Structural Basis of a Novel Heme Binding Bacterial One-Component Switch
本論文は、Fimbriimonas ginsengisoli 由来の新規ヘム結合タンパク質 FG214 が、酸化還元状態やリガンド結合に応答して単量体から二量体へ構造変化し、DNA 結合能を制御する一成分転写因子として機能することを、構造生物学および生化学的アプローチにより解明したものである。
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biochemistry
238 件の論文
生命の仕組みを分子レベルで解き明かすのが生化学です。DNA やタンパク質といった目に見えない小さな分子が、どのように互いに働き合い、私たちが呼吸したり考えたりする生命活動を支えているのか。この分野は、そのような生命の根源的なメカニズムを研究する領域です。
Gist.Science では、生化学に関連する最新の論文を bioRxiv から収集し、専門家の目を通じて整理しています。掲載されている全てのプレプリントに対し、専門用語を噛み砕いた平易な要約と、技術的な詳細を網羅した解説の両方を提供し、誰でも最新の知見にアクセスできるようにしています。
以下に、生化学の分野で bioRxiv から公開された最新の論文リストを掲載します。
Discovery and Biosynthesis of Nitrilobacillins by Post-translational Introduction of C-Terminal Nitrile Groups
本研究は、C 末端のアスパラギン残基をアスパラギン酸合成酵素様タンパク質がニトリル基に変換し、最終的にパキスロビドの活性成分と類似の構造を持つシステインプロテアーゼ阻害剤「ニトリロバシリン」を生成する、リボソーム合成および翻訳後修飾ペプチド（RiPP）の新たな生合成経路を解明したものである。
β-Barrel domain swapping in α-hemolysin enables enhanced single-molecule biomolecule sensing
α-ヘモリシンのβバレルドメインを他の毒素由来のドメインと交換するモジュラーな工学アプローチにより、膜透過性を低下させながら安定した導電性を維持し、DNAやタンパク質などの生体分子の単一分子検出性能を大幅に向上させたキメラナノポアを開発しました。
In Cellulo pharmacological profiling and genomic editing reveals paralog-specific targets for PA generation during PLC signaling
本論文は、PLC シグナル伝達におけるホスファチジン酸（PA）生成を調節する DGK 阻害剤の細胞内でのパラログ特異性を評価し、PA レベルを効果的に低下させるためには DGKαと PLD の両方を阻害する必要があることを明らかにした。
Solid-Phase Synthesis of ProTide Fluorogenic Probes Enables Systematic Profiling of Carboxypeptidase Activity
本論文は、固相合成法を用いた蛍光性プロタイドプローブの開発により、膵臓がん患者の血液中で特異的に上昇するカルボキシペプチダーゼ活性を検出・プロファイリングする高感度プラットフォームを確立したことを報告しています。
Discovery of dual thiobarbiturate-indole scaffold as a selective inhibitor targeting chikungunya virus nsP3 macrodomain through a cryptic binding pocket
本研究は、蛍光共鳴エネルギー移動（FRET）アッセイによるハイスループットスクリーニングから発見された、チオバルビツル酸 - インドール骨格を有する新規化合物（MDOLL-0273）が、キクンギアウイルスの nsP3 マクロドメインに存在する隠れた結合ポケットを標的として、高い選択性と阻害活性を示すことを明らかにしたものである。
Structural Basis for Dual Peptidoglycan Hydrolysis by an E. faecium Minhovirus Tail Spike Lysin
本論文は、臨床的に重要な耐性菌エンテロコッカス・ファエシウムを感染するミンホウイルス SHEF14 の尾部スパイクリシン ORF11 の結晶構造を解明し、その二量体構造が N-アセチルグルコサミニダーゼと D,D-エンドペプチダーゼという二重のペプチドグリカン分解活性を担うことを初めて明らかにしたものである。
Reverse Proteolysis Uncovers a Hidden Dimension of the Peptidome
この論文は、リソソームシステインカタペシンが加水分解と結合を反復して非ゲノコードの融合ペプチドを生成する「逆プロテオリシス」という新たな酵素経路を実証し、そのメカニズムが1 型糖尿病の自己抗原生成やペプチド多様性の拡大に寄与することを明らかにしたものである。
In vitro reconstitution of vertebrate Sonic Hedgehog protein cholesterolysis
本研究は、脊椎動物の Sonic Hedgehog 前駆体タンパク質のコレステロール分解反応を、蛍光共鳴エネルギー移動（FRET）を用いた連続測定法でin vitro 再構成し、基質特異性、界面活性剤の影響、および酵素変異体に対する化学的補救のメカニズムを解明したものである。
Alcohol dehydrogenase-mediated methanol dissimilation increases carbon efficiency in synthetic autotrophic yeast
本論文は、メタノール酸化経路をアルコールオキシダーゼからアルコール脱水素酵素（Adh2）へ変更することで、二酸化炭素発生を抑制し、バイオマス収率やクエン酸・乳酸などの生合成生産性を大幅に向上させた合成自栄養性酵母 Komagataella phaffii の開発を報告しています。