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Substrate-dependent crosslinking by the cytochrome P450 from aminopyruvatide biosynthesis
本研究は、シトクロムP450酵素ApyOが顕著な基質可塑性を有し、アミノピルバチド前駆体中の芳香族残基間において、強力なプロテアーゼ阻害活性を持つマクロ環ペプチドを生成するためのC-C、N-C、およびC-O結合を含む多様な架橋反応を触媒することを実証している。
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338 件の論文
生命の仕組みを分子レベルで解き明かすのが生化学です。DNA やタンパク質といった目に見えない小さな分子が、どのように互いに働き合い、私たちが呼吸したり考えたりする生命活動を支えているのか。この分野は、そのような生命の根源的なメカニズムを研究する領域です。
Gist.Science では、生化学に関連する最新の論文を bioRxiv から収集し、専門家の目を通じて整理しています。掲載されている全てのプレプリントに対し、専門用語を噛み砕いた平易な要約と、技術的な詳細を網羅した解説の両方を提供し、誰でも最新の知見にアクセスできるようにしています。
以下に、生化学の分野で bioRxiv から公開された最新の論文リストを掲載します。
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Cryo-EM Structure of a Triazole alpha-Conotoxin GI Mimetic Bound to the Muscle-Type Nicotinic Acetylcholine Receptor
本研究は、天然のジスルフィド結合を1,5-トリアゾール等価体に置き換えることで、筋肉型nAChRに対してナノモーラー以下の低濃度での活性を維持しつつ、安定化したコノトキシン治療薬の開発に向けた構造的枠組みを提供する、-コノトキシンGIのトリアゾールベースのペプチドミメティックの設計、合成、およびクライオ電子顕微鏡による構造解析について報告するものである。
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S-Palmitoylation stabilizes OGT and the OGT-PPP1CC complex
本研究は、zDHHC14によって媒介されAPT2によって逆転される、Cys-472およびCys-477におけるOGTのS-パルミトイル化が、HSC70を介したCMA経路によるリソソームでの分解を抑制することで当該酵素を安定化させると同時に、PPP1CCおよびYAPとの相互作用を強化して基質選択性とO-GlcNAc化を調節することを明らかにしている。
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Biochemical and Binding Characterization of a Riboflavin Analogue Tethered to Biotin
本研究は、リボフラビン様の分光学的特性を保持し、かつリボフラビン結合タンパク質およびストレプトアビジンに対してマイクロモーラー単位の結合親和性を示すリボフラビン-ビオチンキメラ（C6-Rf-biotin-tag）を特徴づけており、診断用アッセイやフラビン結合タンパク質の標識におけるその有用性を示唆している。
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Targeting Mitochondrial Dysfunction with Mdivi-1 Confers Therapeutic Protection in a Mouse Model of Mustard Keratopathy
本研究は、ミトコンドリア分裂タンパク質DNM1LをMdivi-1を用いて薬理学的に阻害することが、ミトコンドリア機能を維持し組織修復を促進することにより、窒素マスタード誘発性の角膜損傷を効果的に軽減することを実証しており、それによってミトコンドリア機能不全がマスタード角膜症の主要な治療標的であることを特定している。
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Isolation of oxygen-dependent nicotine- and pseudooxynicotine-metabolizing enzymes
本研究は、*Peribacillus frigoritolerans* NIC8由来の、ニコチンおよびプセウドオキシニコチンを効率的に代謝する2つの新規な酸素依存性フラビンアミンオキシドレダースであるNcoxおよびPnoxを同定・特性評価しており、これらは禁煙治療の向上およびニコチンのバイオコンバージョンに向けた有望な候補となる。
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Structural basis for covalent inhibition of sulfatases by sulfamate warheads
本研究は、構造生物学と計算手法を組み合わせることで、アリルスルファメート阻害剤が、許容的な疎水性ポケット内に特定の四面体中間体を収容することによってアリルスルファターゼと安定な共有結合付加体を形成する一方で、糖鎖スルファターゼは、阻害剤を反応性の高いポーズから排除してしまう制限的な活性部位のために、このウォーヘッドを拒絶することを明らかにしている。
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TMPRSS6 Cleavage of β-Klotho Modulates FGF19 Signaling
本研究は、TMPRSS6がFGF19の共受容体である-klothoを切断・脱落させ、それによってFGF19シグナル伝達を減衰させる新規のプロテアーゼであることを特定しており、代謝異常関連脂肪肝疾患（MASLD）の治療におけるTMPRSS6標的化のメカニズム的根拠を提示している。
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Kinesin-1 holoenzyme assembly coordinates cargo-adaptor recognition with heavy-chain autoinhibition
本研究は、キネシン-1ホロ酵素の集合における分子メカニズムを解明し、重鎖と軽鎖間の特異的な2:2相互作用がいかにしてカーゴ・アダプター認識を制御し、モーターの活性化とカーゴの結合を協調させるために、ストークック介在性の自己抑制ラッチを解除するかを実証するものである。
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Mutation-induced heterogeneity of the β7-β8 loop of the Staphylococcus aureus class A sortase leading to enhanced catalytic efficiency characterized by NMR and enzyme kinetics
本研究は、NMR分光法および酵素反応速度論を用い、スタフィロコッカス・アウレウス（*Staphylococcus aureus*）のソーターゼAにおけるβ7-β8ループ内の残基P94およびその相互作用パートナーであるY187の変異が、活性アポ状態における構造的不均一性を誘発し、それによって基質結合親和性および触媒効率を調節することを実証するものである。