🧬 biology
GeneRhythm uncovers gene expression rhythms that shape the dynamic transcriptional landscape in single-cell omics
本論文は、従来の時系列解析手法では捉えられないリズム的な制御プログラムや疾患に関連するダイナミクスを明らかにするために、単一細胞遺伝子発現解析を時間周波数領域へと再定式化する新しいフレームワークであるGeneRhythmを導入する。
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q-bio
1754 件の論文
🧬 biology
Gut microbiota of insectivorous bats in Japan harbor Chlamydophila psittaci and Shiga toxin-producing Escherichia coli: host species and location shape community structure
本研究は、日本における3種の食虫性コウモリの腸内細菌叢を特徴づけ、宿主種とサンプリング地点の両方がコミュニティ組成を大きく規定していることを明らかにするとともに、他の病原体である*Bacillus cereus*や志賀毒素産生*Escherichia coli*に加えて、*Chlamydophila psittaci*が初めて検出されたことを特定しており、それによってワンヘルスに向けた野生動物のマイクロバイオーム監視の重要性を強調している。
🧬 biology
Cell-Size-dependent of bacterial communities antibiotic resistome profiles and risk assessment in a river: A metagenomic analysis
このメタゲノム研究は、小サイズ（0.1–0.45 µm）および大サイズ（>0.45 µm）の河川細菌が異なる抗生物質耐性遺伝子の組成と宿主コミュニティを示す一方で、最終的には同等の薬剤耐性リスクをもたらすことを明らかにしており、環境レジストームにおける小サイズ細菌の重要かつこれまで見過ごされてきた役割を浮き彫りにしている。
🧬 biology
Performance of a fine-scale positioning acoustic telemetry array in a deep freshwater ecosystem
本研究は、深層淡水生態系における高精度な位置特定用音響テレメトリー・アレイを評価し、検出効率はタグの出力、受信機の間隔、および温度によって変化するものの、受信機の間隔を400〜800メートルに設定することで、動物の正確な位置特定において本システムが有効に機能することを明らかにしている。
🧬 biology
Early-life stress shapes tissue-specific gut-brain metabolomic and microbial profiles in laying hens
本研究は、採卵鶏における生後早期のストレスが、成鳥期において腸脳相軸に沿った持続的かつ組織特異的な代謝および微生物叢の再編を誘発することを示しており、それは血漿中の全身プロファイルにはほとんど影響を与えない一方で、回腸および脳における局所的な脂質および酸化還元状態の変化を特徴としている。
🧬 biology
Comparative Ion Channel Transcriptomes of NK1R and Somatostatin Neurons in the preBötzinger Complex of the Ventrolateral Medulla
本研究は、単一核RNAシーケンシングを用いて、preBötzinger複合体におけるTacr1+ニューロンおよびSst+ニューロンの異なるイオンチャネル・トランスクリプトームを特性化し、Tacr1+ニューロンが、呼吸リズムの生成におけるその決定的な役割を支えていると考えられるTRPC5、NALCN、および特定の神経修飾受容体の協調的なアップレギュレーションを含む独自の分子シグネチャーを有していることを明らかにしている。
🧬 biology
Host induced microRNA hsa-miR-643 promotes Mycobacterium tuberculosis survival inside macrophages by downregulating Gins2
本研究は、宿主マイクロRNAであるhsa-miR-643がGins2を直接標的としてダウンレギュレーションすることにより、マクロファージ内における結核菌の生存を促進し、それによってアポトーシスを抑制することを示しており、hsa-miR-643が結核の潜在的な治療標的であることを示唆している。
🧬 biology
Genomics and transcriptomics of nervous system from Rhodnius prolixus, and its modulation after a blood meal in an immature stage
本研究は、改良されたゲノムデータとトランスクリプトーム解析を用いて、シャーガス病の媒介者であるロドニウス・プロリクスス（*Rhodnius prolixus*）の神経系を特徴付け、第5齢幼虫における吸血が生理学的プロセスに関与する遺伝子の広範な発現低下を引き起こすことを明らかにし、これは飢餓状態の反応的な状態から、摂食後の反応性の低い状態への移行を示唆している。
🧬 biology
Molecular dynamics simulation of the effect of initial temperature and initial pressure on thermal behavior and cavitation dynamics in tumor tissue
本研究は、分子動力学シミュレーションを用いて、初期の温度および圧力の変化（それぞれ280–310 Kおよび0–2 bar）は腫瘍組織モデルの飽和温度や平衡温度を変化させない一方で、非単調な傾向を通じて構造的膨張や熱伝導率に著しい影響を及ぼし、原子間距離と原子移動度のバランスにより1 barにおいて最適な熱的および構造的特性が観察されることを実証するものである。
🧬 biology
Natural Phenolic Acids Modulate Memory and Anxiolytic Behavior in Adult Zebrafish (Danio Rerio): Serotonergic Involvement, Oxidation-Dependent Activity, Quantum Calculations, and Molecular Docking Highlight Sinapic acid
本研究は、天然のフェノール酸、特にシナピン酸が、行動解析、分子ドッキング、および量子計算によって確認されたように、セロトニン作動性メカニズムおよび酸化依存的な活性を介して、成体ゼブラフィッシュに対して用量依存的な抗不安作用および記憶保持効果を発揮することを実証している。