338 件の論文
生命の仕組みを分子レベルで解き明かすのが生化学です。DNA やタンパク質といった目に見えない小さな分子が、どのように互いに働き合い、私たちが呼吸したり考えたりする生命活動を支えているのか。この分野は、そのような生命の根源的なメカニズムを研究する領域です。
Gist.Science では、生化学に関連する最新の論文を bioRxiv から収集し、専門家の目を通じて整理しています。掲載されている全てのプレプリントに対し、専門用語を噛み砕いた平易な要約と、技術的な詳細を網羅した解説の両方を提供し、誰でも最新の知見にアクセスできるようにしています。
以下に、生化学の分野で bioRxiv から公開された最新の論文リストを掲載します。
本研究は、T13dA1、T13dA2、および T79dA という新たなタキサン脱アセチル酵素を同定し、パクリタキセル生合成経路を複雑なネットワークとして再定義するとともに、統合された 18 遺伝子および 19 遺伝子経路を介してタバコ（Nicotiana benthamiana）におけるバキタキシン III の高収量再構成を可能にした。
本研究は、PPM1B ホスファターゼが基質を直接配位し、脱離基を安定化して加水分解を駆動する第 3 の金属イオン（M3）を備える三核金属中心を利用することを明らかにし、これは異なる触媒構造を採用する PPP ホスファターゼと収束的な化学戦略を共有するものである。
本研究は、プロ筋原性FGFR経路を同時に活性化し、抗筋原性ALK1/TGFBR2および炎症性gp130シグナルを抑制することにより、AI設計の合成タンパク質ミニバインダー（C6-DPC）がシグナリング障壁を克服して効率的かつ機能的なヒト筋原性リプログラミングを可能にし、線維芽細胞から高収縮力の筋組織を生成しうることを示している。
この論文は、細胞内プロセスを精密に制御するために、デノボ（新規）設計された膜透過性マクロサイクルと、それと結合するタンパク質ホモ二量体からなる、化学誘導性二量体化（CID）システムを開発したことを報告しています。
本論文は、植物分子生物学で広く利用される*Agrobacterium fabrum*由来のMprFホモログであるLpiA（AfMprF）について、クライオ電子顕微鏡解析を用いてその二量体構造を明らかにし、基質結合に関与すると考えられる保存されたアミノ酸残基の役割を解明したものです。
本論文は、アイソレチンアミリン（IAPP）の凝集反応における「ラグ相」の長さがβ細胞の機能障害の持続期間を予測し、成熟した繊維ではなく一時的な前繊維中間体が細胞毒性の主要な原因であることを示しています。
本研究は、蛍光性非標準アミノ酸 7-HCAA をプリオンタンパク質に導入する手法を開発し、その蛍光特性の変化を通じてプリオン形成時の局所的な構造変化をリアルタイムで検出可能であることを実証し、アミロイド形成タンパク質の構造ダイナミクス解析に対する新たな戦略を確立した。
本研究では、進化生物学の原理に基づき、自然な鋳型や事前定義されたモチーフに依存せずにタンパク質機能をプログラム可能に設計する多目的設計フレームワーク「dEVA」を開発し、これを用いてリン酸エステル加水分解活性を持つゼロショットな新規金属酵素を設計・実証しました。
本研究は、低倍率と高倍率のデータを同じ傾斜系列で交互に取得する新しいクライオ電子トモグラフィー戦略を提案し、細胞全体の広範な構造と 4 オングストローム未満の分子レベルの詳細な構造を同時に可視化することで、細胞生物学と構造生物学を架橋する実用的な手法を確立しました。
本研究は、真核生物の膜輸送に関わる COMMD タンパク質ファミリーが、ミクソコッコタ門細菌に由来する単一の祖先遺伝子から重複を繰り返して進化したことを、構造生物学と系統解析により明らかにしました。