🧬 biology

GraphTransformer-CoGNN: A two-stage dynamic graph learning framework for label-scarce cell-type annotation in spatial transcriptomics

本論文は、抵抗距離エンコーディングを備えたGraph TransformerとCooperative GNNを組み合わせた2段階の動的グラフ学習フレームワークであるGraphTransformer-CoGNNを提案しており、これは、グラフ構造を適応的に洗練させ、偽の接続を抑制することにより、ラベルが不足している条件下での空間トランスクリプトミクスにおける最先端の細胞型アノテーションを実現するものである。

Yuanyuan Dang, Xinyi Han, Bing Liu2026-08-12
🧬 biology

XG-PUL: A Network-Based Framework for Disease Gene Prioritization Using Graph Representation Learning and Positive-Unlabeled Learning

本論文は、生物学的ネットワークにおけるラベルの不確実性という課題に対処することで、疾患関連遺伝子を効果的に優先順位付けするために、Node2Vecベースのグラフ表現学習とバギングベースの正ラベル・未ラベル(positive-unlabeled)分類器を組み合わせた、堅牢な機械学習フレームワークであるXG-PULを提案する。

Mahdiyeh Ayouman, Zahra Narimani2026-08-12
🧬 biology

Characterization of corneal epithelium and endothelium with scanning electron microscopy in three avian species

本研究は、走査電子顕微鏡を用いて、3種の鳥類(アオシロアオサギ、カワラバト、およびアカハラツグミ)における角膜上皮細胞および角膜内皮細胞の超微形態、細胞密度、ならびに表面構造を特徴付け、カワラバト目およびスズメ目における初の記述を提供するものである。

Clarissa Machado Carvalho, Rosélia LS Araújo, Paula Diniz Galera2026-08-12
🧬 biology

Multiple species of native mosquitoes may be involved in Usutu virus circulation and maintenance in temperate zones

本研究は、温帯域のイングランドにおける複数の在来種のアカイエカ(*Culex pipiens* s.l.)が、ウスツウイルス(Usutu virus)の循環と維持において重要な役割を果たしていることを実証しており、系統解析によって異なるウイルス系統の共循環が確認されるとともに、温暖な天候が伝播を促進する可能性が示唆されている。

Robert Calam Bruce, Anthony J. Abbott, Bathsheba L. Gardner, Amy C. Edwards, Harrison Hardy, Mirjam Schilling, Andra-Mar (…)2026-08-12
🧬 biology

Peripheral blood transcriptomic reanalysis prioritizes a neutrophil– matrix metalloproteinase axis and doxycycline in adult tuberculous meningitis

本研究は、成人の結核性髄膜炎患者の末梢血トランスクリプトームデータを再解析することで、主要な病理学的特徴として好中球ーマトリックスメタロプロテアーゼ軸を特定し、それによってドキシサイクリンを実験的検証に向けた有望な宿主指向性療法として優先順位付けするものである。

Shuaijia Zeng, Xiaodong Zhang, Xing Cao, Quansheng Liu, Xue Chen, Aili Jia, Xing Chen, Jinhu Wen, Junhao Chu2026-08-12
🧬 biology

Comparative benchmarking of AI research agents for omics data interpretation

本研究は、オミクスデータの解釈における3つの特化型AIリサーチエージェント(K-Dense、Finch、Biomni)とChatGPTとの包括的な定量的ベンチマークを提示しており、単一のエージェントがすべてのモダリティにおいて優位に立つことはなく、ベースモデルの能力よりもエージェントのアーキテクチャこそが、出力の質および特定のバイオインフォマティクス・ワークフローへの適合性を決定する主要な要因であることを明らかにしている。

Nikita V. Basov, Yosef K. Tirta, Zihan Li, Huan Zhou, Kiryl D. Piatkevich2026-08-12
🧬 biology

MSI-stratified analysis of TREM2 and HAVCR2 expression in mucinous colorectal adenocarcinoma: a structured analytical workflow with signature de-circularization

本研究は、大腸癌におけるTREM2とHAVCR2の間の強力なバルクレベルの転写相関が、粘液型組織型ではなく、主にマイクロサテライト不安定性が高い(MSI-H)状態によって駆動されていることを示しており、免疫トランスクリプトミクス研究において誤解を招く関連性を回避するためのMSI層別解析およびシグネチャーの脱循環化の必要性を強調している。

Qiwen Duan2026-08-12
🧬 biology

Whole-Genome Characterization of Carbapenem Resistance Determinants in Multidrug- Resistant Acinetobacter baumannii from Clinical and Patient-Environmental Isolates

本研究は、インドのミスルにおける臨床および環境由来の多剤耐性アシネトバクター・バウマニ分離株110株の表現型およびゲノムプロファイルを特徴付け、カルバペネマーゼ遺伝子であるblaOXA-23の普遍的な存在とともに、blaOXA-66およびblaNDM-1の高頻度な検出を明らかにしており、これは医療現場におけるカルバペネム耐性の拡大を抑制するための、ゲノムサーベイランスおよび感染管理対策の強化という極めて重要な必要性を強調するものである。

Monisha B, Rashmi P. Mahale, Morubagal Raghavendra Rao, Suchitra Shenoy M2026-08-12
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TDP-43 loss drives premature aging and regenerative failure in skeletal muscle stem cells

本研究は、ALSに関連するTDP-43の機能獲得型変異は筋肉の恒常性を損なわない一方で、骨格筋幹細胞におけるTDP-43の完全な欠失は、早期老化、幹細胞の枯渇、および深刻な再生不全を引き起こすことを示している。

Sonia Alonso-Martin, Oihane Pikatza-Menoio, Haser Sutcu, María Rodríguez-Hidalgo, Amaia Elicegui, Ainhoa Vidal-Gil, Mari (…)2026-08-12
🧬 biology

MicroRNA-155-5p modulates apoptosis via targeting sirtuin-1 in eosinophilic meningoencephalitis induced by Angiostrongylus cantonensis

本研究は、ประเทศไทยの広東住血線虫(*Angiostrongylus cantonensis*)が誘発する好酸球性髄膜脳炎において、アップレギュレートされたmiR-155-5pがSirtuin-1を標的として抑制し、それによってNF-κB経路を活性化させ、マイクログリア細胞におけるアポトーシスを誘導することを実証している。

Chung-Fu Hsu, Ke-Min Chen, An-Chih Chen, Kuang-Ping Lan, Cheng-You Lu, Yen-Yun Lin, Shih-Chan Lai2026-08-12