🧬 生物学
Cross-trait fine-mapping and sequence modeling prioritize an AHSG splicing mechanism at an otosclerosis locus
通过整合跨性状精细定位、序列建模和历史基因组数据，本研究将涉及变异位点 rs4917 和 rs4918 的特定 AHSG 剪接机制视为导致耳硬化症的一个可能的因果通路，尽管无法明确建立核苷酸水平的因果关系或历史相位。
🧬 Category
q-bio
6418 篇论文
🧬 生物学
Sublaterodorsal tegmental nucleus α-Synuclein seeding uncouples neuropathology from Parkinson's disease- relevant functional deficits in wild-type mice
尽管在野生型小鼠的背外侧被盖核中进行双侧 α-突触共核蛋白种子植入成功诱导了广泛的蛋白质聚集与传播，但未能产生预期的帕金森病相关功能缺陷、REM 睡眠行为障碍特征或神经变性，这表明需要额外的易感因素才能使病理转化为临床功能障碍。
🧬 生物学
Thermoring-driven cold activation of TRPM8
本研究利用冷冻电镜结构和热环能量模型揭示了 TRPM8 的冷敏感性源于非共价桥接（特别是在 N 端结构域内）随温度变化的重排，这种重排降低了开放态的熔融阈值，从而促进了通道门控。
🧬 生物学
The processing class of the second residue is conserved across three domains of life, and retention of the initiator methionine is coupled to packing into the protein fold
本研究表明，起始甲硫氨酸加工命运的进化保守性——由所有三个生命域中第二个残基的类别所决定——是由不同的功能压力驱动的，具体而言，是移除型残基在翻译装置中的富集以及保留型残基对结构堆积的要求。
🧬 生物学
Omitting tumor proliferation from prognostic gene expression models: a preregistered cross-cancer test, a transcriptome-wide measurement, and a survey of how often the omission is made
这项预注册研究表明，在肝细胞癌及其他癌症的预后基因表达模型中忽略肿瘤增殖会系统性地使几乎所有基因的估计值产生偏差，然而作者关于这种偏差在不同队列间一致性与程度的具体预测在很大程度上被数据所反驳。
🧬 生物学
A context-dependent glucocorticoid receptor-SCARA5 axis coupled to ferritin/iron handling in osteoporotic bone marrow stromal cell fate: transcriptomic reanalysis and regulatory nomination
本研究整合了转录组重分析与调控证据，提出了一个上下文依赖性的糖皮质激素受体–SCARA5轴，该轴将铁处理与骨质疏松性骨髓基质细胞中成骨–成脂命运失衡相耦合，尽管对这一调控命名的功能验证仍有待完成。
🧬 生物学
Does RNA-seq Add Prognostic Value Beyond Clinical Variables Under Site-Held-Out Validation in TCGA-KIRC?
在 TCGA-KIRC 队列中，将 RNA-seq 数据添加到临床变量所带来的适度预后增益在验证过程中并未因扣除整个组织来源站点而减弱，这表明站点相关的变异并不能完全解释所报告的性能提升，尽管这些发现受到该研究单队列设计和特定建模选择的限制。
🧬 生物学
FreeSolvE: Solvent-Mediated Differentiable Pose Refinement and Ultra-Fast Biophysical Inductive Bias for Molecular Generation and Docking
FreeSolvE 是一种新颖的超快速可微引擎，它通过利用隐式溶剂化和关节运动学来高精度且以极低计算开销解决分子对接构象中的位阻碰撞，从而弥合了生成式人工智能与物理生物物理学之间的鸿沟。
🧬 生物学
Transcriptomic Prediction of Bone Metastasis in Breast Cancer: A Methodological Investigation Revealing Limited Generalizability of Machine Learning Models
本研究表明，基于转录组数据训练的机器学习模型在预测乳腺癌骨转移时，无法泛化至独立的测试集，这凸显了严谨且无泄漏的评估协议相较于乐观的交叉验证结果具有至关重要的意义。
🧬 生物学
Patient-level coronary artery disease classification from cardiac MRI using out-of-fold heart segmentation and same-slice region controls
本研究表明，源自心脏磁共振成像的袋外心脏感兴趣区域表征在患者级冠状动脉疾病分类中显著优于全图及心脏外对照，尽管由于样本量较小和数据集限制，这些发现仍属于方法论层面的概念验证。