Geroprotective drug discovery with an AI-enabled assay for heat resistance
作者开发了一个基于秀丽隐杆线虫的开源人工智能赋能筛选平台,用于快速识别能够增强热应激抗性的 FDA 批准药物,从而发现了 31 种既能延长线虫寿命又在人类细胞中表现出抗衰老活性的化合物。
原始论文采用 CC BY 4.0 许可(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。 这是一篇未经同行评审的预印本的AI生成解释。这不是医疗建议。请勿根据此内容做出健康决定。 阅读完整免责声明
想象一个这样的世界:变老不再是一个缓慢消逝的过程,而是一个我们可以实际减缓的过程,就像按下视频游戏的“暂停”键一样。科学家们早已知道,衰老是具有灵活性的;它并非一成不变。他们发现,通过调整基因或喂食某些化学物质,名为“秀丽隐杆线虫”(C. elegans)的小型蠕虫可以活得更久。这个理念是“老年科学学派”(geroscience)的核心——即如果我们针对衰老本身的根本原因进行治疗,我们或许能同时预防包括心脏问题或糖尿病在内的一系列疾病。大问题在于:我们如何找到正确的“暂停键”药物?通常,测试这些药物需要耗费极长时间。你必须观察蠕虫的整个生命周期,这可能需要数周时间,而且你必须逐一手动检查它们,就像一个非常有耐心但精疲力竭的动物园管理员一样。这种方式既慢又枯燥,且难以同时对成千上万种药物进行测试。
于是,一群研究人员决定通过教计算机成为比人类更优秀的“动物园管理员”来加速这一进程。他们构建了一个智能的、由人工智能驱动的系统,该系统可以通过分析蠕虫的体型,瞬间判断出它们是活着且健康,还是已经“断气”了。他们并没有等待数周来观察蠕虫是否长寿,而是向蠕虫发起了一场“热浪挑战”。如果某种药物能让蠕虫在热浪中变得更强韧,计算机就会给它们打高分。事实证明,在热浪中幸存下来的蠕虫通常寿命也更长。通过使用这种“热测试”和超快速的 AI 相机,他们在短短几天内就筛选了近 3,000 种不同的药物。他们发现了 31 种能让蠕虫“耐热”的药物,并且当他们在更长期的测试中检查这些优胜者时,发现其中 18 种确实延长了蠕虫的寿命。更酷的是,其中一些药物甚至能帮助人类细胞在培养皿中保持年轻和健康。这就像是找到了一个在微小蠕虫和人类细胞之间通用的衰老捷径,而且是在你吃完一顿学校午餐之前就完成了这项工作。
蠕虫锻炼与机器人裁判
把衰老研究想象成寻找汽车完美燃料的过程。你想知道哪种燃料能让引擎运行得更久、更顺畅。长期以来,科学家们通过驾驶汽车数月并观察其行驶距离来进行测试。但这太慢了。研究人员决定尝试一种不同的方法:与其进行一场漫长的公路旅行,不如给汽车来一次突然而剧烈的“爬坡”。如果汽车能应对陡峭且炎热的山坡而不熄火,那么它很可能是一辆经久耐用的好车。
在蠕虫的世界里,这种“爬坡”就是热冲击。科学家们将微小的蠕虫置于 35°C(95°F)的热浪中持续 11 小时。大多数正常的蠕虫会死亡或变得非常虚弱。但如果一只蠕虫服用了一种使其变得更强韧的特殊药物,它就能在热浪中幸存并恢复。难点在于统计谁活了下来。通常,人类必须用针刺或用光照射蠕虫来观察它们是否还在蠕动。这既慢又累。
为了解决这个问题,团队构建了一个 AI “机器人裁判”。他们教计算机观察蠕虫的照片,并通过分析它们的姿态来判断它们是生是死。活着的蠕虫是扭动且弯曲的,像跳舞的蛇;死去的蠕虫则是僵硬且笔直的,像一根木棒。计算机学会了瞬间识别这种差异。他们称之为“形状评分”(ShapeScore)。这就像体育比赛中的裁判,可以在瞬间判断一名球员是在继续比赛还是已经晕倒,而无需询问。
伟大的药物搜寻
有了准备就绪的机器人裁判,团队展开了一场大规模的寻宝行动。他们获取了一个包含 2,782 种已获 FDA 批准用于其他用途(如抗生素或心脏病药物)的药物库,并问道:“这些药物中,哪些能让蠕虫耐热?”他们将蠕虫放入 96 孔板中(可以想象成蠕虫的微型蛋托),加入药物,然后用热量轰击它们。
AI 对每一个孔位进行拍照,并为每个孔计算得分。在第一轮之后,他们发现了 130 种看起来很有前景的药物。但为了确保万无一失,他们再次进行了测试。这一次,只有 31 种药物通过了两次测试。这些就是“超级幸存者”。
从蠕虫到人类
团队并未止步于此。他们想知道这些药物是否真的能让蠕虫长寿,而不仅仅是能在热浪中幸存。他们拿这 31 种优胜者进行了长寿测试。结果发现,其中 18 种成功延长了蠕虫的寿命。其中一些药物令人惊喜。例如,他们发现某些抗生素(如头孢曲令和替格环素)甚至某些用于治疗癫痫或高血压的药物,都能让蠕虫活得更久。
但最令人兴奋的部分是检查这些药物是否对人类也有效。他们选取了前六名药物,并在处于“衰老状态”(一种被称为“衰老/senescence”的状态)的人类细胞上进行了测试。他们发现,其中三种药物——克莱米唑(clemizole)、异沙苯吡啶(isradipine)和哌拉西林(piperacillin)——可以帮助这些人类细胞在不被杀死的情况下,看起来和表现得更年轻。这表明,这些药物的“魔力”可能跨越不同物种,从微小的蠕虫到我们人类。
这为什么重要
这个故事最精彩的部分在于速度。传统的蠕虫衰老测试需要数周时间。而这种结合了 AI 裁判和热挑战的新方法,仅需两天即可完成任务。这就像是从观看慢动作电影切换到快进模式,直接看到结局。研究人员展示了你不需要昂贵且复杂的机器来做这件事;一台标准的显微镜和一些聪明的软件就足够了。
虽然他们并没有证明这些药物会在明天就阻止人类衰老,但他们展示了一种寻找候选药物的强大新方法。他们发现了一些既能在蠕虫身上起作用,又能帮助人类细胞的药物,这是一个巨大的信号,表明它们值得进一步研究。这提醒我们,有时,解决像衰老这样宏大且缓慢的问题,关键在于先问一个更简单、更快速的问题:“你能挺过热浪吗?”而多亏了机器人裁判,我们现在可以同时向成千上万种药物提出这个问题。
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