Evidence of rat hepatitis E virus across human and swine populations in Nigeria
Cette étude fournit la première preuve d'une exposition humaine au virus de l'hépatite E du rat (ratHEV) et de sa détection moléculaire chez le porc domestique au Nigéria, révélant une association significative entre le contact avec le bétail et la séropositivité humaine, et identifiant des souches dérivées du porc étroitement liées à celles trouvées chez les rongeurs et dans un cas humain en Afrique de l'Ouest et en Europe.
Article original sous licence CC BY 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/). Ceci est une explication générée par l'IA d'un preprint qui n'a pas été évalué par des pairs. Ce n'est pas un avis médical. Ne prenez pas de décisions de santé basées sur ce contenu. Lire la clause de non-responsabilité complète
Les virus qui passent des animaux aux humains sont une caractéristique constante de notre monde, se cachant souvent dans le corps de créatures sauvages avant de trouver un chemin vers nos communautés. Un tel virus, connu sous le nom d'hépatite E de type rat, est récemment apparu comme une préoccupation sanitaire majeure. Bien que les rats soient son habitat principal, il a été démontré que ce virus provoque une inflammation du foie et des maladies chez l'homme, particulièrement chez les personnes dont le système immunitaire est affaibli. Les scientifiques soupçonnent depuis longtemps que le virus pourrait voyager à travers l'environnement, contaminant peut-être l'eau ou la nourriture, et qu'il pourrait également infecter des animaux d'élevage comme les porcs, qui pourraient agir comme un pont entre les rongeurs sauvages et les humains. Cependant, en Afrique, où l'interaction entre les populations, le bétail et la faune sauvage est intense, l'histoire de ce virus est restée largement mystérieuse. Nous savions qu'il existait dans les rats de la région et dans ses eaux usées, mais nous n'avions aucune preuve qu'il avait atteint les populations vivant là-bas ou les animaux domestiques qu'elles élevaient.
Pour résoudre cette énigme, une équipe de chercheurs s'est rendue dans le sud-ouest du Nigeria pour rechercher le virus dans trois groupes distincts : des personnes travaillant étroitement avec des animaux d'élevage, des personnes vivant dans des villages ruraux sans ce type de travail, et des étudiants universitaires. Ils ont également collecté des échantillons auprès de centaines de porcs dans la même zone. L'objectif était simple mais crucial : voir si le virus circulait parmi les humains et les porcs domestiques, et si oui, à quelle fréquence. L'équipe a testé des échantillons de sang de 527 personnes pour déceler des signes que leur système immunitaire avait déjà combattu le virus. Simultanément, ils ont examiné des échantillons de fèces de 544 porcs pour voir si le virus était activement excrété par les animaux. Cette approche leur a permis de cartographier la présence du virus à travers les populations humaines et animales dans un environnement unique et partagé.
Les résultats ont révélé que le virus est effectivement présent dans la population humaine, bien qu'il ne soit pas répandu. Sur les 527 personnes testées, 15 présentaient des signes d'une infection passée. Cela signifie qu'environ 3 % du groupe avait été exposé. Le risque n'était pas réparti uniformément ; les personnes travaillant régulièrement avec le bétail étaient nettement plus susceptibles d'avoir été infectées que celles vivant dans des villages ruraux ou les étudiants. En fait, les travailleurs étaient environ cinq fois plus susceptibles de présenter des signes d'exposition que les villageois. Cette découverte suggère que l'environnement quotidien de l'élevage, où la nourriture et l'abri peuvent attirer les rats sauvages, crée une zone spécifique où les humains sont plus susceptibles de rencontrer le virus, peut-être par la poussière ou des surfaces contaminées plutôt que par un contact direct avec les rongeurs eux-mêmes.
Bien que le virus ait été trouvé dans le sang de certaines personnes, les chercheurs n'ont trouvé aucun virus lui-même dans les échantillons de sang humain testés. Cela indique que, bien que des personnes aient été exposées par le passé, elles n'excrétaient pas activement le virus dans leur flux sanguin au moment de l'étude. Cependant, l'histoire était différente pour les porcs. L'équipe a trouvé du matériel génétique viral actif dans les fèces de quatre porcs sur 544. C'est une découverte cruciale car elle prouve que les porcs domestiques au Nigeria peuvent attraper le virus de l'environnement et le porter. Le code génétique du virus trouvé dans ces porcs correspondait étroitement à des souches précédemment trouvées dans des rats en Sierra Leone et dans un cas humain en France, confirmant qu'il s'agit de la même famille de virus circulant en Afrique de l'Ouest.
L'étude ne prouve pas exactement comment le virus passe des rats aux porcs ou des porcs aux humains, ni ne confirme que les porcs sont la source principale d'infection humaine. Il est possible que les humains et les porcs contractent tous deux le virus directement à partir du même environnement contaminé. Ce que la recherche établit, c'est que le virus n'est pas confiné aux rats sauvages ou à l'approvisionnement en eau ; il est entré dans la population du bétail domestique et a laissé une trace dans la population humaine. Cette découverte élargit notre compréhension de la façon dont le virus vit en Afrique, montrant que la connexion entre les animaux sauvages, les animaux d'élevage et les humains est un véritable chemin pour la maladie. Cela suggère que pour comprendre et suivre pleinement ce virus, les responsables de la santé doivent examiner l'écosystème entier, des rongeurs dans les champs aux porcs dans la ferme et aux personnes qui travaillent avec eux.
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