🧬 biology
Biophysical Derisking of Allosteric Ligand Engagement in Cancer Kinases Before Wet-Lab Assay Escalation
本論文は、実験的検証のための候補の優先順位付けを行うために、構造、水和、および動態解析を統合した、アロステリック・キナーゼ配位子の前試験分類のための計算生物物理学的フレームワークを提示するものであり、因果的な阻害や臨床的有効性の主張を明示的に回避している。
🧬 Category
q-bio
1816 件の論文
🧬 biology
Estimating Dispersal, Survival time and Population size of Wild Aedes aegypti in Dar es Salaam, Tanzania using Self-Mark-Release-Recapture Method
本研究は、タンザニアのダルエスサラームにおいて、野生のネッタイシマカ（*Aedes aegypti*）が限定的な分散（平均94.5m）と高い生存率（平均13.5日）を示すことを明らかにするために自己標識放流再捕獲法を用い、これは、アルボウイルス感染症に対する放出型媒介動物制御戦略を最適化するために必要な重要な生態学的パラメータを提供するものである。
🧬 biology
Frequency-Stratified Benchmarking Reveals Strong Long-Tail Limitations of Large Language Models in Diagnosis of Monogenic Diseases
本論文は、大規模言語モデルが単一遺伝子疾患の診断において顕著な性能バイアスを示すことを実証するために、頻度層別化された5,000症例からなるベンチマークであるMendelianBench-5Kを導入するものであり、研究が進んでいる遺伝子については高い精度を達成する一方で、希少で最近特徴付けられた遺伝子については苦戦することを示している。
🧬 biology
Multi-predictor pathogenicity filtering and membrane-specific stability analysis identify and characterize candidate destabilizing missense variants of the GIP receptor (GIPR)
本研究では、マルチ予測器による病原性フィルタリングと膜特異的な安定性解析を統合することにより、機能に影響を及ぼす可能性が高く、将来のファーマコジェネティクス研究の基礎となる、GIP受容体（GIPR）における14個の希少で構造的に不安定化させるミスセンス変異を特定し、その特性を明らかにしている。
🧬 biology
Artificial Intelligence-Driven Insights into the Antioxidant and Anticancer Properties of Onion (Allium cepa) and Tomato (Solanum lycopersicum) in Prostate Cancer Prevention and Management: A Contemporary Review
この現代的なレビューは、前立腺がん予防におけるタマネギおよびトマトのフィトケミカルの抗酸化および抗腫瘍特性に関する証拠を統合し、分子ドッキングや機械学習といった人工知能主導のアプローチが、既存の臨床的な曖昧さにもかかわらず、バイオアクティブ化合物を系統的に優先順位付けし、その分子メカニズムを解明することによって、現在のトランスレーショナルな障壁をどのように克服できるかを強調している。
🧬 biology
Curvana: an R package and Shiny Web app for analyzing AFM force curves
本論文では、原子間力顕微鏡（AFM）のフォース・ディスタンス曲線のエンドツーエンドの解析を自動化および効率化するために設計された、オープンソースのRパッケージおよびShinyウェブアプリケーションであるCurvanaを紹介しており、プログラミングの専門知識や複雑なローカル環境の構築を必要とせずに、生のデータを意味のある相互作用指標へと変換するためのユーザーフレンドリーなソリューションを提供する。
🧬 biology
Hierarchically supervised computational pathology stratifies HER2 categories and ERBB2 amplification risk from routine H&E slides in breast cancer
本論文は、臨床検査のロジックをそのアーキテクチャに組み込むことで、従来のモデルの限界を克服し、リソース集約的な確認試験の必要性を低減する、日常的なH&Eスライドを利用してHER2カテゴリーを正確に層別化しERBB2増幅リスクを予測する階層的教師あり計算病理学フレームワークであるCHERISHを導入するものである。
🧬 biology
Causal Responsibility Based Explainable AI for Vibrational Spectroscopy Applied to Cancer Diagnostics
本論文は、がん診断における振動分光法のための因果的責任に基づく説明可能なAI手法であるSpec-ReXを紹介し、透明性の高い臨床的意思決定に対する極めて重要なニーズに対処するため、in silico、in vitro、およびex vivoのデータセットにわたる他のXAI技術に対するその性能を厳密に検証するものである。
🧬 biology
Cohesin-mediated replication fork tethering enables fork slowing and reversal
本研究は、コヒーシンによるループ押し出しが、PRIMPOLを阻害することによって隣接する複製フォークを繋ぎ止め、複製ストレス下におけるそれらの減速と逆行を促進し、それによってゲノム構成とDNA損傷耐性を統合してゲノムの安定性を保護することを明らかにしている。
🧬 biology
The Artemis I mission reshaped seed amino acid composition and post-flight plant growth in a genotype-dependent manner
アルテミスIミッションは、シロイヌナズナにおける種子の種のアミノ酸プロファイルおよび飛行後の成長に遺伝子型依存的な変化を誘発し、分岐鎖アミノ酸代謝が深宇宙曝露に対する植物の応答に影響を与える重要な要因であることを明らかにした。