Performance of pathogen identification and resistance gene expression tests using ASTar(R) remnant bacterial suspension in Gram-negative contrived positive blood cultures

Imaginez un laboratoire d'hôpital comme une cuisine très occupée où des chefs (scientifiques) tentent de découvrir rapidement quel genre de « mauvais invité » (bactérie) s'est introduit dans une fête (une hémoculture d'un patient) et quels types d'armes (gènes de résistance) cet invité transporte. Habituellement, ce processus est lent, désordonné et implique d'envoyer l'invité dans différentes pièces pour différents tests, ce qui gaspille du temps et de l'argent.

Ce document décrit une nouvelle méthode plus rapide pour y parvenir en utilisant une machine appelée ASTar. Voici comment cela fonctionne, expliqué simplement :

1. La stratégie de la « soupe restante »
Normalement, après que la machine ASTar a effectué un test pour voir comment les bactéries réagissent aux antibiotiques, elle jette la soupe liquide contenant les bactéries. Cette étude a posé la question suivante : Et si nous ne la jetions pas ?
Au lieu de cela, ils ont conservé une minuscule tasse de cette « soupe résiduelle » (environ la taille d'une goutte de pluie) une heure ou deux après le début du test par la machine. Ils ont utilisé ce liquide restant pour effectuer deux autres tests importants immédiatement, plutôt que d'attendre qu'une nouvelle journée commence à zéro.

2. Les deux vérifications rapides
En utilisant ce liquide conservé, ils ont effectué deux vérifications spécifiques :

• La vérification de la carte d'identité (MALDI-TOF MS) : Ils ont utilisé un scanner de haute technologie pour prendre une « empreinte digitale » de la bactérie afin d'identifier exactement de qui il s'agit. Les résultats étaient presque parfaits ; chaque échantillon a obtenu une identification de haute confiance, et les rares cas incertains ont été réglés instantanément en les scannant à nouveau.
• Le détecteur d'armes (Test à flux latéral) : Ils ont utilisé des bandelettes de test spéciales (comme un test de grossesse, mais pour les bactéries) pour voir si les bactéries possédaient des « armes » spécifiques comme les enzymes CTX-M ou les carbapénémases.
  • Le résultat : Les bandelettes de test étaient incroyablement précises. Elles ont identifié correctement 30 cas sur 30 de CTX-M et ont obtenu une précision de près de 100 % pour les tests de carbapénémase (60 sur 61). Même lorsqu'ils ont essayé de simuler un scénario réel où l'on attendait la fin du premier test avant de procéder au second, les résultats sont restés tout aussi précis.

3. Le flux de travail « réflexe »
Les chercheurs ont également testé une approche « réflexe ». Imaginez un agent de sécurité qui vérifie d'abord votre carte d'identité et, seulement si vous avez l'air suspect, vérifie immédiatement vos poches pour voir si vous portez des armes. Dans cette étude, ils ont attendu que la machine ASTar donne ses résultats initiaux avant de lancer les tests de résistance. Cela n'a pas ralenti le processus ni réduit la précision des résultats.

4. L'essentiel à retenir
L'étude conclut qu'en utilisant cette méthode de la « soupe restante », les hôpitaux peuvent :

• Obtenir l'identité de la bactérie et sa liste d'armes beaucoup plus rapidement (en environ 6 heures au total, avec certains résultats disponibles en seulement 1 à 2 heures).
• Économiser de l'argent par rapport à l'utilisation de tests commerciaux tout-en-un coûteux (comme la PCR multiplexe).

En résumé, cette étude montre qu'il n'est pas nécessaire de jeter les preuves après le premier test. En réutilisant la soupe de bactéries restante, on peut obtenir une image complète de l'infection plus rapidement et à moindre coût, aidant ainsi les médecins à prescrire le bon médicament plus tôt.