🧬 biology

Characterization of corneal epithelium and endothelium with scanning electron microscopy in three avian species

Cette étude utilise la microscopie électronique à balayage pour caractériser la morphologie ultrastructurale, les densités cellulaires et les caractéristiques de surface des cellules épithéliales et endothéliales de la cornée chez trois espèces aviaires (hirondelle bleue et blanche, pigeon domestique et grive à ventre roux), fournissant ainsi la première description de ce type pour les ordres des Columbiformes et des Passeriformes.

Clarissa Machado Carvalho, Rosélia LS Araújo, Paula Diniz Galera2026-08-12
🧬 biology

Multiple species of native mosquitoes may be involved in Usutu virus circulation and maintenance in temperate zones

Cette étude démontre que plusieurs espèces de moustiques indigènes dans l'Angleterre tempérée, particulièrement *Culex pipiens* s.l., jouent un rôle significatif dans la circulation et le maintien du virus Usutu, l'analyse phylogénétique confirmant la co-circulation de lignées virales distinctes et suggérant que des températures plus chaudes pourraient faciliter la transmission.

Robert Calam Bruce, Anthony J. Abbott, Bathsheba L. Gardner, Amy C. Edwards, Harrison Hardy, Mirjam Schilling, Andra-Mar (…)2026-08-12
🧬 biology

Peripheral blood transcriptomic reanalysis prioritizes a neutrophil– matrix metalloproteinase axis and doxycycline in adult tuberculous meningitis

Cette étude réanalyse les données transcriptomiques du sang périphérique de patients adultes atteints de méningite tuberculeuse afin d'identifier un axe neutrophile–métalloprotéinase matricielle comme caractéristique pathogène clé, privilégiant ainsi la doxycycline comme une thérapie prometteuse dirigée vers l'hôte pour validation expérimentale.

Shuaijia Zeng, Xiaodong Zhang, Xing Cao, Quansheng Liu, Xue Chen, Aili Jia, Xing Chen, Jinhu Wen, Junhao Chu2026-08-12
🧬 biology

Comparative benchmarking of AI research agents for omics data interpretation

Cette étude présente une évaluation quantitative exhaustive de trois agents de recherche IA spécialisés (K-Dense, Finch et Biomni) par rapport à ChatGPT pour l'interprétation des données omiques, révélant qu'aucun agent ne domine toutes les modalités et que l'architecture de l'agent, plutôt que la capacité du modèle de base, est le principal déterminant de la qualité des résultats et de l'adéquation à des flux de travail bioinformatiques spécifiques.

Nikita V. Basov, Yosef K. Tirta, Zihan Li, Huan Zhou, Kiryl D. Piatkevich2026-08-12