Exploration of the structural and functional diversity in the metamorphic RfaH subfamily
本研究は、AlphaFold2 による構造予測と実験的検証を通じて、RfaH サブファミリーに活性型で恒常的に機能する単形態のホモログが存在し、これらが長距離の病原性オペロンの制御に関与していることを明らかにし、RfaH の進化が構造的変化を伴う段階的な特化プロセスであることを支持するものです。
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biochemistry
238 件の論文
生命の仕組みを分子レベルで解き明かすのが生化学です。DNA やタンパク質といった目に見えない小さな分子が、どのように互いに働き合い、私たちが呼吸したり考えたりする生命活動を支えているのか。この分野は、そのような生命の根源的なメカニズムを研究する領域です。
Gist.Science では、生化学に関連する最新の論文を bioRxiv から収集し、専門家の目を通じて整理しています。掲載されている全てのプレプリントに対し、専門用語を噛み砕いた平易な要約と、技術的な詳細を網羅した解説の両方を提供し、誰でも最新の知見にアクセスできるようにしています。
以下に、生化学の分野で bioRxiv から公開された最新の論文リストを掲載します。
PEPTERGENT: A Peptide-Based Method for Detergent-Free Extraction and Purification of Membrane Proteins and Membrane Proteomes
本論文は、従来の界面活性剤の欠点を克服し、膜タンパク質を安定して抽出・精製して構造解析や質量分析を可能にする新たなアンプシパティックペプチド「Peptergent」を開発し、そのプロトコルと応用可能性を報告したものである。
FLEX: A heparin-binding fusion partner engineered from fibroblast growth factor 1 to enhance protein expression, solubility and purity
この論文は、ヒト線維芽細胞増殖因子 1（FGF1）を基に設計されたコンパクトな融合タグ「FLEX」が、難発現タンパク質の可溶性、安定性、およびヘパリン親和性を向上させ、大腸菌や哺乳類細胞など多様な発現系において高純度かつ高収量でのタンパク質精製を可能にする新たな画期的なツールであることを報告しています。
UFMylation of Pyruvate Dehydrogenase Regulates Mitochondrial Metabolism
本論文は、UFM1 脱結合酵素 UFSP2 の欠損による過剰な UFMylation が、PDH 複合体の E2 成分 DLAT のリシン 118 残基への修飾を介してその酵素活性を亢進させ、結果としてミトコンドリアの呼吸や TCA サイクルにおけるピルビン酸の酸化を促進する新たな代謝調節機構を明らかにしたものである。
Potential of Korean Forest Tree Seed Extracts as Multifunctional Bioresources: Evaluation of Antioxidant, Anti-inflammatory, Whitening, and Anticancer Activities
本論文は、韓国の 7 種の高木種子抽出物を用いた実験により、それらが抗酸化・抗炎症・美白・抗がん作用など種ごとに異なる多機能性を有する未活用の天然バイオ資源であることを示し、既存の植林システムから得られる種子資源の持続可能な価値向上の可能性を提唱しています。
Functional impact of PCSK9 variants on LDL uptake in a knockout hepatic model
本研究では、CRISPR/Cas9 技術を用いて PCSK9 を欠損させた HepG2 細胞株を構築し、このモデル系において D374Y や R496W などの既知変異に加え、A443T などの未解明変異の機能的多様性を定量的に評価することで、PCSK9 変異の LDL 取り込みへの影響を詳細に解明し、精密脂質管理戦略の基盤となる変異分類の枠組みを確立しました。
UFD1 Recognition of Initiator and Proximal Ubiquitin Drives p97-Mediated Substrate Unfolding enhanced by FAF1, FAF2, and UBXD7
本論文は、1.31 オングストロームの結晶構造解析と AlphaFold3 による解析を通じて、UFD1 が K48 結合ユビキチン鎖の開始ユビキチンと近位ユビキチンをそれぞれ異なるドメインで認識し、FAF1、FAF2、UBXD7 といった補助アダプターが異なるメカニズムで p97-UN 複合体の基質展開活性を促進することを明らかにした。
Mapping the chaperonin TRiC/CCT interactome in mouse photoreceptors reveals functional significance for energy metabolism
本研究は、マウス視細胞における TRiC/CCT の相互作用網を網羅的に解析し、TRiC 機能不全がタンパク質フォールディング障害を介してエネルギー代謝危機を引き起こし、最終的に神経変性を促進するメカニズムを解明した。
Bioactive Natural Products Produced by Streptomyces from the Microbiome of Cadaveric Fly Larvae
本論文は、豚の死体から採取されたハエの幼虫の微生物叢から多様な生物活性化合物を産生するストレプトマイセスを単離・解析し、特に希少な代謝産物である JBIR-68 やシママイシンが線虫駆除活性を示すことを明らかにすることで、死体由来のハエ幼虫が新規天然物発見の有望な生態系資源であることを示した。
Structural Basis of Condensin Recruitment for X Chromosome Repression
本論文は、線虫 C. elegans において SDC-3 がアダプターとしてコンデンシン IDC の DPY-27 亜基に結合し、その自己抑制を解除して DNA ループ抽出活性を誘発することで X 染色体の転写抑制と用量補償を実現する分子機構を、クライオ電子顕微鏡構造解析により解明したものである。