Lessons learned from implementing OMOP CDM in Japanese oncology​

En el vasto paisaje de la medicina moderna, una revolución silenciosa está teniendo lugar, no en el quirófano, sino en los archivos digitales de los hospitales. Durante décadas, los médicos han dependido de los ensayos clínicos para demostrar que un nuevo fármaco funciona, pero estos ensayos suelen involucrar a pacientes cuidadosamente seleccionados en entornos controlados que no siempre reflejan la realidad desordenada de la vida cotidiana. Para comprender cómo funcionan realmente los tratamientos para la población general, los investigadores necesitan estudiar los "datos del mundo real": los millones de registros generados cada día a medida que las personas visitan a los médicos, reciben diagnósticos y toman medicamentos. El desafío siempre ha sido que cada hospital registra esta información de manera diferente, utilizando sus propios códigos y formatos únicos, lo que hace casi imposible combinar datos de diferentes lugares para ver el panorama general. Para resolver esto, la comunidad investigadora mundial desarrolló un traductor universal para la información médica llamado el Modelo de Datos Comunes OMOP. Piense en ello como un lenguaje estándar que permite que un hospital en Tokio hable directamente con un hospital en Nueva York, traduciendo sus registros específicos a un formato compartido para que puedan ser analizados conjuntamente. Este enfoque promete acelerar el descubrimiento de tratamientos efectivos y mejorar la atención al paciente a escala global, pero requiere un esfuerzo masivo y preciso para convertir los registros locales a este nuevo estándar.

Un equipo de investigadores del Hospital del Centro Nacional del Cáncer del Este en Japón se propuso probar si este proceso de traducción podría funcionar para el complejo mundo de la oncología japonesa. Se centraron en las historias clínicas electrónicas de casi 8.400 pacientes tratados por cáncer de mama entre 2015 y 2022. Su objetivo no era tratar pacientes ni descubrir una nueva cura, sino ver si los registros digitales existentes de su hospital podían transformarse con éxito al formato OMOP y luego verificarse su exactitud mediante un panel de control de calidad especializado. Esta era una prueba crítica porque, si bien otros países han construido con éxito grandes redes de tales datos, Japón aún no había demostrado que sus registros médicos específicos pudieran convertirse y utilizarse para la investigación internacional. El equipo tomó los archivos de texto bruto que contenían historiales de pacientes, resultados de laboratorio y detalles de tratamiento y comenzó la ardua tarea de mapear cada término individual al estándar global. Tuvieron que asegurarse de que un código de diagnóstico japonés para un tipo específico de cáncer coincidiera con el concepto internacional correcto, y que un fármaco recetado en Tokio fuera reconocido como la misma sustancia utilizada en Europa o Estados Unidos.

Los resultados de esta conversión fueron en gran medida alentadores. Los investigadores descubrieron que podían estandarizar con éxito más del 80 por ciento de la información clínica en las principales áreas de la atención al paciente, incluyendo diagnósticos, pruebas de laboratorio y prescripciones de medicamentos. Procesaron millones de puntos de datos individuales, convirtiendo más de 39 millones de resultados de pruebas de laboratorio y cerca de 300.000 prescripciones al nuevo formato. Esto demostró que el sistema japonés es capaz de unirse a la red global de investigación observacional. Sin embargo, el proceso no estuvo exento de obstáculos. El equipo descubrió que los procedimientos quirúrgicos eran el área más difícil de traducir; aunque pudieron mapear la mayoría de los otros datos, los términos específicos utilizados para las cirugías en su sistema no se alineaban bien con los estándares internacionales, dejando esa parte de los datos incompleta. Además, encontraron lagunas en los registros, como fechas faltantes para ciertas pruebas o unidades de medida poco claras para signos vitales como la presión arterial, que tuvieron que abordarse manualmente o excluirse.

Para asegurar que los datos convertidos fueran confiables, los investigadores ejecutaron casi 2.000 comprobaciones automatizadas para verificar su validez y completitud. Solo 24 de estas comprobaciones señalaron un error o un fallo, una fracción muy pequeña que sugiere que la calidad general del conjunto de datos convertido es alta. Los pocos errores que aparecieron se relacionaron principalmente con información faltante en tablas específicas, como detalles sobre muertes de pacientes o dosis de fármacos, problemas que el equipo identificó como cuestiones que podrían solucionarse refinando su software de conversión o mejorando los registros de origen. El estudio también destacó una barrera cultural y administrativa significativa: el gobierno japonés utiliza su propio conjunto de códigos médicos estándar que aún no están vinculados al vocabulario internacional utilizado por el sistema OMOP. Esto significa que cada vez que un hospital japonés quiera unirse a esta red global, debe crear manualmente un puente entre sus códigos locales y los internacionales, una tarea que consume mucho tiempo y requiere un esfuerzo humano significativo.

En última instancia, este estudio demuestra que los registros médicos japoneses pueden transformarse en un formato que permita analizarlos junto con los datos del resto del mundo. Confirma que existe la infraestructura para apoyar estudios internacionales a gran escala sobre la efectividad del tratamiento del cáncer utilizando datos del mundo real de Japón. Sin embargo, el camino a seguir requiere más que una conversión técnica; demanda un esfuerzo coordinado para vincular la terminología médica japonesa con los estándares globales, de modo que el proceso de traducción sea más fluido y dependa menos del trabajo manual. A medida que más hospitales en Japón adopten estos métodos y a medida que las iniciativas gubernamentales avancen hacia la estandarización de los datos médicos a nivel nacional, el potencial de Japón para contribuir a la comprensión global del tratamiento del cáncer se fortalece. El trabajo realizado aquí sirve como un plano, mostrando que, si bien el viaje hacia una base de datos médica global unificada es complejo, es enteramente posible, allanando el camino para futuras investigaciones que podrían beneficiar a pacientes en todas partes.