Lessons learned from implementing OMOP CDM in Japanese oncology
本研究表明，尽管在标准化手术程序和测量数据方面存在微小挑战，但将日本肿瘤电子病历数据转换为 OMOP CDM 格式以进行大规模国际观察性研究具有高度可行性。
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在现代医学的广阔版图中，一场无声的革命并非发生在手术室，而是在医院的数字档案库中。几十年来，医生一直依赖临床试验来证明一种新药是否有效，但这些试验通常涉及在受控环境下经过严格筛选的患者，而这种环境并不总能反映日常生活的复杂现实。为了了解治疗方案在普通人群中的真实表现，研究人员需要研究“真实世界数据”——即人们就医、接受诊断和服用药物时每天产生的数百万条记录。挑战在于，每家医院记录信息的方式都各不相同，使用着各自独特的代码和格式，这使得将不同地方的数据结合起来以观察大局变得几乎不可能。为了解决这个问题，全球研究界开发了一种名为 OMOP 通用数据模型的医疗信息“通用翻译机”。你可以把它想象成一种标准语言，它允许东京的一家医院直接与纽约的一家医院对话，将它们特定的记录翻译成共享格式，以便进行统一分析。这种方法有望加速有效疗法的发现并提升全球范围内的患者护理水平，但这需要投入巨大的、精准的努力，将本地记录转换为这一新标准。
日本国立癌症研究中心东医院的一支研究团队着手测试这种转换过程是否适用于复杂的日本肿瘤学领域。他们重点研究了 2015 年至 2022 年间接受乳腺癌治疗的近 8,400 名患者的电子病历。他们的目标不是治疗患者或发现新疗法，而是观察其医院现有的数字记录是否可以成功转化为 OMOP 格式，并利用专门的质量仪表盘进行准确性检查。这是一项至关重要的测试，因为虽然其他国家已经成功建立了此类数据的庞大网络，但日本尚未证明其特定的医疗记录可以被转换并用于国际研究。团队提取了包含患者病史、实验室结果和治疗细节的原始文本文件，并开始执行将每一个术语映射到全球标准的艰巨任务。他们必须确保日本针对特定癌症类型的诊断代码能够匹配正确的国际概念，并且在东京开具的药物在欧洲或美国也被识别为同一种物质。
这次转换的结果在很大程度上是令人鼓舞的。研究人员发现，他们可以成功地将包括诊断、实验室检查和药物处方在内的主要护理领域的临床信息标准化，覆盖率超过 80%。他们处理了数百万个独立数据点，将超过 3,900 万条实验室检测结果和近 30 万份处方转换为新格式。这证明了日本系统有能力加入全球观察性研究网络。然而，这一过程并非没有障碍。团队发现，外科手术是最难转换的领域；虽然他们可以映射大多数其他数据，但其系统中使用的特定手术术语与国际标准对齐程度较低，导致该部分数据并不完整。此外，他们还遇到了记录缺失的问题，例如某些检查缺乏日期，或者血压等生命体征的测量单位不明确，这些问题必须通过人工处理或剔除。
为了确保转换后的数据值得信赖，研究人员运行了近 2,000 次自动化检查，以验证其有效性和完整性。仅有 24 项检查标记了错误或失败，这一极小的比例表明转换后数据集的整体质量很高。出现的少数错误大多与特定表格中的信息缺失有关，例如关于患者死亡或药物剂量的细节，团队认为这些问题可以通过优化转换软件或改进原始记录来解决。研究还强调了一个文化和行政层面的障碍：日本政府使用一套自己的标准医疗代码，这些代码尚未与 OMOP 系统使用的国际词汇挂钩。这意味着每当一家日本医院想要加入这个全球网络时，都必须手动在他们的本地代码与国际代码之间建立一座桥梁，这是一项耗时且需要大量人力投入的任务。
最终，这项研究证明了日本的医疗记录可以转化为一种可以与世界其他地区数据进行对比分析的格式。它证实了现有的基础设施足以支持利用来自日本的真实世界数据开展大规模国际癌症治疗有效性研究。然而，未来的道路不仅需要技术上的转换，更需要协调一致的努力，将日本的医疗术语与全球标准相连接，从而使转换过程变得更加顺畅且减少对人工操作的依赖。随着更多日本医院采用这些方法，以及政府推动全国医疗数据标准化的举措推进，日本为全球癌症治疗理解做出贡献的潜力正变得愈发强大。此项工作提供了一个蓝图，表明虽然通往统一全球医疗数据库的旅程非常复杂，但这是完全可能的，它为未来可能造福全球患者的研究铺平了道路。
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