Incursion of European Shamonda virus clade II in dairy cattle on Jersey, Channel Islands

技術要約：チャンネル諸島ジャージー島における乳牛への欧州シャモンダウイルス系統IIの侵入

問題と背景
2026年7月初旬、チャンネル諸島のジャージー島にある4つの血統登録されたジャージー種乳牛群において、泌乳量の急激な減少、悪臭を伴う下痢、反芻の減少、および重症例における横臥（おうが）を特徴とするアウトブレイクが発生した。最も深刻な影響を受けた群では、搾乳中の牛の39.2%が臨床症状を発現し、28%が横臥状態となった。繁殖に関する問題（再発情、流産、死産など）も観察されたが、因果関係は直ちに特定されなかった。ジャージー島の歴史的に高い家畜衛生状態を考慮し、調査では、欧州の他の地域で循環していることが知られているオルソブニウイルスを標的とした、新興感染症の原因が検討された。初期の鑑別診断には、熱ストレス、飼料因子、マイコトキシン、および一般的な細菌または寄生虫感染（例：Salmonella属、ジョンスタン病、肝蛭）が含まれたが、これらは標準的な検査によってすべて除外された。

方法論
調査では、影響を受けた4つの農場から呼吸器検体、糞便、および血液サンプルを収集した。ウイルスRNAはQiagen QIAamp Viral RNA mini kitを用いて抽出された。サンプルは、2種類のpan-Simbu RT-qPCRアッセイおよび特定のシュマレンベルグウイルス（SBV）RT-qPCRアッセイを用いてスクリーニングされた。2つの農場はpan-Simbuウイルスに対して陽性であったが、SBVに対しては陰性であった。

2つのSHAV陽性血清サンプル（0209および0221）と2つのプールされた呼吸器検体が、Illumina MiSeq次世代シーケンシング（NGS）に供された。リードは、最近記述されたドイツのSHAV配列（GenBankアクセッション番号 OZ502471.1–OZ502473.1）に対してマッピングされ、ほぼ完全なL、M、およびSゲノムセグメントを構築した。系統解析は、ウイルスの系統（クレード）を決定し、再集合の可能性を評価するために、MegAlign (DNASTAR Lassegne 17) および MEGA X ソフトウェアを用いて行われた。

主な結果

• 病原体の特定: NGSにより、陽性サンプル中にシャモンダウイルス（SHAV）の存在が確認された。血清および呼吸器検体から他のウイルス性病原体は検出されなかった。
• ゲノム特性: ジャージー株（0209/2026）のほぼ完全なL、M、およびSゲノムセグメントは、欧州系統IIにクラスター化した。現代の欧州系統IIウイルスとの配列同一性は、3つのセグメントすべてにおいて極めて高く（99.7–99.9%）、非常に高い一致を示した。
• 系統学的配置: このウイルスは、2026年に検出されたドイツ株と最も近い遺伝的関係を示した。解析の結果、Sセグメントには高い保存性が認められたが、MセグメントはSBVと比較して顕著な相違があり、SHAVとしての分類が確認された。3つのゲノムセグメント間における最近の再集合の証拠は見られなかった。
• 臨床的相関: 臨床症状（下痢、泌乳量減少、横臥）は、欧州の他地域で報告されているSHAVのアウトブレイクの特徴を反映していたが、ジャージー牛における高い横臥率は、当該品種が持つ低カルシウム血症関連疾患への感受性によって増幅されている可能性がある。
• 陰性結果: SHAVのPCR検査で陰性であった2つの農場については、熱ストレスおよび管理因子に起因するものとされ、同様の臨床像を示したにもかかわらず、ウイルスがすべての保有農場に存在していたわけではないことが示唆された。

意義と主張
本論文は、英国におけるSHAVの初検出を報告するものであり、欧州系統II SHAVの既知の地理的範囲を北西欧のアトランティック地域へと拡大させるものである。著者らは、ジャージー株と現代のドイツ株との間の密接な遺伝的関係は、SHAVが現在のサーベイランスデータが示すよりも、西欧全域に広く分布していることを示唆していると主張している。

この侵入の特定は、感染したCulics属のヌカカによる大陸からの風による拡散の可能性を浮き彫りにしている。ウイルスが検出されたのは2つの保有農場のみであったが、著者らは、ウイルス血症期間外の検査の限界を考慮すると、より広範な関与を排除できないと述べている。これらの知見は、特にジャージー島の酪農界にとって経済的重要性が不釣り合いに高いジャージー種を考慮し、新興のSimbuセログループウイルスに対する継続的な監視およびゲノムシーケンシングの重要性を強調している。本論文は、これらの事象が西欧におけるSHAVのより広範な循環と、北西欧における備えの必要性を実証していると結論付けている。