Integrating Mechanistic Modeling and Machine Learning to Study CD4+/CD8+ CAR-T Cell Dynamics with Tumor Antigen Regulation

이 논문은 CD4+/CD8+ CAR-T 세포의 역학을 규명하기 위해 기계적 모델링과 머신러닝을 통합하여, 모델의 민감도 분석을 통해 치료 성패의 주요 인자를 도출하고 파라미터 불확실성 하에서 머신러닝이 예측 신호를 복원하는 방식을 제시합니다.

Saranya Varakunan, Melissa Stadt, Mohammad KohandelWed, 11 Ma🧬 q-bio

Understanding the temperature response of biological systems: Part I -- Phenomenological descriptions and microscopic models

이 논문은 효소 반응부터 개체군 수행 능력에 이르기까지 다양한 생물학적 온도 반응 현상을 설명하는 현상론적 모델과 미시적 모델을 개관하고, 최적 온도 및 열적 범위와 같은 운영적 정의를 제시하며, 다중 반응의 상호작용을 통한 시스템 수준의 온도 반응 곡선 도출은 후속 논문에서 다룰 것임을 밝힙니다.

Simen Jacobs, Julian Voits, Nikita Frolov, Ulrich S. Schwarz, Lendert GelensWed, 11 Ma🧬 q-bio

Exploring Strategies for Personalized Radiation Therapy Part IV: An Interaction-Picture Approach to Quantifying the Abscopal Effect

이 논문은 PULSAR 치료의 맥락에서 양자역학의 상호작용 그림 (interaction-picture) 기법을 차용하여 원발성 및 전이성 종양 간의 상호작용 강도를 정량화하고, 흡사상 (abscopal) 효과를 이분법적 반응이 아닌 연속적인 확률적 현상으로 규명하는 새로운 프레임워크를 제시합니다.

Hao Peng, Laurentiu Pop, Kai Jiang, Faya Zhang, Debabrata Saha, Raquibul Hannan, Robert TimmermanWed, 11 Ma🧬 q-bio

The Black Death Anomaly: A Non-Abelian Field Theory of Epidemiological Safe Zones

이 논문은 도이 - 펠리티 형식주의를 활용하여 비아벨 게이지 이론을 역학 모델에 도입함으로써, 중세 흑사병의 유전적 방사 현상과 폴란드 및 보헤미아 같은 역사적 안전 지대가 통계적 우연이 아닌 위상학적 공백으로 필연적으로 발생했음을 수학적으로 규명했습니다.

Jose de Jesus Bernal-Alvarado, David DelepineWed, 11 Ma🧬 q-bio

Automated Classification of Homeostasis Structure in Input-Output Networks

이 논문은 복잡한 생물학적 네트워크에서 항상성 메커니즘을 식별하고 분류하는 데 필요한 계산적 난제를 해결하기 위해, 네트워크 토폴로지만으로 항상성 하위 네트워크와 조건을 자동으로 도출하는 확장 가능한 파이썬 기반 알고리즘을 개발하고 그 유효성을 다양한 생물학적 사례를 통해 입증했습니다.

Xinni Lin, Fernando Antoneli, Yangyang WangWed, 11 Ma🧬 q-bio

Compact Dynamical Mean-Field Theory of Oscillator Networks

이 논문은 위상 오실레이터 네트워크의 무질서와 결합을 다루기 위해 위상 주기성을 명시적으로 보존하는 압축 동적 평균장 이론 (DMFT) 을 제안하며, 이를 통해 무질서가 없는 극한에서 오토-안토나센 축소와 표준 쿠라모토 방정식을 복원하고 적응형 지수 적분 - 방출 뉴런과 같은 생리학적 모델의 위상 응답 곡선을 네트워크 수준의 동기화 예측으로 직접 연결하는 방법을 제시합니다.

Kanishka ReddyWed, 11 Ma🧬 q-bio

Misspecification of the generation time distribution and its impact on Rt estimates in structured populations

이 논문은 구조화된 인구 집단에서 생성 시간 분포의 오지정이 Rt 추정치에 미치는 영향을 분석하고, 단일 집단 모델을 사용할 때 집단 간 변이를 올바르게 반영하는 생성 시간을 선택하는 방법론을 제시하여 공중보건 정책 수립을 위한 Rt 추정의 정확성을 높이는 방안을 모색합니다.

Ioana Bouros, Robin Thompson, David Gavaghan, Ben LamberWed, 11 Ma🧬 q-bio

Association of Radiologic PPFE Change with Mortality in Lung Cancer Screening Cohorts

이 연구는 두 개의 대규모 폐암 선별 코호트를 분석한 결과, 저선량 CT 를 통해 정량화한 폐쇄성 폐섬유증 (PPFE) 의 진행이 사망률 및 호흡기 관련 임상 결과와 독립적으로 연관됨을 확인하여, PPFE 진행 정량 평가가 선별 프로그램 내 고위험군 식별을 위한 유용한 영상 바이오마커가 될 수 있음을 시사합니다.

Shahab Aslani, Mehran Azimbagirad, Daryl Cheng, Daisuke Yamada, Ryoko Egashira, Adam Szmul, Justine Chan-Fook, Robert Chapman, Alfred Chung Pui So, Shanshan Wang, John McCabe, Tianqi Yang, Jose M Brenes, Eyjolfur Gudmundsson, The SUMMIT Consortium, Susan M. Astley, Daniel C. Alexander, Sam M. Janes, Joseph JacobWed, 11 Ma🧬 q-bio

Modeling the spillover risk of highly pathogenic avian influenza from wild birds to cattle in Denmark: A data-driven risk assessment framework

이 논문은 2024 년 미국에서 발생한 조류 인플루엔자 바이러스의 소 전파 사례를 기반으로 덴마크의 야생조류에서 소로의 전파 위험을 정량적으로 평가하는 데이터 기반 모델을 개발하여, 계절적·공간적 위험 요인을 규명하고 표적 감시 전략 수립에 기여함을 보여줍니다.

You Chang, Jose L. Gonzales, Erik Rattenborg, Mart C. M. de Jong, Beate ConradyThu, 12 Ma🧬 q-bio