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🧬 biology

Whole-genome duplication but not domestication shapes phyllosphere microbiome resilience across angiosperms globally

Cette étude mondiale de plus de 7 000 microbiomes révèle que la duplication du génome entier, plutôt que la domestication, améliore systématiquement la résilience et la stabilité du microbiome de la phyllosphère à travers les angiospermes grâce à des propriétés de réseaux inter-règnes conservées, tandis que les communautés de la rhizosphère sont principalement dictées par des facteurs géographiques.

Amanda Rawstern, Itay Mayrose, Tia-Lynn Ashman2026-08-06
🧬 biology

Common variants in the lysosomal pathway contribute to Parkinson's Disease risk

Cette étude démontre qu'un score de risque polygénique spécifique à la voie lysosomale, dérivé de 49 SNP indépendants incluant 14 variants nouveaux, prédit de manière significative le risque de maladie de Parkinson à travers les populations européennes et est-asiatiques et identifie les individus présentant une forte probabilité d'apparition future de la maladie, soutenant ainsi le rôle central de la biologie endolysosomale dans la pathogenèse de la MP et l'utilité de la stratification génétique informée par les voies pour la médecine de précision.

P. Dimartino, A. Tenghe, S. Khodaee, A. A.K. Sreelatha, C. Domenighetti, P. E. Sugier, C. Schulte, B. Portugal, P. May (…)2026-08-06
🧬 biology

Molecular investigation of coronavirus and Leptospira spp. in bats (Chiroptera, Mammalia) from Brazil

Cette étude a réalisé une surveillance moléculaire des coronavirus et de l'espèce *Leptospira* chez des chauves-souris non hématophages du nord-ouest de São Paulo, au Brésil, entre 2019 et 2024, ne trouvant aucune preuve de la présence de ces agents pathogènes dans les tissus échantillonnés tout en soulignant la nécessité d'une surveillance plus large et normalisée pour tenir compte des limites de l'échantillonnage.

Raquel Cuba Gaspar, Benedito Donizete Menozzi, Anna Luisa Pizzaia Henrique, Gismelli Cristiane Angeluci, Nycolas Octavio (…)2026-08-06
🧬 biology

A Weighted PRS for Ischemic Heart Disease: Candidate-Gene Associations and an Evaluation of Epistasis and Machine-Learning Approaches

Cette étude cas-témoins pakistanaise identifie des associations significatives entre des gènes candidats spécifiques et la cardiopathie ischémique, démontrant qu'un simple score de risque polygénique pondéré stratifie efficacement le risque tout en révélant que la pondération épistatique et les classificateurs d'apprentissage automatique n'apportent aucune valeur ajoutée en raison des limites de la conception de l'étude plutôt qu'en raison d'un véritable signal génétique.

Anam Ijaz, sara aslam, NA Shabana2026-08-06
🧬 biology

Strain-Specific Reduction of Ndel1 Enzymatic Activity During Early Zika Virus Infection in the Neonatal Brain

Cette étude démontre qu'une infection précoce par le virus Zika dans le cerveau néonatal réduit spécifiquement l'activité enzymatique de Ndel1 de manière dépendante de la souche, la lignée brésilienne provoquant une suppression post-transcriptionnelle significative de cette enzyme neuronale critique alors que la lignée africaine et le virus de la dengue ne le font pas, liant ainsi ce dysfonctionnement moléculaire à l'altération du développement neurologique unique associée à la souche brésilienne.

Mirian A. F. Hayashi2026-08-06
🧬 biology

ProtSyntax: a protein large language model for decoding post-translational modification syntax and function

ProtSyntax est un modèle de langage protéique de 4 milliards de paramètres qui surmonte les limites du traitement des modifications post-traductionnelles (MPT) comme des étiquettes indépendantes en intégrant la chimie des résidus, l'ordre des motifs et le contexte 3D pour prédire avec précision les sites de MPT, modéliser le cross-talk et décoder leurs conséquences fonctionnelles à travers diverses applications biologiques.

Yiyu Lin, Jiahui Wu, You Zhou, Xinye Ni, Shan Chang, Jun Ding, Yan Wang, Xin Gao, Sen Yang2026-08-06
🧬 biology

MicroRNAs Associated with Disease-Stage Progression in Diabetic Retinopathy and Macular Edema: A Bioinformatic Reanalysis of Public Transcriptomic Data

Cette réanalyse bioinformatique de données transcriptomiques rétiniennes humaines publiques identifie un ensemble spécifique de micro-ARN différentiellement exprimés qui convergent vers les voies de la régulation immunitaire et du métabolisme mitochondrial, offrant des candidats régulateurs plausibles pour la progression de la rétinopathie diabétique et des perspectives potentielles sur la résistance à l'anti-VEGF dans l'œdème maculaire diabétique.

Luis Jesuino de Oliveira Andrade, Gabriela Correia Matos de Oliveira, Caroline Santos França, Alcina Maria Vinhaes Bitte (…)2026-08-06
🧬 biology

Gut microbiota and pancreatic cancer risk: A hypothesis-generating two-step Mendelian randomization study with cross-ancestry validation

Cette étude de randomisation mendélienne en deux étapes avec validation trans-ancestrale fournit des preuves génétiques que certains microbiotes intestinaux sont causalement associés à une réduction du risque de cancer du pancréas, potentiellement par l'intermédiaire de voies liées à l'IL-6, bien que les résultats demeurent exploratoires dans l'attente d'une confirmation fonctionnelle.

Weiwei Wang, Chengjia Tang, Xu Feng, Lili Wang, Wenke Li, Yongshuang Lv2026-08-06
🧬 biology

Large-scale cerebellar-cerebral network alterations underlying impaired social predictive processing in cerebellar neurodegeneration

Cette étude démontre que la neurodégénérescence cérébelleuse altère le traitement prédictif social, particulièrement dans les jugements de traits de personnalité, en perturbant la connectivité fonctionnelle cérébello-cérébrale (spécifiquement entre le lobule VIII et le putamen), ce qui entraîne une dépendance excessive aux indices contextuels et un échec de la mise à jour du comportement lorsque les attentes sociales sont violées.

Libera Siciliano, Nicole Urbini, Giusy Olivito, Michelle Pisu, Martina Tanieli, Andrea Ciricugno, Viola Oldrati, Federic (…)2026-08-06
🧬 biology

Meta-analysis of Human Serum DIA proteome: Combining Datasets for AI Analysis

Cette étude démontre que la combinaison de jeux de données de protéomique DIA de sérum humain provenant de répertoires publics pour une méta-analyse pilotée par l'IA est actuellement irréalisable en raison d'effets de lot persistants et puissants qui génèrent de fausses corrélations et de faux positifs, suggérant que de tels jeux de données devraient plutôt être analysés individuellement.

Kerry Ramsbottom, Andrew Collins, Ananth Prakash, Yasset Perez Riverol, Eric W. Deutsch, Juan Antonio Vizcaíno, Andrew R (…)2026-08-06