338 件の論文
生命の仕組みを分子レベルで解き明かすのが生化学です。DNA やタンパク質といった目に見えない小さな分子が、どのように互いに働き合い、私たちが呼吸したり考えたりする生命活動を支えているのか。この分野は、そのような生命の根源的なメカニズムを研究する領域です。
Gist.Science では、生化学に関連する最新の論文を bioRxiv から収集し、専門家の目を通じて整理しています。掲載されている全てのプレプリントに対し、専門用語を噛み砕いた平易な要約と、技術的な詳細を網羅した解説の両方を提供し、誰でも最新の知見にアクセスできるようにしています。
以下に、生化学の分野で bioRxiv から公開された最新の論文リストを掲載します。
本論文は、mTurquoise2およびSYFP2蛍光タンパク質を用いた最適化されたFRETベースのリゲーションアッセイを提示し、細菌のソルターゼ介在性リゲーション反応を直接モニタリングおよびスクリーニングすることを可能にするものであり、改良されたソルターゼ酵素および基質を開発するための多用途なハイスループットツールを提供する。
祖先配列復元を用いることで、研究者らは、現生酵素と比較して熱安定性、触媒活性、および立体選択性を著しく向上させたアリルマロン酸脱炭酸酵素の祖先を設計し、キラルカルボン酸の製造における主要な制限を克服した。
本研究は、糖脂質であるMPIaseが、前折畳み構造を持つタンパク質のプロトン駆動力を介した転位に不可欠な構成要素であることを示すことにより、細菌のTAT転位システムの初の再構成成功を報告するものである。
研究者たちは、tC19ZRNAポリメラーゼリボザイムの3.1 Åクライオ電子顕微鏡構造を決定することにより、活性を阻害する特定の異所的な塩基対形成相互作用を特定し、それによってリボザイムの伸長速度を加速させることに成功した補償的変異の設計を可能にし、ヌクレオチドに基づく自己複製という目標を前進させた。
本研究は、3種類の*Dysgonomonas gadei*由来GH172アラビノフラノシダーゼの異なる結合特異性と分岐した四次構造を特徴付け、同時に、それらの触媒メカニズムを明らかにし、複雑な生物学的試料における選択的なプロファイリングを可能にする共有結合阻害剤および活性部位標識プローブを開発するものである。
研究者らは、ラセミ化の問題を克服するために立体選択的な化学酵素合成法を用い、mTORC1の抑制とは独立したメカニズムを通じてCaco-2細胞におけるオートファジーを効果的に誘導する特定の2,5-ジケトピペラジン立体異性体を同定し、それらの活性における立体化学およびアミノ酸側鎖の特性の極めて重要な役割を強調した。
本論文は、ネイティブ膜プロテオミクスにおいて、膜タンパク質の構造的完全性、機能的コンフォメーション、および脆弱な集合体を維持することに成功しつつ、ペプチド信号強度を高め、下流のLC-MS/MS解析に向けて特定の代謝ネットワークを濃縮することを可能にする、ペプチドベースの界面活性剤技術であるPeptergentsを用いた、完全なデタージェントフリーのワークフローを導入するものである。
本研究は、Vps34によって合成される酵母液胞内のPI(3,4,5)P3が、頂点部の集合を調整し、トランスSNAREペアリングを促進するためにSNAREタンパク質Vam7を保持することを通じて、液胞融合に不可欠であることを示している。
本研究は、バイオインフォマティクス、反応速度論、および構造解析を組み合わせることにより、*Clostridium pasteurianum*における未注釈の芽胞形成関連タンパク質を、機能的なフェレドキシン-NADP+還元酵素として同定・特性評価し、その特異な構造的特徴、低い触媒効率、および芽胞形成過程におけるレドックス調節への潜在的な役割を明らかにしている。
本研究は、RubiconがUVRAGによって誘導されるBECN1 BARAドメインの構造変化を介してPI3KC3-C2複合体を選択的に阻害する構造的メカニズムを明らかにしており、この特定の相互作用を破壊することが、Rubicon遺伝子欠損と同等のレベルまでオートファジーおよびリソソーム機能を回復させるのに十分であることを示している。