🧬 biology
Rapid bee inventories for monitoring changes in Cerrado assemblages: Complementary traps for multiple taxa and trait groups
这项研究表明，结合蓝色杯、气味瓶和马莱斯陷阱（Malaise traps）为巴西塞拉多地区快速进行蜂类调查与监测提供了一个全面且具有成本效益的框架，揭示了极高的物种丰富度以及巴西利亚国家公园的关键保护价值。
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q-bio
1504 篇论文
🧬 biology
Contrasting roles of horizontal transfer and endogenous transposable element dynamics in microsporidian genome evolution
这项研究表明，微孢子虫基因组的扩张主要是由内源性转座子爆发驱动的，这种爆发受遗传漂变所促进，而来自宿主的水平基因转移仅发挥了微小的、特定分类单元的作用。
🧬 biology
Cross-species functional analysis of a de novo DCLK1 variant associated with a neurodevelopmental disorder
本研究通过整合秀丽隐杆线虫的跨物种功能基因组学与患者来源的神经元分析，鉴定出一个新发 DCLK1 变异是导致一种进行性神经发育障碍的致病因素，并证明该突变会诱发神经突起缺陷和神经退行性变，而这些缺陷可以通过表达野生型 DCLK1 或靶向相关通路得到部分挽救。
🧬 biology
The Complex Geometry of Biological Knowledge in Artificial Intelligence: Manifolds, Spectra, and Concept Structure in Foundation-Model Representations
这项研究表明，虽然蛋白质语言模型编码了具有生物学意义且可线性解码的信息，但它们缺乏单细胞基础模型中所发现的那种复杂的低维流形、多尺度谱结构和层级概念几何结构，而是通过一种由序列数据的离散性和同源驱动特性所塑造的、几何结构简单且高线性维度的空间来呈现知识。
🧬 biology
Beyond histology: self‑organizing map-derived MASLD transcriptomic subtypes for patient stratification
本研究利用自组织映射分析不同独立队列中的肝脏转录组学，识别出五种具有独特分子和免疫-基质特征且不依赖于组织学的 MASLD 亚型，为患者分层和靶向治疗策略提供了一个新的框架。
🧬 biology
Development of a biomimetic hydrogel cervical spinal cord surrogate for transverse compression across loading rates
本研究表明，可调控的聚丙烯酰胺-海藻酸钠双网络水凝胶（特别是通过 CaCl₂ 进行交联的水凝胶）成功复制了颈髓组织的非线性、速率依赖性横向压缩行为，为损伤生物力学和手术模拟提供了一种可行的仿生替代物。
🧬 biology
Caffeine decreases the accuracy of low-level force output during incremental contraction
在一项涉及13名健康年轻男性的随机、双盲、交叉试验中，发现摄入急性咖啡因（6 mg/kg）与安慰剂相比，会显著损害递增收缩过程中低水平力量输出的准确性，这表明它可能会削弱需要精细力量控制的技能。
🧬 biology
Two axes of drug transcriptional response, and a mechanistic correlate that organizes them: a conservation–divergence audit of Tahoe-100M
本研究通过分析 Tahoe-100M 图谱，基于两个近乎独立的轴——上下文稳健性（context-robustness）与剂量涌现性（dose-emergence）——来定义一个可解释的药物反应坐标系，并确定目标转录深度（target transcriptional depth）是组织这些反应的关键机制相关因素，从而提供了一种对药物机制的结构性审计，而非预测模型。
🧬 biology
Gene-resolved codon evolution and ordered CpG suppression in feline morbillivirus: implications for host adaptation and immune evasion
这项研究表明，猫麻疹病毒表现出基因特异性的密码子环境，并在其编码基因组中存在普遍且有序的 CpG 二核苷酸抑制现象，这暗示了一个多尺度进化模型，即宿主适应与潜在的免疫逃逸机制共同塑造了病毒的架构。
🧬 biology
Two-step process regulating the ciliary entrance of non-ciliary proteins: BBSome functions in the first step, upstream of the ciliary gate
这项研究揭示了 BBSome 通过在纤毛门（ciliary gate）的上游发挥作用，以防止非纤毛蛋白被错误地加载到内运蛋白运输载体（intraflagellar transport trains）上，从而调节纤毛的组成，进而建立了一个两步走的货物选择与门控模型。