🧬 biology
paRDal: Bioinformatics Framework for a Parallel RNA and DNA NGS Analysis in Hereditary Cancer Diagnostics
该论文介绍了 paRDal，这是一个容器化的生物信息学框架，它通过整合匹配的生殖系 DNA 和 RNA 次世代测序（NGS）数据来增强遗传性癌症诊断，通过检测剪接和表达异常，从而通过用户友好且基于证据的工作流来提高变异解释能力和诊断率。
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q-bio
1625 篇论文
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Biodiversity as the source of heterospecific social information: the effect on territory selection in the marsh warbler
尽管一项大规模实验最初表明异种社会信息会影响林岩柳莺的领地选择，但一项考虑到预先存在的空间分布的严谨分析显示，其丰度主要受生境结构和局部物种丰富度的驱动，而非受操纵的声学信号驱动。
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Fungal–Fungal Interactions Drive Metabolic Reprogramming in Root-Associated Endophytes of Salvia abrotanoides
本研究表明，*Salvia abrotanoides* 根系相关内生真菌之间的真菌—真菌相互作用驱动了代谢重编程，从而导致信号化合物的差异化调节以及沉默生物合成途径的激活，进而产生新型次生代谢产物。
🧬 biology
Diversity of microbiome associated with the didemnid ascidian Lissoclinum patella in North Sulawesi, Indonesia
本研究利用全长 16S rRNA 测序揭示了北苏拉威西岛海鞘 *Lissoclinum patella* 的细菌微生物组呈现出明显的位点和深度特异性群落结构，其中浅水区的塔利斯岛（Talise Island）种群与较深及城市化水域中多样性较低的群落相比，拥有最丰富且多样性最高的细菌共生体，并以 *Hoeflea* 为主导。
🧬 biology
Response Surface Optimization of PEG-Mediated Precipitation for Efficient Recovery of ClearColi™ Outer Membrane Vesicles
本研究表明，经响应面法优化的聚乙二醇（PEG）沉淀法为回收高产率、结构完整的 ClearColi™ 外膜囊泡提供了一种比超速离心更具可扩展性且更具成本效益的替代方案，在保持囊泡完整性的同时，使蛋白质回收率提高了 63.4%。
🧬 biology
Local structure-activity landscape roughness detects the activity-cliff failure mode that standard QSAR reliability methods miss
本文引入了一种针对单个化合物的局部结构-活性景观粗糙度度量方法，该方法成功检测出了标准 QSAR 可靠性方法所遗漏的活性悬崖失效模式，从而能够构建出即使在传统模型失效的区域也能保持有效覆盖率的校准符合预测器。
🧬 biology
Quantum Private Intersection Based on Single Qubits
本文提出并验证了一种在半诚实第三方协助下，利用单比特态与操作实现的资源高效型两方量子隐私交集协议，证明了其相比现有方案具有更优越的公平性与实际可行性。
🧬 biology
OTrack: A High-Throughput Organoid Detection and Tracking Framework Using Neighborhood-Guided Descriptors
OTrack 是一个无需训练的框架，它通过利用稳定的邻域空间分布，而非依赖随时间变化的形态特征，实现了跨越长成像间隔的鲁棒高通量类器官追踪。
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Prevalence, Virulence Gene Profiles, and Multidrug Resistance of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli in Farmed Carp (Labeo rohita) from Punjab, Pakistan: Implications for Food Safety and One Health
这项研究揭示了巴基斯坦旁遮普邦养殖鲤鱼及水体中携带毒力基因的多重耐药志卡毒素产生型大肠杆菌具有显著的流行率，凸显了紧迫的食品安全风险以及该地区水产养殖业加强抗生素管理的需求。
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In vitro Adhesion and Proliferation of MG63 Osteoblast-Like Cell Line on Bio-Oss and Bone+B Xenografts
这项体外研究表明，虽然 MG63 成骨细胞样细胞对 Bio-Oss 和 Bone+B 异种移植物表现出相当的黏附能力，但它们在 Bio-Oss 上的增殖显著更多，凸显了这两种材料之间不同的生物学效应。