Species diversity and pathogenicity of the Fusarium oxysporum species complex associated with potato tuber dry rot, including the description of F. sherbakoffii sp. nov.
Cette étude caractérise la diversité des espèces et la pathogénicité d'isolats du complexe d'espèces *Fusarium oxysporum* issus de la pourriture sèche de la pomme de terre en Russie, identifiant *F. nirenbergiae* comme le pathogène le plus agressif, décrivant une nouvelle espèce *F. sherbakoffii*, et notant que plusieurs espèces induisent des symptômes de pourriture molle atypiques parallèlement à la pourriture sèche typique.
Article original sous licence CC BY 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/). Ceci est une explication générée par l'IA d'un preprint qui n'a pas été évalué par des pairs. Ce n'est pas un avis médical. Ne prenez pas de décisions de santé basées sur ce contenu. Lire la clause de non-responsabilité complète
Les pommes de terre sont un aliment de base du régime humain, poussant dans le sol et stockant leur énergie sous forme de tubercules souterrains. Cependant, ces cultures sont vulnérables à un groupe de champignons connus sous le nom de complexe d'espèces Fusarium oxysporum. Considérez ce complexe non pas comme un organisme unique, mais comme une vaste famille de champignons très étroitement apparentés qui se ressemblent presque tous à l'œil nu, mais qui sont en réalité des espèces distinctes avec des comportements différents. Lorsque ces champignons infectent les tubercules de pomme de terre, ils provoquent une maladie appelée pourriture sèche, qui transforme la chair de la pomme de terre en un amas sec et friable, entraînant des pertes importantes pour les agriculteurs et la sécurité alimentaire. Pendant longtemps, les scientifiques ont eu du mal à distinguer ces différents membres de la famille, les regroupant souvent sous un seul nom, ce qui rendait difficile de comprendre quel type spécifique causait le plus de dégâts ou comment les gérer efficacement.
Dans une étude récente, des chercheurs se sont mis en devoir de démêler cette confusion en examinant des tubercules de pomme de terre provenant de cinq régions différentes de Russie présentant des signes de cette pourriture sèche. Ils ont collecté vingt-trois échantillons fongiques à partir des pommes de terre malades et les ont soumis à une analyse génétique détaillée. Au lieu de se fier à l'apparence des champignons, qui peut être trompeuse, les scientifiques ont lu des sections spécifiques de leur code génétique. Ils ont examiné cinq parties différentes du manuel d'instructions génétiques, incluant des sections qui contrôlent la façon dont les champignons construisent leurs protéines et comment ils copient leur matériel génétique. Cette approche a permis de distinguer les différentes espèces avec un haut degré de certitude, révélant une diversité cachée au sein des pommes de terre en décomposition.
L'enquête a confirmé que plusieurs espèces connues étaient présentes, notamment sept souches d'un type, quatre d'un autre, et des nombres plus faibles de deux autres. Cependant, la découverte la plus significative était que huit des souches, collectées dans diverses localités, ne correspondaient à aucune espèce connue. Ces champignons uniques ont été identifiés comme une nouvelle espèce, que les chercheurs ont nommée Fusarium sherbakoffii. En plus de décrire ce nouveau membre de la famille, l'étude a clarifié les relations entre dix autres espèces précédemment nommées, déterminant que certains de ces noms se référaient en fait au même organisme et devraient être combinés. Les chercheurs ont également observé la croissance de ces champignons, notant des caractéristiques spécifiques telles que la formation de minuscules spores en grappes et la production de structures de survie à parois épaisses, ce qui a aidé à confirmer leurs identités.
Au-delà de la simple dénomination des champignons, l'équipe a testé la dangerosité de chaque type pour les pommes de terre. Ils ont inoculé des tubercules de pomme de terre sains avec les différentes souches pour voir quels dégâts chacune causait. Les résultats ont montré une différence nette d'agressivité. Une espèce, F. nirenbergiae, s'est avérée la plus destructrice, causant des dommages tissulaires compris entre 1,6 et 8,2 fois plus étendus que les dommages causés par les autres espèces. La nouvelle espèce, F. sherbakoffii, et l'espèce standard F. oxysporum présentaient des niveaux de dommages variables, ce qui signifie que certaines souches étaient pires que d'autres, tandis qu'une autre espèce, F. odoratissimum, causait le moins de dégâts. Curieusement, alors que la pourriture sèche crée typiquement une décomposition sèche et friable, certaines des souches les plus agressives, y compris la nouvelle espèce et le type standard, ont fait en sorte que la chair de la pomme de terre devienne brun foncé, se ramollisse et devienne humide autour de la zone infectée, créant un type de pourriture différent de celui attendu habituellement. Ce travail offre une image plus claire des ennemis spécifiques qui menacent les cultures de pommes de terre, allant au-delà d'une étiquette générale pour identifier exactement quels champignons sont présents et avec quelle sévérité ils peuvent frapper.
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