Metataxonomic analysis of rectal samples of synanthropic bats from Montes Claros, Brazil

蝙蝠是地球上最成功的哺乳动物之一，拥有近 1,500 个物种，繁衍于从深林到繁华都市的各种环境中。它们飞行的能力使其能够进行长距离迁徙，许多物种也已适应了与人类共存，在建筑物中寻找庇护所，并在城市废弃物中寻找食物。这种紧密的邻近关系创造了一个独特的生物交汇点，即动物与人类共享相同的空间。正因如此，科学家们对生活在这些动物体内的微观生命产生了浓厚的兴趣。肠道微生物组——即居住在动物消化道内的庞大细菌及其他微生物群落——构成了一个复杂的生态系统。它不仅影响宿主动物的健康，还可能成为可能向人类或其他物种传播病原体的储库。了解这些蝙蝠体内生存着什么，不仅仅是为了记录自然；它是追踪在野生动物与人类之间移动的疾病这一复杂谜题中的关键一环。

在巴西北部的蒙特斯克拉罗斯市（Montes Claros），一支研究团队着手探索这八种不同蝙蝠体内的隐藏世界。这些动物包括食果类、食虫类和食蜜类，代表了当地野生动物的一个横截面。科学家们通过轻轻擦拭 44 只捕捉到的蝙蝠的直肠区域来采集样本。这种方法使他们能够在不伤害这些生物的情况下，收集来自其肠道内细菌的遗传物质。随后，他们使用了一种强大的基因测序技术来读取这些微生物的 DNA。研究人员并没有尝试在实验室中培养这些细菌，因为许多细菌无法在宿主体外生存，这种尝试往往会失败；相反，他们寻找的是作为每种微生物“条形码”的特定遗传标记。这种方法让他们能够精确识别出存在哪些细菌类群以及它们的丰度如何。

分析结果揭示了一个丰富且多样化的细菌群落。最常见的类群属于三大主要的微生物科：厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）和放线菌门（Actinobacteria）。这些类群构成了样本中绝大部分的细菌生命。在这多样化的混合物中，研究人员识别出了 319 种不同的细菌。其中，他们发现了 34 种已知对人类和动物具有潜在危害的类型。其中一些非常常见，例如在几乎每种被研究的蝙蝠物种中都发现的葡萄球菌属（Staphylococcus）和肠球菌属（Enterococcus）。另一些如沙门氏菌属（Salmonella）、巴通体菌属（Bartonella）和布鲁氏菌属（Brucella）虽然数量较少，但仍被检测到了。这些特定细菌的存在表明，这些蝙蝠携带了一系列如果传播给人类或牲畜可能会带来风险的病原体。

研究还强调，细菌群落因蝙蝠的不同而表现出显著差异。有些动物拥有的不同细菌类型非常多，而有些则较少。这种差异存在于不同物种之间，甚至存在于同一种类的不同个体之间。这项研究首次详细展示了四种特定蝙蝠物种的肠道细菌情况，而这些物种此前从未以这种方式被研究过，它们分别是：Sturnira lilium、Artibeus geoffroyi、Glossophaga soricina 和 Myotis nigricans。通过绘制这些微生物群落的图谱，研究人员为该地区这些动物的常态建立了一个基准。

研究结果强调了通过连接动物、人类和环境的视角来看待野生动物健康的必要性。本研究中的蝙蝠不仅仅是细菌的携带者；它们是更大生态网络的一部分。这些动物生活在城市区域并与人类空间互动，这一事实意味着它们携带的微生物可能会产生现实世界的后果。这项研究并不声称这些蝙蝠目前正在引发疫情，但它确实证实了它们携带了多样化的细菌，其中包括一些具有致病潜力的细菌。了解这些知识有助于公共卫生官员和自然保护人士理解与这些生物共存带来的风险与益处。通过了解这些动物体内的情况，社会可以在继续保护蝙蝠在授粉植物和控制昆虫数量方面的至关重要作用的同时，更好地应对潜在的健康威胁。