502 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Dit artikel beschrijft hoe genomische surveillance en fylodynamische modellen de uitbraak van *Mycoplasma bovis* ST21 in Nieuw-Zeeland tussen 2017 en 2023 hebben gekenmerkt, waarbij maatregelen zoals bewegingsbeperkingen en uitdoving in 2020 tot een drastische daling leidden, gevolgd door drie jaar aan persistente infecties die uiteindelijk leidden tot de mogelijke uitroeiing van de ziekte.
Dit onderzoek toont aan dat de droogtetolerantie van *Dianthus inoxianus* voortkomt uit een strategie die constitutieve aanpassing combineert met gerichte transcriptomische plasticiteit in sleutelmoleculaire paden, waarbij de meeste fenotypische eigenschappen stabiel blijven behalve water- en osmotisch potentiaal.
Deze studie presenteert een uitgebreid atlas van transcriptomische en proteomische data voor 75 menselijke skeletspieren, waardoor de moleculaire diversiteit, de rol van genregulatie en de link met genetische aandoeningen in detail in kaart worden gebracht.
In dit artikel wordt het nieuwe geslacht *Aimea* beschreven, bestaande uit drie nieuwe plant-geassocieerde gistsoorten in de Microbotryomycetes, die worden gekarakteriseerd door fysiologische tests, transcriptoom-gesponsorde genoomsequencing, fylogenetische analyses en een bewezen genetische transformeerbaarheid.
Deze studie presenteert hoogwaardige genoomsequenties van de genus *Palythoa* die inzicht bieden in de evolutionaire aanpassingen en het ontbreken van specifieke polyketide-synthase-genen, wat suggereert dat de biosynthese van het krachtige palytoxine mogelijk voortkomt uit bestaande metabole routes en co-evolutie met symbionten.
Dit artikel introduceert Ribo-ITP, een methode die het mogelijk maakt om duizenden nieuwe translatiegebieden (translons) te identificeren in beperkte monsters, zoals micro-gedissecteerd weefsel en embryo's, en bevestigt hun functionele potentieel via GFP-rapporters en machine learning.
Deze studie presenteert een hoogwaardig genoom en transcriptoom voor de invasieve zeezak *Ascidiella aspersa*, combineert deze met vergelijkende analyses van 35 andere tunicaatsoorten om evolutionaire kenmerken en fylogenetische relaties op te helderen, en introduceert de TUNOME-database als fundamentele resource voor toekomstig onderzoek.
Deze paper introduceert Deep-Plant, een toezicht-gebaseerd fundamenteel model dat chromatinestatus voorspelt uit genomische sequenties voor Arabidopsis en rijst, en zo een effectiever en sneller alternatief biedt voor zelftoezicht-gebaseerde taalmodellen in de plantregulerende genomica.
De auteurs presenteren DiffDriver, een krachtige statistische methode die aantoont dat de selectiedruk op kankergenen sterk varieert afhankelijk van individuele contexten zoals omgevingsfactoren en het immuunsysteem, waardoor 33% van de bekende drijfgenen contextafhankelijke selectie vertoont.
Dit onderzoek identificeert via lang-read sequencing en CRISPR-Cas9 een tweede thyroglobuline-achtig gen (HaVipR2) dat door een transposable element wordt verstoord en zo een nieuw mechanisme voor Vip3Aa-resistentie in de katoenbolworm (Helicoverpa armigera) onthult.