Diagnostic accuracy of Truenat® MPX assay in comparison to Non-variola Orthopoxvirus RT PCR for diagnosis of mpox disease in Uganda
Cette étude transversale de laboratoire menée en Ouganda démontre que l'essai Truenat MPX présente une grande précision diagnostique, avec une sensibilité de 96 % et une spécificité de 99 %, pour la détection de la variole du singe par rapport à la RT-PCR pour orthopoxvirus non variola, validant ainsi son aptitude en tant qu'outil de diagnostic rapide et de faible complexité pour les milieux à ressources limitées.
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Dans le monde des maladies infectieuses, certains agents pathogènes sont si étroitement liés qu'ils se ressemblent presque de manière identique sous un microscope, et pourtant ils nécessitent des réponses différentes de la part des médecins et des responsables de la santé publique. L'un de ces groupes est celui des orthopoxvirus, une famille de virus qui comprend le virus de la variole, qui a été éradiqué il y a des décennies, et le virus de la variole du singe, qui provoque une maladie connue sous le nom de mpox. Bien que la variole ait disparu, le mpox a réémergé comme une menace sanitaire mondiale significative, se propageant des réservoirs animaux vers les humains et provoquant des épidémies sur plusieurs continents. Pour stopper ces épidémies, les travailleurs de la santé doivent savoir rapidement et avec précision si un patient est atteint du mpox ou d'un virus différent, moins dangereux. Cela nécessite un test de diagnostic capable de les distinguer avec une grande précision. Cependant, les tests les plus précis nécessitent souvent des équipements coûteux et des scientifiques hautement qualifiés travaillant dans de grands laboratoires centraux. Dans de nombreuses parties du monde, en particulier dans les régions où le mpox est le plus répandu, les patients ne peuvent pas attendre que les échantillons voyagent jusqu'à ces installations lointaines. Le défi consiste donc à trouver un moyen d'effectuer ces tests sophistiqués plus près du patient, en utilisant des machines plus simples qui sont déjà disponibles dans les cliniques locales, sans perdre la précision nécessaire pour prendre des décisions médicales de vie ou de mort.
Une équipe de chercheurs en Ouganda s'est donné pour mission de résoudre ce problème en testant un nouvel outil conçu précisément à cet effet. Ils ont évalué un test appelé l'essai Truenat MPX, un test moléculaire capable de détecter le matériel génétique du virus mpox. L'objectif était de voir si ce test pouvait être aussi performant que l'étalon-or actuel utilisé dans leur pays, un test de laboratoire complexe connu sous le nom de RT-PCR Non-variola Orthopoxvirus, qui est très précis mais nécessite un cadre de laboratoire sophistiqué. Les chercheurs ont recueilli des échantillons auprès de 150 personnes suspectées d'être atteintes du mpox. Ces échantillons provenaient de lésions cutanées, de l'arrière de la gorge et de la bouche, collectés auprès de patients de quatre régions différentes du pays. L'équipe a testé chaque échantillon deux fois : une fois avec la méthode de laboratoire standard de haute technologie et une fois avec le nouveau dispositif plus simple, le Truenat.
Les résultats ont montré que le nouveau test fonctionne remarquablement bien. Comparé à la méthode de laboratoire standard, l'essai Truenat MPX a correctement identifié la quasi-totalité des personnes qui étaient réellement porteuses du virus. Sur les 49 personnes confirmées atteintes du mpox par le test standard, le nouveau dispositif en a correctement signalées 47 comme étant positives. Cela signifie que le test a manqué très peu de cas. Plus important encore, le test a été extrêmement efficace pour exclure la maladie chez les personnes qui ne l'avaient pas. Sur les 101 personnes confirmées indemnes du virus par la méthode standard, le dispositif Truenat les a correctement identifiées comme négatives dans 100 cas. Dans les rares cas où les deux tests étaient en désaccord, les chercheurs ont retesté les échantillons et ont constaté que le test de laboratoire standard était généralement celui qui avait changé d'avis, suggérant que le nouveau dispositif était souvent le plus fiable des deux dans ces cas limites spécifiques. Le test a également produit très peu d'erreurs ou de résultats invalides, avec seulement deux échantillons sur les 150 n'ayant pas donné de réponse claire, un taux considéré comme acceptable pour les tests médicaux.
Ce qui rend cette découverte particulièrement significative, c'est que le nouveau test a atteint ce niveau de précision tout en étant beaucoup plus simple à utiliser. Le dispositif Truenat est une petite machine portable qui peut être installée dans une clinique ou un laboratoire de terrain, plutôt que dans une installation centrale massive. Il peut traiter les échantillons rapidement et fonctionne avec les mêmes types de écouvillons et de raclages cutanés que les médecins utilisent déjà. Les chercheurs ont noté que le test est capable non seulement de détecter le virus, mais aussi de le distinguer d'autres virus similaires de la même famille, ce qui est crucial pour garantir que les patients reçoivent les soins appropriés. En prouvant que cet outil plus simple peut égaler la performance du complexe standard de laboratoire, l'étude suggère que les systèmes de santé peuvent désormais apporter une puissance de diagnostic de haute qualité directement aux communautés qui en ont le plus besoin. Cette approche permet une identification plus rapide des cas, ce qui est essentiel pour stopper la propagation du virus et prévenir les maladies graves, le tout sans nécessiter l'infrastructure massive qui a historiquement limité les tests dans les contextes à ressources limitées.
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