727 件の論文
微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。
Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。
以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。
米国初の臨床的遺伝子型HSV耐性検査プログラムに関するこの6年間の回顧的研究は、フレームシフト変異がアサイクロビル耐性の主要な要因であることを確認すると同時に、今後の特性評価および治療決定の指針となる23種類の新規UL23変異を特定している。
本研究は、ケニア沿岸部のエジプトオオコウモリ（*Rousettus aegyptiacus*）から分離された、霊長類アルファヘルペスウイルスとの系統的な近縁性を共有し、その人獣共通感染症としての潜在性をさらなる調査に値する、2つの新規かつ近縁なアルファヘルペスウイルス株の分離および部分的なゲノム特性解析について報告するものである。
本研究は、空間トランスクリプトミクスを利用することで、ライム関節炎マウスモデルにおける関節微小環境が、感染のピーク時における炎症促進状態から抗生物質治療後の解像へと進化する、領域特異的な免疫シグネチャーおよび線維芽細胞表現型を決定していることを明らかにしている。
本研究は、SOS応答によるプロファージ誘導が、強力なSOS応答を持つ宿主を排除することによって、DNA損傷系抗生物質に対する耐性変異の頻度を制約する進化的なボトルネックとして機能し、それによって、SOS経路を減衰させるより稀で効果の高い変異を選択させ、最終的に、より高いレベルの耐性へと導くことを実証している。
本研究は、乳児の腸内成熟期における*Clostridioides difficile*などのスティックランド代謝細菌の獲得が、共有されたアミノ酸依存的な栄養ニッチをめぐる競合を通じて、*Clostridium botulinum*感染に対する耐性を付与することを明らかにしている。
Lifelines NEXTコホートからの1,110件の縦断的サンプルに対して包括的な二手法プロファイリング・アプローチを適用することにより、本研究は、動的な乳児腸内ウイルス叢が宿主因子および温和なファージのライフサイクル切り替えによって形成されること、および誘導された温和なファージと生後1年以内の湿疹の発症との間に特定の関連があることを明らかにしている。
本論文は、従来の単一アルゴリズムおよびディープラーニングによる手法と比較して、腸内細菌叢関連疾患の予測精度と堅牢性を大幅に向上させるために、複数の機械学習アルゴリズムを統合した2つの新しいスタッキングベースのハイブリッドアンサンブルモデル（EM1およびEM2）を提案するものである。
本研究は、新規の野生型タカリベウイルス分離株（DOM2014）に対するジャマイカフルーツコウモリの病原性と宿主応答を特徴づけ、非致死的な持続感染、軽度の肝疾患、および限定的な獲得免疫を明らかにしており、それによって、歴史的に使用されてきたマウス継代株TRVL-11573よりも生物学的に妥当なリザーバーモデルを確立している。
本論文は、腸内細菌叢のBacteroidotaとEscherichia coliの間における中心炭素代謝およびヌクレオシド共代謝の明確な代謝差を明らかにするための、13Cフラックス比解析を用いた機械学習ベースのワークフローであるFRAPPPEを導入するものである。
本研究は、大腸菌（*Escherichia coli*）が、PatA、GabT、およびIlvEの異なる基質特異性を伴う分岐型トランスアミナーゼ・ネットワークを介して、食事由来の最終糖化生成物であるNε-カルボキシメチルリシン（CML）を、CMLおよびその脱炭酸代謝物を新規中間体へと変換することにより、どのように窒素代謝へと組み込んでいるかを解明するものである。