Performance of pathogen identification and resistance gene expression tests using ASTar(R) remnant bacterial suspension in Gram-negative contrived positive blood cultures

Immagina un laboratorio ospedaliero come una cucina frenetica dove gli chef (scienziati) cercano di capire rapidamente che tipo di "ospite sgradito" (batterio) si è intrufolato a una festa (un'emocoltura di un paziente) e quali armi (geni di resistenza) si sia portato dietro. Di solito, questo processo è lento, disordinato e comporta l'invio dell'ospite in stanze diverse per test differenti, il che spreca tempo e denaro.

Questo articolo descrive un nuovo modo più veloce per farlo utilizzando una macchina chiamata ASTar. Ecco come funziona, spiegato in modo semplice:

1. La strategia della "Zuppa Avanzata"
Normalmente, dopo che la macchina ASTar esegue un test per vedere come i batteri reagiscono agli antibiotici, scarta la zuppa liquida contenente i batteri. Questo studio si è chiesto: E se non la buttassimo via?
Inveente, hanno conservato una minuscola tazza di questa "zuppa residua" (delle dimensioni di una singola goccia di pioggia) circa un'ora o due dopo l'inizio del test con la macchina. Hanno utilizzato questo liquido residuo per eseguire immediatamente altri due test importanti, invece di aspettare un intero nuovo giorno per ricominciare da capo.

2. I due controlli rapidi
Utilizzando questo liquido conservato, hanno eseguito due controlli specifici:

• Il controllo della carta d'identità (MALDI-TOF MS): Hanno utilizzato uno scanner hi-tech per prendere l' "impronta digitale" del batterio per identificare esattamente di chi si tratta. I risultati sono stati quasi perfetti; ogni singolo campione ha ottenuto un'identificazione ad alta affidabilità e i pochi casi in cui c'era un minimo di incertezza sono stati risolti istantaneamente con una semplice nuova scansione.
• Il rilevatore di armi (Lateral Flow Assay): Hanno utilizzato speciali strisce reattive (come un test di gravidanza, ma per i batteri) per vedere se i batteri possedevano "armi" specifiche come gli enzimi CTX-M o le Carbapenemasi.
  • Il Risultato: Le strisce reattive sono state incredibilmente accurate. Hanno identificato correttamente 30 casi su 30 di CTX-M e hanno ottenuto un'accuratezza vicina al 100% nei test per le Carbapenemasi (60 su 61). Anche quando hanno cercato di simulare uno scenario del mondo reale in cui si attendeva il completamento del primo test prima di eseguire il secondo, i risultati sono rimasti altrettanto accurati.

3. Il flusso di lavoro "Reflex"
I ricercatori hanno anche testato un approccio "reflex". Immaginate un addetto alla sicurezza che controlla prima la carta d'identità e, solo se sembri sospetto, ti controlla immediatamente le tasche alla ricerca di armi. In questo studio, hanno atteso che la macchina ASTar fornisse i suoi risultati iniziali prima di eseguire i test di resistenza. Questo non ha rallentato i tempi né ha reso i risultati meno accurati.

4. Il punto fondamentale
Lo studio conclude che, utilizzando questo metodo della "zuppa avanzata", gli ospedali possono:

• Ottenere l'ID dei batteri e la lista delle loro armi molto più velocemente (in circa 6 ore totali, con alcuni risultati disponibili in sole 1-2 ore).
• Risparmiare denaro rispetto all'uso di costosi test commerciali "all-in-one" (come la PCR multiplex).

In breve, questo articolo dimostra che non è necessario buttare via le prove dopo il primo test. Riutilizzando la zuppa di batteri avanzata, è possibile ottenere un quadro completo dell'infezione in modo più rapido ed economico, aiutando i medici a prescrivere la medicina giusta più presto.