Actionable genomic landscape remains stable across serial circulating tumor DNA analyses in advanced breast cancer
進行乳がんにおいて、初回解析で有用な結果が得られなかった検体に対しては、ctDNAによる包括的なプロファイリングの再実施が非常に価値が高い一方で、初回の解析で成功した検体においては新たな治療標的の発見は限定的であることから、既に対象となる結果が得られている患者に対しては、標的をESR1に絞ったモニタリングを行う方がより効率的な戦略であることが示唆される。
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進行した乳がんとの闘いにおいて、医師たちは「リキッドバイオプシー(液体生検)」と呼ばれるツールをますます活用するようになっています。体の一部を切り取って腫瘍を取り出す代わりに、彼らは一瓶の血液を採取します。その血液の中には、がん細胞によって放出された微細なDNAの断片が浮遊しており、それが病気の分子的な署名(シグネチャー)として機能します。この遺伝コードを読み解くことで、医師は新しい薬で標的にできる可能性のある、腫瘍の特定の弱点を特定することができます。この手法は、特にがんが転移している患者に対して、治療を導くための標準的な方法となっています。しかし、病状が進行し、患者がさまざまな治療段階を経ていく中で、ある実用的な疑問が生じています。もし医師が一度がんの遺伝コードを読み取ったのであれば、何度も繰り返し読み取る必要があるのでしょうか? 腫瘍はこれほど急速に遺伝的構成を変化させ、新しい検査によって全く新しい標的が明らかになるのでしょうか? それとも、最初の読み取りは時間の経過とともに信頼性を保ち続けるのでしょうか?
フランスのギュスターヴ・ルーシーがんセンターの研究者たちは、152人の進行乳がん患者の記録を調査することで、この疑問に答えるべく取り組みました。これらの患者は、治療の過程で少なくとも2回の包括的な血液遺伝子検査を受けています。研究チームは、数百の遺伝子を一度にスキャンするこれらの広範な検査を繰り返すことが、初回で見逃された「治療可能な新たな標的」を見つけ出すことになるのか、それともがんの遺伝的景観は大部分において変わらないのかを知りたいと考えました。また、最初の検査でがんのDNAが検出されなかった場合に何が起こるのか、そして2回目の試みを行う価値があるのかについても理解したいと考えました。
研究はまず、最初の血液検査の結果に基づいて患者を分類することから始まりました。152人の患者のうち87人では、最初のテストが成功しており、つまり、明確な遺伝的プロファイルを提供するのに十分な量の腫瘍DNAが検出されました。残りの65人については、最初のテストは空振りとなり、検出可能な腫瘍DNAは見つかりませんでした。これら65人の患者に対して、研究者たちは後日どのようなことが起こるかを観察しました。結果は心強いものでした。これらの患者の約71パーセント、すなわち65人中46人が、その後の採血で陽性反応を示したのです。このことは、最初の結果が陰性であったとしても、がんが遺伝的標的を持っていないことを意味するのではなく、単にその特定の瞬間において、腫瘍が血液中に放出しているDNAが十分に少なかっただけであることを示唆しています。研究者たちは、がんが骨にのみ転移している患者は、こうした持続的な陰性結果を示す可能性が高いと指摘しました。これは、骨の腫瘍が肝臓などの臓器にある腫瘍と比較して、血流中にDNAを放出しにくいことが理由であると考えられます。
最初のテストが成功した患者については、研究者は最初の成功した血液採取による遺伝的プロファイルと、次の成功したプロファイルを比較しました。その結果、がんの遺伝的な姿は驚くほど安定していることが分かりました。がんを駆動する特定の遺伝子は、テスト間で大きく変化することはありませんでした。薬で標的にできる遺伝子に注目したところ、最初のテストの結果と2回目のテストの結果は、非常に高い一致度を示しました。2回目のテストで新たに出現した遺伝的変化は稀でした。実際、2回の成功したテストを受けた患者の中で、最初のテストには存在しなかった新しい標的可能な遺伝的変化が生じたのは、ごくわずかな割合でした。新たに出現した変化のほとんどは、極めて軽微なものか、ごく一部の細胞にしか存在しないもの、あるいは腫瘍自体とは無関係に血球細胞から生じた変化でした。
この安定性における顕著な例外の一つは、ESR1と呼ばれる特定の遺伝子でした。一部の患者において、この遺伝子の変異が病状の進行過程で出現しました。この変異は、がんが特定のホルモン療法に対して抵抗力を持つ助けとなることが知られており、治療法を切り替えるためのよく知られた理由となります。しかし、この特定のケースを除けば、2回目の包括的な検査による新たな標的の広範な探索によって、新しい情報が得られることは滅多にありませんでした。研究者らが計算したところ、患者の遺伝的プロファイルに基づいて臨床試験や新薬へのマッチングを行った際、そのマッチングのうち再検査から得られたものは5人に1人未満でした。治療の機会の大部分は、最初の成功したテストですでに特定されていたのです。
これらの知見は、医師がリキッドバイオプシーをどのように使用すべきかについて、明確な道筋を示しています。もし最初のテストががんのDNAを見つけることに失敗した場合、後でテストを繰り返すことは非常に価値があります。なぜなら、最初のテストが失敗した場面で、後のテストが成功することが多いからです。しかし、もし最初のテストが成功し、完全な遺伝的プロファイルを提供しているのであれば、同じ広範で高価なテストを再び行うことは、治療計画を変更することにはつながりにくいでしょう。研究者たちは、フルスキャンを繰り返す代わりに、例えばホルモン療法中の患者において、ESR1変異のような特定の変化を標的にしたモニタリングに焦点を当てるべきだと提案しています。このアプローチにより、医師は不必要な検査を強いることなく、重要な数少ない変化を捉えることができるようになります。研究の結論は、腫瘍の最初の遺伝的読み取りは耐久性のある地図であり、地形の端の部分はわずかに変化するかもしれないものの、主要なランドマークはそのままの位置に留まり、長い間効果的に治療決定を導いてくれる、というものです。
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