Iron limitation alters diatom carbon flow through shifts in microbiome exometabolite consumption
鉄制限条件下では、珪藻の代謝産物組成が変化し、特定の細菌群が新たに固定された炭素の取り込みを減らす一方で芳香族化合物や脂質などを優先的に消費する代謝シフトを起こすことで、海洋における炭素循環のメカニズムが解明されました。
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microbiology
826 件の論文
Inactivation of the RB1 and PTPN14 tumor suppressors cooperatively enables the carcinogenic activity of the human papillomavirus E7 oncoprotein
本研究は、高リスク型ヒトパピローマウイルスの E7 タンパク質が、RB1 と PTPN14 という 2 つの腫瘍抑制因子を同時に不活化することで初めて、角化細胞の寿命延長やがん化を可能にするというモデルを、遺伝的相補実験を通じて実証したものである。
A structure-based epitope tagging approach identifies vulnerable sites on the malarial P36-P52 protein complex for antibody-mediated neutralization of Plasmodium sporozoites
本論文では、構造生物学的手法と機能実験を統合することで、マラリア原虫の肝細胞侵入に不可欠な P36-P52 複合体の膜遠隔側が抗体中和の脆弱部位であることを特定し、次世代の肝期マラリアワクチンや治療用抗体の開発に向けた新たな標的を提示しました。
Recapitulating whipworm development in vitro using caecaloids
この論文は、マウス回盲部由来のオルガノイド（回盲様体）を用いた新規培養系を開発し、 Whipworm（Trichuris muris）が宿主細胞内で持続的に成長・形態形成を行うことを実証するとともに、その発育過程を in vivo のデータと比較検証する包括的な基準を提供したことを報告しています。
Functional validation of the Plasmodium falciparum K13 C580Y mutation in recently collected Ethiopian isolates
CRISPR-Cas9 遺伝子編集を用いた機能検証により、エチオピアの最近の臨床分離株において、K13 C580Y 変異が実際にアルテミシニンの耐性を付与することが確認されました。
Evolved resistance against the type 6 secretion system is toxin specific
本論文は、T6SS による異なる種類の毒素（アミダーゼとリパーゼ）に対する耐性が、それぞれ異なる遺伝子変異を介して毒素特異的に進化し、一方で一方の毒素への耐性獲得が他方への感受性を高めるトレードオフを生むことを示し、これが多様な毒素を備えた T6SS 攻撃者に対する耐性の進化を制限し、T6SS の自然界での広範な存在を維持する要因であることを明らかにした。
Human cell F-actin density differentially influences trogocytosis and phagocytosis by Entamoeba histolytica
本研究は、人工的な細胞硬化ではなく Rho 経路遺伝子のノックダウンを用いたヒト細胞変異体による解析を通じて、Entamoeba histolytica による食作用（トロゴサイトーシスとファゴサイトーシス）が標的細胞の F-アクチン密度によって異なり、特にトロゴサイトーシスがすべての変異体で減少し、ファゴサイトーシスが皮質 F-アクチン密度と逆相関することを示し、生きた細胞における細胞骨格の動的性質が食作用に複雑に影響を与えることを明らかにしました。
Conserved protein sequence-structure signatures identify antibiotic resistance genes from the human microbiome
本研究は、タンパク質の保存された配列・構造シグネチャを活用した新規予測手法「ARG-PASS」を開発し、ヒトマイクロバイオームや AlphaFold データベースから臨床的に重要な耐性遺伝子や前耐性遺伝子を高精度に同定できることを実証しました。
The evolution of a Na+-sensitive Vibrio cholerae mutant unmasks the moonlighting aminopeptidase PepA as a regulator of nhaB Na+/H+ antiporter gene expression
Vibrio cholerae において、Na+/H+ 逆輸送体 NhaA と Na+-NQR の欠損による成長欠損は、Na+/H+ 逆輸送体 NhaB のプロモーター変異や、多機能アミノペプチダーゼ PepA の発現・DNA 結合活性の変化を介した抑制変異の獲得によって回復し、PepA が Na+ ホメオスタシスの新たな調節因子として機能することが明らかになりました。
TracePheno Enables Function-First Inference of Trace-ElementPhenotypes from Microbiome Profiles
TracePheno は、ゲノム注釈や予測された KO テーブルから、鉄や亜鉛などの 8 種類の必須微量元素に関連する微生物の表現型を、明確で生物学的に制約されたルールに基づいて推論し、解釈可能な可視化結果を提供する機能中心のフレームワークです。
Restraint of Powassan virus replication by TRIM5α facilitates viral avoidance of antiviral immunity
本研究は、霊長類の TRIM5α がダニ媒介性フラビウイルスの複製を抑制する一方で、Powassan ウイルスの NS3 遺伝子変異が TRIM5α の阻害を回避し、結果としてウイルスが早期の自然免疫認識を逃れることを可能にしていることを明らかにしました。
Discovery of novel antimicrobial resistance genes in food and fertiliser using a high-throughput gene capture and functional screening platform
本研究は、食品や肥料などの環境サンプルからインテグロン遺伝子カセットを直接捕捉・機能スクリーニングする新規プラットフォームを開発し、従来の配列解析では検出が困難だった新規抗生物質耐性遺伝子や既知の耐性遺伝子の存在を実証的に明らかにした。
Respiratory microbiota as a health biomarker in blue, fin and humpback whales: Pilot study in the Gulf of St-Lawrence (Quebec, Canada)
このパイロット研究では、カナダのセントローレンス湾でクジラ（シロナガスクジラ、ザトウクジラ、ミンククジラ）の呼気（ブロウ）から得られた微生物叢データを解析し、微生物多様性と健康状態（皮膚のコンディションや病原性細菌の存在）との関連性を示すことで、ブロウ微生物叢が非侵襲的なクジラの健康バイオマーカーとして機能しうることを初めて実証しました。
Host innate immune response profiling reveals hidden viral infections across diverse animal species
本研究は、野生動物や家畜の RNA-seq データから宿主の自然免疫応答（インターフェロン刺激遺伝子）を解析する新たなフレームワークを開発し、従来の手法では検出が困難だった多様な動物種における隠れたウイルス感染を大規模かつ効率的に同定したことを報告しています。
Virological investigation of elephant endotheliotropic herpesvirus 1B infection in an Australian captive herd of Asian elephants (Elephas maximus)
オーストラリアの飼育下アジアゾウ群における EEHV1B 感染の致死症例を調査した本研究は、臨床発症時の劇的なウイルス血症、保存媒体による検出効率の差異、および EEHV 亜種間の組換えを示すゲノム解析を通じて、このウイルスの病原性や診断・治療への示唆を明らかにしました。
Comparison of Galleria mellonella, Epithelial Cell Cytotoxicity, and Mouse Model of Bacteremia to Measure Pseudomonas aeruginosa Virulence
本論文は、105 株の緑膿菌臨床分離株を用いた比較研究により、マウス敗血症モデルにおける病原性と相関性が中程度に高いことが示されたワックスガの幼虫（Galleria mellonella）モデルが、大規模な集団レベルの病原性評価におけるマウスモデルの有効な代替手段となり得るが、最終的な結論はマウスでの検証が必要であることを示唆しています。
Free-Living Amoeba act as transient permissive hosts for Leptospira spp.
本研究は、自由生活性アメーバが病原性および腐生性のレプトスピラを貪食し、細胞内での増殖は伴わないものの最大 48 時間生存を可能にすることで、土壌環境におけるレプトスピラの持続と伝播に寄与する一時的な宿主として機能することを明らかにしました。
Integrated in vivo and transcriptomic analyses of lethal Oropouche virus infection reveal suppression of pathogenic host responses by antiviral therapy
ファビピラビルが致死性のオロポッチウイルス感染モデルにおいて、ウイルス複製と神経侵入を抑制し、宿主の病理的反応を軽減することで完全な保護効果を示すことを、in vivo 解析とトランスクリプトーム解析を通じて実証しました。
A microbial seedbank from a natural oil seep accelerates hydrocarbon degradation in freshwater oil spills
この論文は、ドイツの天然油湧出点から採取された微生物群集が、淡水環境での人為的油流出事故における炭化水素の分解を 30% 以上促進できることを示し、自然由来の微生物「種銀行」を利用した油流出対策の有効性を提唱しています。
An epigenetic mechanism of azole tolerance facilitates acquired antifungal resistance in Aspergillus fumigatus
本論文は、アスペルギルス・フミガツスにおいて、IngB タンパク質の欠損がアゾール耐性を促進し、その結果として迅速な薬剤耐性の獲得へと至るエピジェネティックなメカニズムを明らかにしたものである。