🧬 生物学

Lectin gene families in Medicago truncatula: genome-wide identification, in silico characterization, and expression under rhizobial symbiosis and drought stress

本研究は、メディカゴ・トルンカタゥラ(*Medicago truncatula*)のレクチン遺伝子に関する包括的なゲノムワイド解析を提示し、それらの構造的多様性、タンデム重複による拡大、および根粒菌共生と乾燥ストレスに対する有意な転写応答を明らかにしている。

Beaven Manjengwa2026-10-08
🧬 生物学

Metagenomic insights into the soil microbiome of ex situ Cathaya argyrophylla: differentiation patterns and implications for conservation

本研究は、メタゲノム解析および土壌理化学分析を用いることで、絶滅危惧種であるカサマツ(*Cathaya argyrophylla*)の域外保全土壌における細菌、古細菌、および真菌コミュニティの明確な分化パターンと環境要因を明らかにし、同時に、将来的な保全管理戦略に資するために、その根圏における免疫撹乱機能遺伝子の高含有性を特定するものである。

Jingyuan Luo, Xiaoming Tian, Zhaoshan Wang, Hao Lv2026-10-08
🧬 生物学

Rank-based integration identifies convergent disease mechanisms across omics

本論文は、慢性腎臓病および拡張型心筋症のデータセットへの適用を通じて示されたように、プラットフォームやコホートの差異を克服することにより、異種オミクス層にわたる強固で一致した疾患メカニズムを効果的に特定する、方向性を考慮したランクベースの統合ツールであるORBITを紹介するものである。

Yang Luo, Zifeng Qiu, Duncan Palmer, Luke Jostins-Dean, Andrew Lewis, Katherine Bull, Jagdeep Nanchahal2026-10-08
🧬 生物学

Uncovering aquatic diversity patterns in Plecoptera and Trichoptera (Insecta) immatures in the riffles of the Xingu River

本研究は、環境勾配はシングー川の瀬におけるカワゲラ目およびトビケラ目の集合パターンを有意に説明しなかった一方で、分類学的ベータ多様性は主に属の置換によって、機能的ベータ多様性は均衡した個体数変化によって駆動されており、アマゾンの水生昆虫多様性を評価する上でのこれらの指標の重要性が浮き彫りになったことを明らかにしている。

Eduarda Silva de Lima, Larissa Sousa de Barros, Ana Gabrielle Nascimento dos Santos, Emilly Vieira Drosdosky, Iluany da (…)2026-10-08
🧬 生物学

Cross-kingdom Microbial Reassembly During Organic Amendment-Assisted Biodegradation of PAHs in Soil

本研究は、落葉有機物の添加が、用量依存的な態様で土壌細菌・真菌コミュニティおよびそれらの界を越えた相互作用を再構築し、機能的な再構築と特定の集合プロセスを通じて多環芳香族炭化水素(PAHs)の生物分解を促進すること、そして高い添加レベル(70%)が著しい攪乱と回復の低下を引き起こすことを示している。

Olanrewaju Roland Akinseye, Charles W. Knapp2026-10-08
🧬 生物学

EukaUTR: a foundation model unifying functional modelling and design of eukaryotic 3′ UTRs

EukaUTRは、多様な真核生物の3′ UTR配列を用いて学習された基盤モデルであり、機能予測とde novo設計を統合することで、複数の制御タスクにおいて既存のベースラインを凌駕し、mRNA分解率を低減するための標的配列最適化を可能にする。

Xiaolin Li, Mei Lang, Xingyu Fang, Mingxuan Chen, Zhen Wang, Zhaowen Cheng, Xiagu Zhu, Kin Yip Tam, Junwei Zhang2026-10-08
🧬 生物学

Precise templated editing using endogenous DNA polymerases

本論文は、DNAテイルを備えたガイドを用いて内因性DNAポリメラーゼを動員することで、多様な標的および細胞モデルにおいて、外因性ポリメラーゼを用いない精密なゲノム編集を実現する、CRISPR-Cas9ベースの技術であるTHORを紹介するものである。

Marcello Maresca, Laura Torella, Pragya Gupta, Anna Shiriaeva, Audrey Gallud, Astrid Mentani, Joanna Szydzik, Morena D'A (…)2026-10-08
🧬 生物学

Toward a Transferable Representation of Protein Dynamics for Functional Prediction and Mechanistic Discovery

本論文は、タンパク質の構造ダイナミクスを転移可能な「タンパク質運動シグネチャー」へとエンコードすることで、多様なタンパク質ファミリーにわたって高精度な機能予測とメカニズムの洞察を実現する、トポロジー不変動的グラフネットワーク(Topology Invariant Dynamic Graph Network: TIDGN)というディープラーニングフレームワークを導入するものである。

Nahid Monowar2026-10-08
🧬 生物学

One Breed, Different Gene Pools? Country-Associated Genomic Structure Across Pedigree Cat Breeds

本研究は、国に関連するゲノム分化が6つの血統登録された猫の品種間で大きく異なることを示しており、デボンレックススが最も高い分岐を示しメインクーンが最も低いことは、同一品種の地理的なサブセットが、異なる創始者効果や遺伝子流動のパターンを経験し得ることを示唆している。

Baptiste Dumoulin2026-10-08