Heterotypic Condensate Formation by Prion Proteins and Pro-Inflammatory S100A9
تُظهر هذه الدراسة أن البروتين المحفز للالتهاب S100A9 يعزز تجمع بروتينات البريون من خلال تشكيل مكثفات فصل الطور السائل غير المتجانسة، والتي تسرع لاحقاً تكوين هياكل الأميلويد في ظل ظروف الازدحام الجزيئي العالي.
المؤلفون الأصليون:Veiveris, D., Karalkeviciute, V., Mikalauskaite, K., Sulskis, D., Ziaunys, M.
داخل كل خلية حية، هناك نشاط دؤوب ومستمر حيث تتحرك البروتينات وتطوى وتتفاعل للحفاظ على استمرارية الحياة. وأحياناً، تتجمع هذه البروتينات معاً في بقع محددة، مكونة قطرات تطفو بحرية دون غشاء يحيط بها، تماماً مثل قطرات الزيت في الماء. يطلق العلماء على هذه العملية اسم "انفصال الطور سائل-سائل". وبينما يساعد هذا السلوك الطبيعي في تنظيم العمل الخلوي، إلا أن الأمور قد تسوء عندما تصبح هذه القطرات مستقرة للغاية أو تتحول إلى كتل صلبة ولزجة. هذا التحول من قطرة سائلة إلى كتلة صلبة هو سمة مميزة لعدة أمراض دماغية مدمرة، بما في ذلك مرض ألزهايمر ومرض باركنسون، حيث تطوى البروتينات بشكل خاطئ وتتراكم في هياكل ضارة تُعرف باسم "الأميلويد". لسنوات طويلة، ركز الباحثون على كيفية تسبب أنواع مفردة من البروتينات في هذه المشكلات، لكن هناك مجموعة متزايدة من الأدلة تشير إلى أن البروتينات المختلفة قد تختلط معاً داخل هذه القطرات، مما يسرع من حدة الضرر بطرق بدأنا للتو في فهمها.
قام فريق من الباحثين في جامعة فيلنيوس في ليتوانيا مؤخاً بالتحقيق في اقتران محدد لوحظ تفاعله تحت ظروف مخبرية قاسية: بروتين البريون، وهو عنصر مركزي في أمراض البريون، وبروتين S100A9، وهو بروتين مرتبط بالالتهاب. أرادوا معرفة ما إذا كان بإمكان هذين البروتينين تكوين قطرات مختلطة معاً في بيئة أكثر طبيعية، وإذا كان الأمر كذلك، كيف سيؤثر هذا الخليط على تكوين كتل ضارة. ولاختبار ذلك، أنشأوا بيئة مخبرية مزدحمة باستخدام مادة تسمى "بولي إيثيلين جلايكول" لمحاكاة الظروف الكثيفة الموجودة داخل الخلايا. قاموا بخلط البروتينين معاً وراقبوا عن كثب لمعرفة ما إذا كانا سينفصلان إلى قطرات سائلة وكيف ستتغير تلك القطرات بمرور الوقت.
وجد الباحثون أنه في الظروف المتعادلة، وهي الأقرب إلى البيئة داخل جسم الإنسان، شكل بروتين البريون وبروتين S100A9 بالفعل قطرات مختلطة. وعندما وُجد البروتينان معاً، شكلا عدداً أكبر بكثير من هذه القطرات مقارنة بما لو كان كل بروتين موجوداً بمفرده. وباستخدام علامة فلورية لتتبع بروتين S100A9، لاحظ الفريق أن هذا البروتين الالتهابي قد دُمج في القطرات التي كونها بروتين البريون. ومع ذلك، لم يكن الخليط متجانساً؛ فبعض القطرات احتوت على بروتين البريون فقط، بينما احتوت أخرى على مزيج من كليهما. وهذا يشير إلى أن وجود البروتين الالتهابي يشجع بروتين البريون بنشاط على التجمع في هذه العناقيد السائلة.
كان ما حدث بعد ذلك هو الاكتشاف الأكثر أهمية. فبينما يمكن لبروتين البريون وحده أن يشكل هياكل تشبه الألياف في ظل ظروف الازدحام هذه، أدى وجود S100A9 إلى تكوين تجمعات أكثر استقراراً ووفرة. في المختبرات القياسية، غالباً ما يضطر العلماء إلى استخدام مواد كيميائية كاسرة قوية لإجبار بروتينات البريون على التكتل، ولكن هنا، وجد الباحثون أن مجرد وجود S100A9 سمح لبروتين البريون بتكوين تجمعات صلبة ومستقرة دون الحاجة لتلك المواد الكيميائية القاسية، وكانت هذه التجمعات المختلطة أكثر مقاومة للتفكك من تلك التي كونها بروتين البريون بمفرده. وقاس الفريق البنية الداخلية لهذه الكتل ووجد أنها غنية بـ "صفائح بيتا"، وهي ترتيب محدد لخيوط البروتين يميز الألياف الصلبة والضارة التي تظهر في أمراض التنكس العصبي.
تشير الدراسة إلى أن البروتين الالتهابي S100A9 قد يلعب دوراً حاسماً، لم يكن مقدراً كفاية في السابق، في المراحل المبكرة من أمراض البريون. فمن خلال المساعدة في تكوين هذه القطرات السائلة المختلطة، يبدو أن S100A9 يخفض الحاجز أمام تكتل بروتينات البريون، مما يؤدي فعلياً إلى بدء العملية التي تؤدي إلى التجمعات الصلبة المسببة للمرض. ويقترح الباحثون أنه في جسم الإنسان، حيث يوجد كلا البروتينين في الدماغ والسائل الشوكي، يمكن أن يكون هذا التفاعل عاملاً رئيسياً في كيفية بدء هذه الاضطرابات وتطورها. ورغم أن العمل أُجري في أنبوب اختبار، إلا أن النتائج تشير إلى مسار جديد لفهم كيفية عمل الالتهاب وطي البروتين بشكل خاطئ معاً لدفع عملية التنكس العصبي، مما يقدم منظوراً جديداً حول سبب صعوبة إيقاف هذه الأمراض.
ملخص تقني: تكوين التكثيفات غير المتجانسة النوع بواسطة البروتينات البريونية والبروتين الالتهابي S100A9
بيان المشكلة يعد تراكم البروتين في ألياف أميلويدية سمة مميزة لأمراض التنكس العصبي، بما في ذلك أمراض البريون، ومرض ألزهايمر، ومرض باركنسون. وبينما يُعترف بانفصال الطور السائل-السائل (LLPS) كآلية تقود تكوين العضيات غير الغشائية، فإن انفصال الطور السائل-السائل غير الطبيعي يكتسب أهمية متزايدة في إمراضية الأمراض. وقد أثبتت الأبحاث السابقة أن بعض البروتينات المسببة للأميلويد يمكن أن تشكل تكثيفات غير متجانسة النوع (قطرات تحتوي على أنواع متعددة من البروتينات)، والتي قد تسرع عملية التراكم. ومع ذلك، فإن التفاعلات المحددة بين البروتينات البريونية (PrP) والبروتين المحفز للالتهاب S100A9 تحت ظروف تعزيز التكثيف لا تزال غير مستكشفة. ورغم أن التفاعلات المتقاطعة بين هذين البروتينين قد تم تأكيدها سابقاً في ظروف عدم انفصال الطور السائل-السائل (non-LLPS)، إلا أنه كان من غير المعروف ما إذا كان بإمكانهما التكثف معاً في قطرات غير متجانسة النوع، وكيف ستؤثر مثل هذه البيئة على حركية تراكم البروتين البريوني (PrP) واستقراره الهيكلي.
المنهجية استخدمت الدراسة متغيرات بروتين البريون لدى الفئران (الكامل الطول 23-230 والمبتور 89-230) والبروتين المحفز للالتهاب S100A9. وتضمن سير العمل التجريبي ما يلي:
تنقية البروتين: تم تنقية متغيرات PrP المعاد تركيبها وS100A9 باستخدام تقنية الكروماتوغرافيا الألفة للأيونات المعدنية (IMAC) والكروماتوغرافيا باستبعاد الحجم.
تحسين الظروف: قام الباحثون بفحص مختلف المعايير البيئية (الرقم الهيدروجيني 4.0–7.0، تركيزات GuHCl من 0 إلى 2.0 مولار، و20% PEG كعامل ازدحام) لتحديد الظروف المثلى لانفصال الطور السائل-السائل (LLPS) وتراكم PrP باستخدام المجهر الضوئي، وقياسات الكثافة الضوئية، وفلورة الثيوفلافين-T (ThT).
مراقبة الحركية: تمت مراقبة حركية التراكم في الوقت الفعلي لـ PrP وS100A9 ومزيجهما عبر فلورة ThT في ألواح ذات 96 بئراً عند درجة حرارة 37 مئوية في ظروف ساكنة.
التحليل الهيكلي:
المجهر الإلكتروني النافذ (TEM): استُخدم لتصور الهياكل الشبيهة بالألياف ومورفولوجيا التراكم بعد حضانات لمدة 3 أيام.
مطيافية الأشعة تحت الحمراء بتحويل فورييه (FTIR):� أُجريت على الرواسب المتجمعة المعاد تعليقها في D2O لتحليل الهياكل الثانوية (تحديداً محتوى بيتا-sheet) واستقرار التراكم ضد الذوبان.
التحقق من عدم التجانس النوعي: استُخدمت المجهرية الفلورية باستخدام S100A9 الملحق ببروتين mCherry والممزوج مع PrP غير الملحق بصبغة لتأكيد التوضع المشترك داخل التكثيفات والتمييز بين القطرات متجانسة النوع والقطرات غير متجانسة النوع.
النتائج الرئيسية
سلوك طور PrP: شكل PrP كامل الطول (23-230) التكثيفات بشكل أكثر فعالية عند الرقم الهيدروجيني الفسيولوجي (6.0–7.0) وتركيزات منخفضة من المادة المزالة للطبيعة (0–0.5 مولار GuHCl). وفي المقابل، أظهر المتغير المبتور (89-230) انخفاضاً ملحوظاً في التكثيف. ومن الجدير بالذكر أن تراكم PrP تحت ظروف تعزيز LLPS حدث دون الحاجة إلى الظروف القوية المسببة لفقدان الطبيعة التي يتطلبها عادةً تكوين أميلويد PrP.
تكوين التكثيفات غير متجانسة النوع: عند خلط PrP وS100A9 تحت ظروف LLPS المثلى (pH 7، 0 M GuHCl، 20% PEG)، زاد عدد الجسيمات القابلة للكشف بشكل كبير مقارنة بمجموع الضوابط الفردية. وأكدت المجهرية الفلورية دمج mCherry-S100A9 داخل قطرات PrP، مما شكل تكثيفات غير متجانسة النوع. ومع ذلك، احتوى المزيج على كل من قطرات PrP متجانسة النوع والقطرات غير متجانسة النوع ذات التركيزات المتفاوتة من S100A9.
حركية التراكم والاستقرار: أظهر مزيج PrP وS100A9 منحنى حركياً مزدوج السيجمويد (double-sigmoidal)، مما يشير إلى عملية من خطوتين: تكوين القطرات ثم التراكم. والأهم من ذلك، أظهر المزيج تحت ظروف pH 7 (0 M GuHCl) شدة فلورة ThT نهائية أعلى من مجموع ضوابط البروتينات الفردية.
الاختلافات الهيكلية: كشف تحليل FTIR أن تراكمات PrP التي تشكلت بمفردها تحت هذه الظروف كانت غير مستقرة (meta-stable) وتذوب إلى حد كبير عند إعادة التعليق في D2O (بافتقارها لقمم بيتا-sheet القوية). وعلى العكس من ذلك، ظلت التراكمات المتكونة في وجود S100A9 مستقرة بعد دورات إعادة تعليق متعددة وأظهرت بصمات بيتا-sheet متميزة (~1620 cm⁻¹). كما أظهرت العينات المشتركة مساحة أكبر لمنطقة Amide I'، مما يشير إلى كتلة أكبر من التراكمات المستقرة والغنية بـ بيتا-sheet.
الأهمية والادعاءات خلص المؤلفون إلى أن S100A9 يلعب دوراً حاسماً في تعزيز تراكم PrP من خلال تجميع التكثيفات غير متجانسة النوع تحت ظروف الازدحام الجزيئي العالي. وتوضح الدراسة أن:
الرؤية الميكانيكية: يسهل S100A9 تكوين قطرات غير متجانسة النوع مع PrP، وهو ما يُرجح أن يكون مدفوعاً بالتفاعلات الكهروستاتيكية بين PrP الموجب الشحنة وS100A9 سالب الشحنة عند الرقم الهيدروجيني الفسيولوجي.
الاستقرار: يعمل وجود S100A9 على تثبيت تراكمات PrP التي كانت ستكون غير مستقرة أو تذوب تحت ظروف عدم انفصال الطور السائل-السائل (non-LLPS). ويؤدي هذا الاستقرار إلى تكوين تركيزات أعلى من الهياكل الأميلويدية ذات المحتوى المتزايد من بيتا-sheet.
الأهمية المرضية: نظراً للتوضع المشترك لـ PrP وS100A9 في القشرة المخية والسائل الدماغي النخاعي، يقترح المؤلفون أن مسار التكثيف غير متجانس النوع هذا قد يمثل عاملاً مهماً في نشوء وتطور أمراض البريون في الجسم الحي، لا سيما تحت الظروف الفسيولوجية التي تغيب فيها عمليات فقدان الطبيعة التقليدية.
تفترض الورقة أن التفاعل المتقاطع بين هذين البروتينين عبر انفصال الطور السائل-السائل (LLPS) غير متجانس النوع يمثل آلية محتملة لتسريع إمراضية مرض البريون، مما يقدم منظوراً جديداً حول كيفية تأثير البروتينات الالتهابية على تراكم البروتينات التنكسية العصبية.