🧬 Category

q-bio

4401 papers

🧬 biology

CAST as a Tumor-Specific Suppressor in Colorectal Cancer: Discovery Through Integrative Analysis of Unannotated Isoforms, Proteomics, and Epigenetic Regulation

Door middel van een integratieve analyse van single-cell long-read sequencing, proteomics en epigenetische data identificeert deze studie CAST als een tumorspecifieke suppressor in colorectaal carcinoom die wordt gereactiveerd via promoterdemethylatie en wordt gereguleerd door de miR-200 familie, waarmee een generaliseerbaar kader wordt vastgesteld voor het ontdekken van therapeutische doelwitten uit ongeannoteerde isoformen.

alireza ebadi, Maryam Hashemi2026-09-18
🧬 biology

A Computational Cancer GWAS Screen Highlights Structural Variation at the 7q22.1 Locus Near STAG3

Deze studie toont aan dat een computationele screening die short-read en long-read sequencing data integreert, een significante verrijking van structurele varianten onthult bij meiose-specifieke genloci die overlappen met GWAS-signalen voor kanker, waarbij specifiek een nieuwe 442 bp deletie nabij het *STAG3*-gen wordt geïdentificeerd als een kandidaat-driver op de 7q22.1 colorectale kankergevoeligheidslocus die door short-read sequencing alleen gemist zou zijn.

Koushik Chowdhury2026-09-18
🧬 biology

The Changing Landscape of Genetic Risk: Age-Related Effects of Polygenic Scores for Suicidal Behaviors

Deze studie van de Add Health-cohort onthult dat polygene risicoscores voor suïcidale ideatie en pogingen bescheiden maar significante associaties met uitkomsten vertonen, uitsluitend in de vroege volwassenheid en de vroege middenleeftijd, in plaats van tijdens de adolescentie, wat suggereert dat huidige genetische risicomodellen gebaseerd op gegevens van volwassenen mogelijk niet de leeftijdspecifieke risico's vastleggen en het belang benadrukt van leeftijdsspecifieke genoombrede associatiestudies om gerichte preventiestrategieën te verbeteren.

Nathan Gillespie, Severine Lannoy, Mallory Stephenson, Robert Kirkpatrick, Zuriel Ceja, Miguel Renteria, Alexis C. Edwar (…)2026-09-17
🧬 biology

Lactylation of histone variant MacroH2A1 at K134 regulates osteogenic differentiation of bone marrow mesenchymal stem cells

Deze studie onthult dat lactylering van het histonvariant MacroH2A1 op lysine 134 de osteogene differentiatie van beenmerg-mesenchymale stamcellen epigenetisch onderdrukt door de toegankelijkheid van chromatine te beperken, en dat het blokkeren van deze modificatie de botmassa bij osteoporotische muizen herstelt, waarmee het wordt geïdentificeerd als een nieuw therapeutisch doelwit voor osteoporose.

Jianyun Liu, Baicheng Ma, Xingnuan Li, Kai Long, Shan He, Ping Wu, Xiaoyuan Xu, Ling Long, Tao Wang, Jianjun Xiong2026-09-17
🧬 biology

EDTA preserves high molecular weight DNA across tissues of diverse species stored at room temperature for more than five years

Deze studie toont aan dat langdurige opslag van diverse weefselmonsters bij kamertemperatuur in EDTA hoogmoleculair DNA effectiever conserveert dan ethanol of verse extractie, ondanks het veroorzaken van enige weefseldissolutie, terwijl het ook onthult dat het EDTA-supernatant zelf een waardevolle bron vormt voor terugwinbaar genomisch DNA.

Molly Johnson, Mia L. DeSanctis, Ella Messner, Eris Niles, Elizabeth A. Soranno, Hannah J. Appiah-Madson, Rosalia Falco (…)2026-09-17
🧬 biology

BiP Regulates the Unfolded Protein Response and Mitochondrial Respiration in Human Embryonic Stem Cells

Deze studie toont aan dat hoewel de ER-chaperonne BiP niet noodzakelijk is voor het behoud van pluripotentie in menselijke embryonale stamcellen, het essentieel is voor het coördineren van de unfolded protein response met mitochondriale respiratie om stressresistentie te waarborgen en dissociatie-geïnduceerde apoptose te voorkomen.

Shahnaz Babaei Abraki, Athaliah Gervacio, Iman Al Khatib, Timothy E. Shutt, Derrick E. Rancourt2026-09-17
🧬 biology

Complete Mitochondrial Genome and Protein-Coding Gene Evolution of Naemorhedus goral in Wanglang National Nature Reserve

Deze studie presenteert het volledige mitochondriale genoom van een *Naemorhedus goral* uit de Wanglang National Nature Reserve, waarbij de structurele kenmerken, codongebruikspatronen en evolutionaire kenmerken van proteïne-coderende genen worden gedetailleerd om een onafhankelijk gearchiveerde sequentie te bieden voor vergelijkende analyse binnen de onderfamilie Caprinae.

Xiao Min, Zhang Jingjing, Dai Yuxin, Mu Sijing, Huang Junzhong, Zhao Lianjun, Liu Hao, Hua Donglai2026-09-17
🧬 biology

Moderate drought and lignin biosynthesis orchestrate tuberous root formation in Potentilla anserina via PaCCR1-mediated sucrose allocation

Matige droogte activeert de vorming van knolwortels in *Potentilla anserina* door het downreguleren van het door PaCCR1 gemedieerde ligninebiosynthesepad, waardoor de koolstofstroom wordt omgeleid van structurele lignineproductie naar de accumulatie van oplosbare suikers en zetmeel om radiale wortelexpansie te faciliteren.

Mi Zhou, Yuxin Wang, Yangyang Xie, Meng Zhang, Tao Yang, Jinzhu Zhang, Wuhua Zhang, Jie Dong2026-09-17