Infectious disease outbreaks among hospitalised neonates in low- and middle-income countries: a systematic review.
Cette revue systématique de 172 épidémies néonatales à travers 32 pays à revenu faible et intermédiaire révèle que les espèces de *Klebsiella* multirésistantes sont les agents pathogènes prédominants, mettant en évidence des lacunes critiques dans les données sur la résistance aux antimicrobiens, l'utilisation du séquençage du génome entier et l'identification de la source des épidémies qui nécessitent un investissement coordonné et une normalisation des rapports pour améliorer le contrôle des infections.
Article original sous licence CC BY 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/). Ceci est une explication générée par l'IA d'un preprint qui n'a pas été évalué par des pairs. Ce n'est pas un avis médical. Ne prenez pas de décisions de santé basées sur ce contenu. Lire la clause de non-responsabilité complète
Dans les hôpitaux du monde entier, les plus petits patients font face à une vulnérabilité unique et terrifiante. Les nouveau-nés, particulièrement ceux nés prématurément ou malades, passent leurs premiers jours dans des unités spécialisées où ils sont entourés de machines de survie et de soins constants. Pourtant, ces environnements mêmes peuvent parfois devenir des foyers d'infections dangereuses. Lorsque les bactéries ou les champignons se propagent rapidement parmi ces nourrissons fragiles, on appelle cela une épidémie. Ces événements ne sont pas seulement une question de quelques bébés malades ; ils représentent une rupture des barrières invisibles qui maintiennent les agents pathogènes à distance. Le défi est accentué dans les pays à revenu faible et intermédiaire, où les ressources sont souvent limitées, et où la capacité d'identifier exactement quel germe cause la maladie, ou comment il passe d'un bébé à un autre, peut être sévèrement restreinte. Sans cette connaissance, les médecins sont contraints de deviner les traitements, utilisant souvent des antibiotques puissants auxquels les germes ont appris à résister, laissant aux nourrissons moins d'options pour survivre.
Une équipe de chercheurs s'est donné pour mission de cartographier le paysage de ces crises en examinant chaque rapport publié sur de telles épidémies dans les pays à revenu faible et intermédiaire au cours de la dernière décennie. Ils ont recueilli des données provenant de 129 études différentes, couvrant 172 épidémies distinctes dans 32 nations. Leur objectif était de comprendre la nature des ennemis auxquels ces bébés font face, comment ces germes luttent contre la médecine, et si des outils modernes pourraient aider à suivre la propagation. Ce qu'ils ont découvert est le portrait d'une lutte dominée par un type spécifique de bactérie qui est devenue remarquablement difficile à traiter. Le coupable le plus courant était un groupe de bactéries connues sous le nom de Klebsiella, qui était responsable de plus d'un tiers de toutes les épidémies étudiées. Ces germes ne sont pas seulement présents ; ils sont souvent armés de défenses qui rendent inutiles les antibiotiques les plus efficaces. Dans de nombreuses épidémies impliquant Klebsiella, les bactéries étaient résistantes aux céphalosporines de troisième génération, une classe courante d'antibiotiques, et dans un nombre important de cas, elles étaient également résistantes aux carbapénèmes, qui sont souvent considérés comme la dernière ligne de défense contre les infections bactériennes.
La résistance ne se limitait pas à un seul type de médicament. Les chercheurs ont découvert que ces bactéries étaient fréquemment résistantes à plusieurs classes de médicaments à la fois, un état connu sous le nom de multirésistance. Cela signifie que lorsqu'une épidémie survient, l'équipe médicale constate souvent que les traitements standards ne fonctionnent tout simplement pas. Le problème s'étend au-delà des bactéries ; les champignons, spécifiquement un groupe appelé Candida, étaient la deuxième cause la plus fréquente d'épidémies. Ces infections fongiques montraient également des signes de résistance aux médicaments utilisés pour les traiter. L'étude a révélé que les bactéries n'apparaissaient pas de manière aléatoire ; elles se propageaient d'un patient à l'autre au sein de l'hôpital. Dans les épidémies où les scientifiques ont utilisé des tests génétiques avancés pour examiner l'ADN des germes, ils ont constaté que les bactéries infectant différents bébés étaient génétiquement identiques ou presque identiques. Cela a confirmé que les infections n'étaient pas des incidents séparés, mais une chaîne de transmission unique circulant dans le service.
Malgré l'évidence de la propagation, les chercheurs ont constaté que la capacité de localiser précisément la provenance des germes était étonnamment faible. Dans seulement un quart des épidémies où une recherche de la source a été menée, l'équipe a réussi à identifier l'origine. Lorsqu'ils trouvaient une source, elle était le plus souvent liée à l'eau. Les éviers, l'eau stockée utilisée pour les humidificateurs et l'eau dans les incubateurs étaient des coupables fréquents. L'eau dans ces systèmes peut devenir un réservoir caché pour les bactéries, qui se propagent ensuite vers les bébés par les mains des professionnels de santé ou l'équipement utilisé pour les soins. D'autres sources comprenaient des médicaments et des fluides contaminés, souvent liés à la manière dont ils étaient préparés ou stockés. L'étude a souligné que, bien que les hôpitaux prenaient souvent des mesures pour arrêter les épidémies, comme nettoyer plus soigneusement les surfaces ou isoler les bébés malades, ces mesures étaient souvent réactives plutôt que préventives.
Les chercheurs ont également examiné la qualité de la signalisation de ces épidémies dans la littérature scientifique et ont trouvé des lacunes importantes. De nombreux rapports manquaient de détails cruciaux, tels que la manière dont l'épidémie a été définie, les méthodes spécifiques utilisées pour tester les bactéries, ou les caractéristiques exactes des bébés concernés. Ce manque de détails rend difficile la comparaison des épidémies entre différents pays ou l'apprentissage des erreurs passées. De plus, bien qu'un outil puissant appelé séquençage du génome complet, qui lit l'intégralité du code génétique d'un germe pour suivre son mouvement, ait été utilisé dans environ un quart des études, il était souvent réalisé dans des pays à revenu élevé plutôt que là où les épidémies se produisaient. Cette dépendance vis-à-vis de laboratoires distants peut retarder la réponse à une épidémie. Les auteurs suggèrent que pour véritablement protéger les nouveau-nés, il doit y avoir un effort coordonné pour renforcer la capacité locale de test, améliorer l'infrastructure des unités néonatales et adopter des méthodes standard de signalement de ces événements. Sans ces changements, le cycle des épidémies et de la résistance est susceptible de continuer, laissant les patients les plus vulnérables en danger.
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