🧬 biology

Grassland species loss over the past decade in a highly fragmented landscape with an extinction debt

断片化した日本の景観における草原植物群落の10年間にわたる再調査により、顕著な種の喪失と群集の崩壊は、近年の生息地の破壊と、絶滅負債として存続する歴史的な景観変化の両方によって引き起こされており、これらの遅延効果は空間スケールや植物の機能群によって異なることが明らかになり、生息地保全と並行した積極的な修復の必要性を強調している。

TOMOYO F. KOYANAGI, ASUKA KOYAMA2026-09-16
🧬 biology

In vivo base editing rescues hearing in humanized MPZL2 mice within a structure-dependent therapeutic window

本研究は、デイテルス細胞の構造が維持されている限り、蝸牛の成熟後であっても、in vivoでの塩基編集がDFNB111のヒト化マウスモデルにおいて聴力を効果的に回復させ得ることを示しており、それによって、治療の窓を決定する決定的な要因は、暦年齢ではなく構造的完全性であることを立証している。

Sang-Yeon Lee, Sangsu Bae, Sohyang Jeong, Byeong-Hee Kang, Won Hoon Choi, Yeji Choi, Hansol Koo, Woo Seok Byun, Yejin Yu (…)2026-09-16
🧬 biology

Uncovering the landscape of functional transition and plasticity in the tumor microenvironment

本研究は、肺腺癌および大腸癌を解析することにより、腫瘍微小環境内における機能的可塑性の景観をマッピングし、免疫抑制に関連する腫瘍特異的な一過性の骨髄系細胞状態、および多様な細胞型が類似した機能的状態へと広く収束していく様を明らかにしている。

Riddhiman Dhar, Subhasis Datta, Rakesh Mandal, Sohom Basak2026-09-16
🧬 biology

Can Machine Learning Identify Meaningful Patterns in DNA Sequences? A Computational Study of DNA Motifs Associated with Transcription-Factor Binding

この独立した計算科学的研究は、機械学習分類器、特にランダムフォレストが、短いk-mer頻度特徴量を用いることで、CTCF結合DNA配列をジヌクレオチドシャッフルされた背景から効果的に区別できることを実証しており、それによって分子生物学と応用機械学習を統合するための、透明かつ再現可能なエンドツーエンドのワークフローを確立している。

Hafsa Asmatullah2026-09-16
🧬 biology

Metazoan-wide phylogenomics supports the emergence of recognisable canonical prostanoid-receptor family structure across the vertebrate transition

この後生動物全域にわたる系統ゲノム学的研究は、プロスタノイド受容体の標準的な8家族構造が脊椎動物に特有の革新であることを実証しており、以前に提案されていた非脊椎動物のホモログは、実際には異なる受容体系統であり、その脊椎動物のEP4受容体への外見上の類似性は、真のオーソログではなく系統的な近接性に由来するものであることを明らかにしている。

Sebastiano Scibelli2026-09-16
🧬 biology

Network pharmacology and experimental evidence implicate ERα-associated β-catenin regulation in the osteoprotective effects of sea buckthorn fruit extract

本研究は、シーバックソーン果実エキスが、ERαを介したβ-カテニン・シグナルのアップレギュレーションを通じて、骨形成を促進し骨吸収を抑制することにより、卵巣摘出マウスにおいて骨保護効果を発揮することを実証している。

Liangliang Wei, Yong Wang, Zhihao Xia, Lei An, Kai Zhou, Shaobo Wu, Jiajia Ji, Yuxing Ye, Leyi Zhao, Junming Liang, Dage (…)2026-09-16
🧬 biology

Beyond aquatic and terrestrial: a multitaxon, large-scale perspective reveals the distinct biodiversity of non-perennial rivers

環境DNAを用いた大規模かつ多分類群にわたる解析を通じて、本研究は、非恒久河川が恒久河川や陸域土壌のいずれとも異なる、独自かつ多様なコミュニティを宿していることを実証しており、それらが単なる移行的な系であるという見解に異を唱え、世界の生物多様性におけるそれらの極めて重要な役割を強調している。

Naiara López-Rojo, Arnaud Foulquier, Romain Sarremejane, Daniel von Schiller, Klement Tockner, Rachel Stubbington, Aitor (…)2026-09-16
🧬 biology

Beyond Taxonomic Profiles: An Evidence-Informed Framework for Interpreting Gut Microbiome Alterations in Sickle Cell Disease

この系統的レビューは、鎌状赤血球症における腸内細菌叢に関する異質なヒトの証拠を統合することで、一貫性のない分類学的プロファイルを超え、機能的な代謝変化に関する検証可能な仮説へと向かう、エビデンスに基づいた枠組みを提示するものである。

Tarimoboere Agbalalah2026-09-16
🧬 biology

Simulated Annealing Identifies Five Shared Drivers of T Cell Exhaustion Across Four Human Cancers

本研究は、4種類のヒト癌の単一細胞RNAシーケンシングデータに新しいシミュレーテッド・アニーリング・フレームワークを適用することにより、5つの保存されたT細胞枯渇ドライバーと20の新規候補遺伝子を特定するとともに、NR4A1のような既報のマーカーの普遍的な役割に異を唱える組織特異的な枯渇シグネチャーを明らかにしている。

alireza ebadi2026-09-16✓ Author reviewed
🧬 biology

Invasive lobular carcinoma is characterized by IL33-high differentiated endothelium and IL33 receptor-positive mast-cell enrichment

本研究は、浸潤性小葉癌が、IL33高発現の分化内皮、減少した血管新生出芽、およびIL1RL1を発現する肥満細胞の集積によって特徴付けられる独自の血管免疫微小環境を有しており、これらが総体として浸潤性乳管癌と浸潤性小葉癌を区別していることを明らかにしている。

Jules Cohen2026-09-16