🧬 biology

Skinteractome: An online atlas of neuro-immune-stromal interactions in the human skin microenvironment

本論文は、単一細胞トランスクリプトミクスを活用し、健康な状態および炎症状態の両方におけるヒト皮膚の微小環境内での神経・免疫・ストロマ細胞間の細胞間コミュニケーションネットワークをマッピングおよび可視化する、インタラクティブなオンラインアトラスであるSkinteractomeを紹介するものである。

Pang-Yen Tseng2026-08-31
🧬 biology

Study on the mechanism of type 2 diabetes mellitus on tendon repair based on bioinformatics analysis combined with machine learning models

本研究は、メンデルランダム化解析、バイオインフォマティクス、および機械学習を統合することで、2型糖尿病と腱修復不全との間の因果関係を確立し、MYL2、MYL3、およびTTNを、細胞骨格の機能不全およびマクロファージを介した免疫変化を通じて治癒を阻害する可能性が高い主要なハブ遺伝子として特定している。

Shulong Sun, Hua Li, Guanghui Li, Yan Li, Liubing Yang, Yujing Cao, Ji Li2026-08-31
🧬 biology

3D µEFPocket for Multimodal Communications with Brain Organoids

本論文は、ヒト脳オルガノイドにおける光学的および電気的記録と並行して、高解像度な時空間的化学・電気刺激を可能にする、パリレンCから作製されたコンフォーマルで極薄のマイクロ流体バイオインターフェースであるµEFPocketを紹介するものであり、これにより3次元的な複雑性の課題を克服し、マルチモーダルな機能アッセイおよびクローズドループ研究を促進する。

Yihang Wang, Miguel Cuevas, Zhihan Zhang, Gooyoon Chung, Jingze Zhang, Yilan Yin, Qianzhi Luo, Will Lipman, Josh Henders (…)2026-08-31
🧬 biology

Exploration of Evolutionary Dynamics and Genomic Architecture in Acinetobacter baumannii

本研究は、パンゲノム、系統ゲノム、および組成解析を統合することで、世界的に優勢な*Acinetobacter baumannii*のST2系統が、水平伝播によって獲得された薬剤耐性遺伝子がゲノムアイランド内に安定して維持されるオープンなゲノム構造に依存していることを明らかにし、カルバペネム耐性に立ち向かうためには染色体、プラスミド、およびファージにわたる包括的なゲノムサーベイランスが極めて重要であることを強調している。

Rhythm Sharma, Dinesh Lakhanpal2026-08-31
🧬 biology

Long-read RNA-seq resolves isoform-level and context-specific regulatory architecture of complex traits in cattle

本研究は、432頭の乳牛から得られた集団規模のロングリードRNA-seqおよびマルチオミクスデータを利用して包括的なウシ・トランスクリプトーム・アトラスを構築し、数千の新規アイソフォームと文脈依存的な調節変異を明らかにすることで、複雑な形質の遺伝学における解像度を大幅に向上させ、従来のショートリード手法によって残された「欠落した調節」のギャップを埋めるものである。

Lingzhao Fang, Weijie Zheng, Qi Zhang, Jinfeng He, Xiaoning Zhu, Mian Gong, Houcheng Li, Lin Liu, Jianbin Li, Zhu Ma, Bo (…)2026-08-31
🧬 biology

Valorization of Shrimp Shell Waste: Crude Protease-Assisted Astaxanthin Extraction Using Bacillus cereus XT-1 and Functional Gene Analysis

本研究は、主要な35 kDa中性プロテアーゼを生成するために*nprC*遺伝子をアップレギュレートする*Bacillus cereus* XT-1が、抗酸化活性を高めた高収率かつ安定したアスタキサンチンをエビ殻廃棄物から抽出するための、効率的かつグリーンな生物学的製剤として機能することを実証している。

Xiaoxi Zeng, Lan Yu, Cheng Zhang, Keting Lei, Xuan Li, Yongjian Shao, Lingzhi Chen, Yang Fang, Jie Liu, Liang Ma2026-08-30
🧬 biology

Symbiodiniaceae shifts in the corals Acropora cf. solitaryensis and A. aff. divaricata at the climate-driven poleward margin

本研究は、気候変動に伴う北限への分布拡大が進む*Acropora cf. solitaryensis*および*A. aff. divaricata*の個体群が、高い宿主遺伝的多様性と連結性を維持している一方で、海水温の低下に起因すると考えられるC3系統からC1系統の共生藻へのシフトを特徴とする、明確に異なるSymbiodiniaceaeアセンブラージュ(共生藻組成)を示すことを実証している。

Nina Yasuda, Akifumi Shimura, Masumi Kamata, Hiroki Taninaka, Kenji Takata, Takashi Nakamura, Akira Iguchi, Takehisa Yam (…)2026-08-30
🧬 biology

Sexual evolution in plants: genetic network co-option and reproductive innovation

本レビューは、10億年以上前の祖先的な緑藻類に端を発する植物の有性生殖が、MADSボックス転写因子やホルモン系といった保存された遺伝子モジュールの反復的な共用、重複、および再編を通じて、いかにして陸上系統全体へと多様化してきたかを示す統合的な進化学的枠組みを提案するものである。

Vladimir Brukhin2026-08-30
🧬 biology

A Two-step Feature Selection Framework for Computationally Efficient Machine Learning on Genome-wide SNP Data

本論文は、分散に基づくハードフィルタリングとXGBoostを組み合わせた2段階の特徴量選択フレームワークを提案し、6100万個のSNPを計算可能なサブセットへと削減することで、膨大なリソースを必要とすることなく、大規模なゲノムデータセットを用いた機械学習による地理的起源予測を効率的に実現するものである。

Jinhyun Kim, Seungjun Lee, Daewon Lee, Seo Woo Song, Cheolheon Park, Huiran Yeom2026-08-30
🧬 biology

Cognitive appraisal and visual discomfort in severe trypophobia in a cognitive computational case study

この認知・計算論的なケーススタディは、深刻な集合体恐怖症が単に低次な視覚的特性のみから生じるのではなく、初期の視覚的トリガーが疾患や汚染の脅威に対するトップダウン的な認知的評価によって増幅されるという、統合的なプロセスから生じるものであることを示している。

Pouya Mokari Amjad, Ramina Bakhtiari Haftlang2026-08-29