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🧬 biology

Grassland species loss over the past decade in a highly fragmented landscape with an extinction debt

Un nouveau relevage des communautés végétales de prairies dans un paysage fragmenté japonais sur une décennie révèle que la perte significative d'espèces et le désassemblage des communautés sont pilotés à la fois par la destruction récente des habitats et par des changements paysagers historiques persistant sous forme de dette d'extinction, ces effets décalés variant selon l'échelle spatiale et le groupe fonctionnel des plantes, ce qui souligne la nécessité d'une restauration proactive parallèlement à la conservation des habitats.

TOMOYO F. KOYANAGI, ASUKA KOYAMA2026-09-16
🧬 biology

In vivo base editing rescues hearing in humanized MPZL2 mice within a structure-dependent therapeutic window

Cette étude démontre que l'édition de bases in vivo peut restaurer efficacement l'audition dans un modèle de souris humanisé de la DFNB111, même après la maturation cochléaire, à condition que l'architecture des cellules de Deiters demeure intacte, établissant ainsi l'intégrité structurelle plutôt que l'âge chronologique comme le déterminant critique de la fenêtre thérapeutique.

Sang-Yeon Lee, Sangsu Bae, Sohyang Jeong, Byeong-Hee Kang, Won Hoon Choi, Yeji Choi, Hansol Koo, Woo Seok Byun, Yejin Yu (…)2026-09-16
🧬 biology

Uncovering the landscape of functional transition and plasticity in the tumor microenvironment

En analysant l'adénocarcinome pulmonaire et le cancer colorectal, cette étude cartographie le paysage de la plasticité fonctionnelle au sein du microenvironnement tumoral, révélant des états myéloïdes transitoires spécifiques à la tumeur associés à l'immunosuppression et une convergence généralisée de types cellulaires divers vers des états fonctionnels similaires.

Riddhiman Dhar, Subhasis Datta, Rakesh Mandal, Sohom Basak2026-09-16
🧬 biology

Can Machine Learning Identify Meaningful Patterns in DNA Sequences? A Computational Study of DNA Motifs Associated with Transcription-Factor Binding

Cette étude computationnelle indépendante démontre que les classifieurs d'apprentissage automatique, particulièrement la Forêt Aléatoire (Random Forest), peuvent distinguer efficacement les séquences d'ADN associées à CTCF de fonds de dinucléotides mélangés en utilisant des caractéristiques de fréquence de k-mers courts, établissant ainsi un flux de travail de bout en bout transparent et reproductible pour l'intégration de la biologie moléculaire avec l'apprentissage automatique appliqué.

Hafsa Asmatullah2026-09-16
🧬 biology

Metazoan-wide phylogenomics supports the emergence of recognisable canonical prostanoid-receptor family structure across the vertebrate transition

Cette étude phylogénomique à l'échelle des métazoaires démontre que la structure canonique en huit familles des récepteurs aux prostanoides est une innovation spécifique aux vertébrés, révélant que les homologues de non-vertébrés précédemment proposés sont en réalité des lignées de récepteurs distinctes dont la similitude apparente avec les récepteurs EP4 des vertébrés découle d'une proximité phylogénétique plutôt que d'une véritable orthologie.

Sebastiano Scibelli2026-09-16
🧬 biology

Network pharmacology and experimental evidence implicate ERα-associated β-catenin regulation in the osteoprotective effects of sea buckthorn fruit extract

Cette étude démontre que l'extrait de fruit d'argousier exerce des effets ostéoprotecteurs chez les souris ovariectomisées en favorisant la formation osseuse et en supprimant la résorption osseuse par une régulation positive de la signalisation β-caténine médiée par ERα.

Liangliang Wei, Yong Wang, Zhihao Xia, Lei An, Kai Zhou, Shaobo Wu, Jiajia Ji, Yuxing Ye, Leyi Zhao, Junming Liang, Dage (…)2026-09-16
🧬 biology

Beyond aquatic and terrestrial: a multitaxon, large-scale perspective reveals the distinct biodiversity of non-perennial rivers

Grâce à une analyse multi-taxons à grande échelle utilisant l'ADN environnemental, cette étude démontre que les rivières non pérennes abritent des communautés uniques et diversifiées, distinctes à la fois des rivières pérennes et des sols terrestres, remettant en question la vision de ces dernières comme de simples systèmes de transition et soulignant leur rôle critique dans la biodiversité mondiale.

Naiara López-Rojo, Arnaud Foulquier, Romain Sarremejane, Daniel von Schiller, Klement Tockner, Rachel Stubbington, Aitor (…)2026-09-16
🧬 biology

Beyond Taxonomic Profiles: An Evidence-Informed Framework for Interpreting Gut Microbiome Alterations in Sickle Cell Disease

Cette revue systématique synthétise des preuves humaines hétérogènes sur le microbiote intestinal dans la drépanocytose afin de proposer un cadre fondé sur des données probantes qui dépasse les profils taxonomiques incohérents pour s'orienter vers des hypothèses testables concernant les altérations métaboliques fonctionnelles.

Tarimoboere Agbalalah2026-09-16
🧬 biology

Simulated Annealing Identifies Five Shared Drivers of T Cell Exhaustion Across Four Human Cancers

En appliquant un nouveau cadre de recuit simulé aux données de séquençage d'ARN sur cellule unique provenant de quatre cancers humains, cette étude identifie cinq moteurs conservés de l'épuisement des lymphocytes T et vingt nouveaux gènes candidats, tout en révélant des signatures d'épuisement spécifiques aux tissus qui remettent en question le rôle universel de marqueurs précédemment rapportés comme NR4A1.

alireza ebadi2026-09-16✓ Author reviewed ⓘ
🧬 biology

Invasive lobular carcinoma is characterized by IL33-high differentiated endothelium and IL33 receptor-positive mast-cell enrichment

Cette étude révèle que le carcinome lobulaire invasif se distingue par un microenvironnement vaso-immunitaire unique caractérisé par un endothélium différencié à forte expression d'IL33, une réduction du bourgeonnement angiogénique et un enrichissement en mastocytes exprimant IL1RL1, ce qui le différencie collectivement du carcinome ductal invasif.

Jules Cohen2026-09-16